MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 10977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022226	TAC	2	6	135320	135325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022226	ATT	2	6	135337	135342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022226	AAT	2	6	135371	135376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022226	TAAT	2	8	135389	135396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022226	AT	3	6	135414	135419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022226	TA	5	10	135426	135435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022226	GA	3	6	140473	140478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022226	AG	3	6	144466	144471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022226	TAAA	2	8	149514	149521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022226	A	6	6	152044	152049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022226	AT	3	6	152101	152106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022226	A	6	6	152826	152831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022226	GTT	2	6	152932	152937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022226	ATT	2	6	152940	152945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022226	AAC	2	6	152982	152987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_022226	ATT	2	6	153005	153010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022226	TAT	2	6	153017	153022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022226	TAT	2	6	153028	153033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022226	ATT	2	6	153076	153081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022226	ACG	2	6	153095	153100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_022226	ATT	2	6	153134	153139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022226	TA	3	6	153161	153166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022226	ATT	2	6	153191	153196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022226	ATG	2	6	153201	153206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022226	TAT	2	6	153219	153224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022226	GA	3	6	153240	153245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022226	AATA	2	8	154738	154745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022226	GTT	2	6	154803	154808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022226	CAAAA	2	10	154820	154829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
530	NC_022226	TA	3	6	154830	154835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022226	ATA	2	6	154873	154878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022226	ATC	2	6	154904	154909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_022226	T	7	7	154917	154923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022226	TAT	2	6	154948	154953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022226	GTT	2	6	154963	154968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022226	ATTA	2	8	154970	154977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022226	GTTT	2	8	155018	155025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022226	T	6	6	155059	155064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022226	T	6	6	155100	155105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022226	TAAC	2	8	155118	155125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_022226	AAT	2	6	155128	155133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022226	ATT	2	6	155141	155146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022226	TAAAG	2	10	155169	155178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022226	GAA	2	6	155257	155262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022226	AAAT	2	8	156526	156533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022226	TCCCAC	2	12	156555	156566	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_022226	GTTT	2	8	156567	156574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022226	TA	4	8	156796	156803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022226	TTTA	2	8	156806	156813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022226	AT	3	6	156849	156854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022226	A	7	7	156880	156886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022226	T	6	6	156928	156933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022226	AGG	2	6	156947	156952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022226	TTA	2	6	156955	156960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022226	ACA	2	6	157478	157483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022226	TGA	2	6	157487	157492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022226	AT	3	6	157494	157499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022226	TA	3	6	157501	157506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022226	AGT	2	6	157563	157568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022226	GAA	2	6	157575	157580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022226	TAG	2	6	157632	157637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022226	CGT	2	6	157655	157660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022226	ATC	2	6	157707	157712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022226	TAG	2	6	157789	157794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022226	T	6	6	161357	161362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022226	TTG	2	6	161375	161380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022226	T	6	6	161386	161391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022226	ATA	2	6	161395	161400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022226	TAA	4	12	161470	161481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022226	TAA	2	6	161503	161508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022226	CTT	2	6	161541	161546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022226	AAG	2	6	161553	161558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022226	TA	3	6	163156	163161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022226	ACT	2	6	163178	163183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022226	TGT	2	6	163186	163191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022226	AGT	2	6	163201	163206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022226	T	7	7	163206	163212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022226	ATT	2	6	163291	163296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022226	TCAT	2	8	163305	163312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_022226	AAT	2	6	163317	163322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022226	AT	3	6	163321	163326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022226	T	8	8	163343	163350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022226	TTTG	2	8	163389	163396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022226	TAA	2	6	163444	163449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022226	TA	3	6	163457	163462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022226	GT	3	6	163470	163475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022226	AT	3	6	163476	163481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022226	TTA	2	6	163498	163503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022226	ATTT	2	8	164755	164762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022226	ATTT	2	8	164767	164774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022226	TTA	2	6	164834	164839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022226	GTT	2	6	164881	164886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022226	AAC	2	6	164921	164926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_022226	AAC	2	6	164952	164957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022226	GTA	2	6	164977	164982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022226	ATGT	2	8	164998	165005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022226	GAT	2	6	165037	165042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022226	AT	3	6	165065	165070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022226	TTAA	2	8	165119	165126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022226	TCG	2	6	165131	165136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_022226	TATCA	2	10	165139	165148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_022226	AGTA	2	8	165161	165168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022226	TAT	2	6	165174	165179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022226	T	7	7	173102	173108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022226	CAT	2	6	173140	173145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022226	AAGT	2	8	173166	173173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022226	ATA	2	6	173216	173221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022226	ACG	2	6	173229	173234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_022226	ATCAT	2	10	173271	173280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
610	NC_022226	TAA	2	6	173287	173292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022226	ATCA	2	8	173305	173312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_022226	GAT	2	6	173325	173330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022226	CTC	2	6	173864	173869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_022226	AAT	2	6	173904	173909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022226	TGA	2	6	173944	173949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022226	TTA	2	6	173966	173971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022226	T	6	6	173973	173978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022226	TAAA	2	8	174030	174037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022226	ATC	2	6	174068	174073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022226	ACC	2	6	174882	174887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_022226	CCT	2	6	177181	177186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_022226	AT	3	6	177192	177197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022226	ATTAAT	2	12	178431	178442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022226	AT	3	6	178441	178446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022226	GTT	2	6	178451	178456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022226	TAA	2	6	178481	178486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022226	T	6	6	178543	178548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022226	ATGT	2	8	178565	178572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022226	GTA	2	6	178591	178596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022226	A	6	6	178602	178607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022226	TTAA	2	8	180045	180052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022226	ATA	2	6	180054	180059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022226	AATA	2	8	180095	180102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022226	T	6	6	180108	180113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022226	GAAT	2	8	180124	180131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022226	T	6	6	180136	180141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022226	GTA	2	6	180144	180149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022226	AGG	2	6	180199	180204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022226	TAA	2	6	180863	180868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022226	A	7	7	182547	182553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022226	TGT	2	6	182624	182629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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785	NC_022226	TA	3	6	240248	240253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
786	NC_022226	TAA	2	6	240281	240286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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789	NC_022226	CAA	2	6	241941	241946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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791	NC_022226	AATT	2	8	242013	242020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
792	NC_022226	GTA	2	6	242021	242026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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794	NC_022226	AT	3	6	242093	242098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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833	NC_022226	A	6	6	248827	248832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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894	NC_022226	TAT	2	6	275282	275287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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913	NC_022226	AAT	2	6	279062	279067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_022226	TA	3	6	280182	280187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
917	NC_022226	ATT	2	6	280192	280197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
918	NC_022226	TCA	2	6	280202	280207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
919	NC_022226	TGA	2	6	280224	280229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
920	NC_022226	GA	3	6	280299	280304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_022226	TTAA	2	8	280481	280488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_022226	A	6	6	293247	293252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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991	NC_022226	T	6	6	312972	312977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_022226	GAAAT	2	10	313218	313227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

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