MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022221	AAT	2	6	632592	632597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_022221	TGAT	2	8	632630	632637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_022221	AC	3	6	635084	635089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_022221	T	6	6	646038	646043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_022221	ATTAA	2	10	646075	646084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_022221	GTC	2	6	646918	646923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_022221	ACC	2	6	647366	647371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_022221	TCA	2	6	647375	647380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_022221	T	6	6	647441	647446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_022221	ATG	2	6	647487	647492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_022221	TCG	2	6	648189	648194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_022221	TCC	2	6	648203	648208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_022221	TTC	2	6	648220	648225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_022221	TCA	2	6	648262	648267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_022221	ATC	2	6	649554	649559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_022221	T	6	6	649563	649568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_022221	T	6	6	649677	649682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_022221	GAA	2	6	651818	651823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_022221	TGTA	2	8	651859	651866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_022221	AGAT	2	8	651916	651923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_022221	CTG	2	6	652005	652010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_022221	CTG	2	6	652049	652054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_022221	TC	3	6	652063	652068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_022221	TGC	2	6	652069	652074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_022221	GCG	2	6	652130	652135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_022221	ATCT	2	8	652160	652167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_022221	GC	3	6	652227	652232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_022221	CGC	2	6	652254	652259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_022221	CTG	2	6	652271	652276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_022221	TGA	2	6	652375	652380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_022221	GCA	2	6	652387	652392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_022221	GAA	2	6	652412	652417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_022221	GCGA	2	8	652442	652449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_022221	AGA	2	6	652450	652455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_022221	TAT	2	6	652516	652521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_022221	GGT	2	6	652618	652623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_022221	GGC	2	6	652642	652647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_022221	ATTGGC	2	12	652736	652747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2539	NC_022221	GCA	2	6	652796	652801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_022221	GGC	2	6	652870	652875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_022221	GTT	2	6	652951	652956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_022221	GCG	2	6	652967	652972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_022221	CTG	2	6	652976	652981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_022221	CAT	2	6	652999	653004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_022221	ATTA	2	8	653011	653018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_022221	CAT	2	6	653066	653071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_022221	GGCCT	2	10	654101	654110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2548	NC_022221	TA	3	6	654120	654125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_022221	CAT	2	6	654146	654151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_022221	ATG	2	6	655230	655235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_022221	ATT	2	6	655245	655250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_022221	ATT	2	6	655260	655265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_022221	AT	3	6	655277	655282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_022221	TAT	3	9	655306	655314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_022221	ATT	3	9	655329	655337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_022221	AGG	2	6	655366	655371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_022221	CGT	2	6	655416	655421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_022221	AAT	2	6	655507	655512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_022221	T	6	6	659704	659709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_022221	AGC	2	6	659887	659892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_022221	GTT	2	6	659896	659901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_022221	GAAC	2	8	659903	659910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_022221	TAAA	2	8	659926	659933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_022221	GTT	2	6	662500	662505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_022221	TAAT	2	8	663395	663402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_022221	TGAGC	2	10	663500	663509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2567	NC_022221	GGC	2	6	666156	666161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_022221	GAAA	2	8	668549	668556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_022221	C	6	6	668562	668567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2570	NC_022221	TA	4	8	668613	668620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_022221	TAG	2	6	668661	668666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_022221	GGA	2	6	668757	668762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_022221	CAA	2	6	668766	668771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_022221	A	8	8	668777	668784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_022221	TTC	2	6	668808	668813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_022221	GAT	2	6	668836	668841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_022221	AGT	2	6	670623	670628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_022221	T	6	6	670701	670706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_022221	TGC	2	6	670736	670741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_022221	ATGA	2	8	670749	670756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_022221	TC	3	6	670758	670763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2582	NC_022221	TCT	2	6	670795	670800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_022221	TTC	2	6	670804	670809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_022221	ATT	2	6	670885	670890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_022221	T	8	8	670919	670926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_022221	T	7	7	670961	670967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_022221	TAT	2	6	671004	671009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_022221	TTC	2	6	671055	671060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_022221	ATC	2	6	671112	671117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_022221	GGCT	2	8	671145	671152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_022221	TTTA	2	8	671206	671213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_022221	CAG	2	6	671253	671258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_022221	TAA	2	6	671273	671278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_022221	TAAA	2	8	671311	671318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_022221	CTTT	2	8	671333	671340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_022221	CTTT	2	8	671370	671377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2597	NC_022221	GGC	2	6	671396	671401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_022221	GGC	2	6	671408	671413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_022221	ACT	2	6	671416	671421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_022221	TGG	2	6	671523	671528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_022221	TGC	2	6	671567	671572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_022221	TGA	2	6	671605	671610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_022221	ATT	2	6	671711	671716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_022221	TTA	2	6	671749	671754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_022221	TAA	2	6	671786	671791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_022221	A	6	6	671901	671906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_022221	A	6	6	671908	671913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_022221	CAA	2	6	671916	671921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_022221	TGT	2	6	671927	671932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_022221	A	8	8	671998	672005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_022221	ATC	2	6	672125	672130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_022221	G	6	6	672220	672225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_022221	T	6	6	672234	672239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_022221	G	6	6	672375	672380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_022221	GGC	2	6	672421	672426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_022221	ATG	2	6	672449	672454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_022221	ATCG	2	8	672478	672485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2618	NC_022221	GAT	2	6	672601	672606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_022221	TTCTC	2	10	672630	672639	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2620	NC_022221	GTATC	2	10	672681	672690	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2621	NC_022221	GAA	2	6	672700	672705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_022221	ATA	2	6	672728	672733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_022221	CAA	2	6	672752	672757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_022221	GCG	2	6	672860	672865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_022221	GAAA	2	8	672878	672885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_022221	GCG	2	6	672935	672940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_022221	TAT	2	6	672993	672998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_022221	CAT	2	6	673006	673011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_022221	TAT	2	6	673075	673080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_022221	AAT	2	6	673209	673214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_022221	GCC	2	6	673304	673309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2632	NC_022221	AG	3	6	673450	673455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_022221	GTC	2	6	679018	679023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2635	NC_022221	GTT	2	6	679085	679090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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