MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 11015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022221	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022221	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022221	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022221	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_022221	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022221	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022221	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022221	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022221	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022221	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022221	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022221	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_022221	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022221	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022221	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022221	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022221	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022221	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022221	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022221	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022221	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022221	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022221	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022221	TTG	2	6	14836	14841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022221	TAT	2	6	14972	14977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022221	ATG	2	6	16003	16008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022221	CCT	2	6	16024	16029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022221	ATT	2	6	16057	16062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022221	ATT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022221	GTT	2	6	17706	17711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022221	GTT	2	6	17730	17735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022221	ATC	2	6	17759	17764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022221	GAT	2	6	17771	17776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022221	CCA	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_022221	TCA	2	6	20127	20132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022221	GCG	2	6	20214	20219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022221	AAC	2	6	20282	20287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022221	ATC	2	6	20288	20293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022221	TAA	2	6	20296	20301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022221	CTT	2	6	20315	20320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022221	AAC	2	6	20481	20486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022221	GAA	2	6	20749	20754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022221	GGC	2	6	20791	20796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022221	CCG	2	6	20805	20810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_022221	GCC	2	6	20828	20833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022221	GCT	2	6	20959	20964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022221	ATG	2	6	21072	21077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022221	GCC	2	6	21134	21139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_022221	TGA	2	6	21192	21197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022221	CAT	2	6	21323	21328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022221	GAT	2	6	21352	21357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022221	TAA	2	6	21358	21363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022221	CTG	2	6	21405	21410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022221	CGC	2	6	21516	21521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022221	CAG	2	6	21535	21540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022221	ATG	2	6	21621	21626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022221	GTT	2	6	21691	21696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022221	GGC	2	6	21779	21784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022221	GTT	2	6	21841	21846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022221	CGG	3	9	21865	21873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022221	AAG	2	6	21978	21983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022221	GCG	2	6	22032	22037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022221	TTA	2	6	22095	22100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022221	GGC	2	6	22111	22116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022221	GTA	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022221	GGC	3	9	22255	22263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022221	CGA	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022221	CGG	2	6	22422	22427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022221	TGC	2	6	22434	22439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022221	GCT	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022221	GGC	2	6	22682	22687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022221	AGA	2	6	22702	22707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022221	CGG	2	6	22744	22749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022221	GGT	2	6	22949	22954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022221	CTA	2	6	22956	22961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022221	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022221	TAT	2	6	23027	23032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022221	ATA	2	6	23053	23058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022221	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022221	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022221	ACA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022221	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022221	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022221	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022221	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022221	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022221	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022221	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022221	ATA	2	6	33133	33138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022221	CAT	2	6	33200	33205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022221	TAA	2	6	33254	33259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022221	GTG	2	6	33299	33304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022221	ATG	2	6	33326	33331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022221	TAG	2	6	34994	34999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022221	TTG	2	6	35042	35047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022221	AAT	2	6	35054	35059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022221	TAG	2	6	35151	35156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022221	ATT	2	6	35233	35238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022221	TTG	2	6	35252	35257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022221	TGT	2	6	35291	35296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022221	GCT	2	6	35298	35303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022221	TCA	2	6	38753	38758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022221	TGT	2	6	39566	39571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022221	AAG	2	6	39575	39580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022221	TGT	2	6	39671	39676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022221	TTA	2	6	39677	39682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022221	TGT	2	6	39716	39721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022221	AAT	2	6	39767	39772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022221	AAT	2	6	39979	39984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022221	GAA	2	6	40009	40014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022221	AAT	2	6	41624	41629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022221	GTA	2	6	42912	42917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022221	TGA	2	6	44201	44206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022221	GTT	2	6	44210	44215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022221	TGT	2	6	44331	44336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022221	AAT	2	6	44380	44385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022221	TGT	2	6	44468	44473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022221	CGC	2	6	44681	44686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022221	TCA	2	6	44702	44707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022221	CCG	2	6	44719	44724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022221	ACT	2	6	44935	44940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022221	ATG	2	6	44983	44988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022221	TTG	2	6	45062	45067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022221	CGA	2	6	45096	45101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022221	TAC	2	6	45163	45168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022221	ACG	2	6	45190	45195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022221	GTT	2	6	45291	45296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022221	TCA	2	6	45312	45317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022221	GAC	2	6	45388	45393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022221	AGG	2	6	45461	45466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022221	CGT	2	6	45513	45518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022221	AAT	2	6	45529	45534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022221	TGA	2	6	45588	45593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022221	CCG	2	6	45610	45615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022221	GTG	2	6	45643	45648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022221	CAG	2	6	45742	45747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022221	TGA	2	6	45786	45791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022221	GCT	2	6	45867	45872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022221	TAC	2	6	45937	45942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022221	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022221	TCA	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_022221	CAG	2	6	100479	100484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_022221	CGA	2	6	100522	100527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_022221	GGC	2	6	100550	100555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_022221	GGC	2	6	101079	101084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_022221	CAA	2	6	112583	112588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_022221	GGC	2	6	112806	112811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_022221	GAT	2	6	115178	115183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_022221	ATG	2	6	122035	122040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_022221	GGC	2	6	122931	122936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_022221	TAT	2	6	128083	128088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_022221	CAT	2	6	128277	128282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_022221	ATA	2	6	128333	128338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_022221	CTG	2	6	128340	128345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_022221	CGG	2	6	132089	132094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_022221	GGA	2	6	132135	132140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_022221	TCA	2	6	184240	184245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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