MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022221	TGCA	2	8	408863	408870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_022221	ACA	2	6	408905	408910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_022221	ATA	2	6	408959	408964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_022221	AGC	2	6	409048	409053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_022221	GCG	2	6	409064	409069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_022221	GGCA	2	8	409110	409117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_022221	CGTG	2	8	409133	409140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_022221	TAT	2	6	409149	409154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022221	AAT	2	6	409169	409174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022221	CATT	2	8	409219	409226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_022221	CCA	2	6	409254	409259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_022221	CG	3	6	409268	409273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_022221	TA	3	6	409322	409327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_022221	AAT	2	6	409333	409338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_022221	GGC	2	6	409353	409358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_022221	AGCG	2	8	409360	409367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_022221	AAGT	2	8	409387	409394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022221	CGCAGC	2	12	409411	409422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_022221	ATTT	3	12	409502	409513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_022221	AT	3	6	409516	409521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_022221	TTA	2	6	409526	409531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_022221	TTA	2	6	409555	409560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_022221	TAA	2	6	409637	409642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_022221	ATA	2	6	409653	409658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_022221	TTAT	2	8	409703	409710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_022221	TTA	2	6	409785	409790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_022221	CGGG	2	8	415549	415556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_022221	CAG	2	6	417071	417076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_022221	A	7	7	417128	417134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_022221	TTA	2	6	417179	417184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022221	TTC	2	6	418677	418682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_022221	ATTT	2	8	418704	418711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022221	TCCT	2	8	420330	420337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_022221	TTTA	2	8	420392	420399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_022221	GGC	2	6	420438	420443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_022221	ATA	2	6	420835	420840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_022221	TTC	2	6	420847	420852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_022221	TA	3	6	420856	420861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_022221	TTC	2	6	421019	421024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_022221	ATC	2	6	421049	421054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_022221	TTTC	2	8	421144	421151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_022221	TC	3	6	421158	421163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_022221	AACGA	2	10	421293	421302	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_022221	ATT	2	6	421308	421313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022221	ACAAA	2	10	421386	421395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_022221	TCC	2	6	421426	421431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_022221	GTTGAG	2	12	421555	421566	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022221	CA	3	6	421593	421598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_022221	CAGG	2	8	421748	421755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_022221	CTT	2	6	421836	421841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_022221	TTC	2	6	422115	422120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_022221	TAT	2	6	422126	422131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_022221	GAA	2	6	422138	422143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_022221	CAT	2	6	422402	422407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_022221	CTGT	2	8	422431	422438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_022221	G	6	6	422457	422462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_022221	CTG	2	6	422465	422470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_022221	TAAA	2	8	422485	422492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022221	TA	3	6	422496	422501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022221	TGG	2	6	422517	422522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022221	T	6	6	422611	422616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_022221	GCA	2	6	422664	422669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_022221	TGCT	2	8	422683	422690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_022221	TCT	2	6	422692	422697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_022221	GGC	2	6	422778	422783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_022221	CTG	2	6	422834	422839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_022221	ATT	2	6	422878	422883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_022221	TTG	2	6	422910	422915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_022221	AGCC	2	8	422932	422939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_022221	ATTA	2	8	422975	422982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_022221	TAT	2	6	423031	423036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022221	TAT	2	6	423071	423076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_022221	A	6	6	423113	423118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_022221	TGGC	2	8	423131	423138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_022221	ATA	2	6	423183	423188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_022221	TTA	2	6	423221	423226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_022221	CGT	2	6	423289	423294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_022221	ATT	2	6	423312	423317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_022221	T	6	6	423387	423392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_022221	AGTG	2	8	423439	423446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_022221	CGG	2	6	423455	423460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_022221	CG	3	6	423512	423517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_022221	T	6	6	423547	423552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_022221	CT	3	6	423623	423628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_022221	TGC	2	6	423693	423698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_022221	CAG	2	6	423719	423724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_022221	GCC	2	6	423790	423795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_022221	CTG	2	6	423811	423816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_022221	TCT	2	6	423844	423849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_022221	GAC	2	6	423886	423891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_022221	GGA	2	6	423901	423906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_022221	GCG	2	6	423913	423918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_022221	GAT	2	6	423961	423966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022221	T	6	6	424000	424005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_022221	T	6	6	424105	424110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_022221	GTTTG	2	10	424126	424135	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022221	GGC	2	6	424183	424188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_022221	AT	3	6	424198	424203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_022221	CT	3	6	424339	424344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_022221	CAG	2	6	424385	424390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_022221	TGA	2	6	424411	424416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_022221	GTC	2	6	424574	424579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_022221	GAA	2	6	424598	424603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_022221	CGT	2	6	424612	424617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_022221	TAT	2	6	424671	424676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_022221	CGCGG	2	10	424701	424710	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1607	NC_022221	TAC	2	6	428339	428344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_022221	TGA	2	6	428376	428381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_022221	AAGG	2	8	428449	428456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_022221	GCC	2	6	428485	428490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_022221	T	8	8	430219	430226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_022221	GTT	2	6	430442	430447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022221	GTGA	2	8	430470	430477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_022221	AG	3	6	430545	430550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_022221	T	8	8	430573	430580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_022221	AATA	2	8	431245	431252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_022221	T	8	8	431279	431286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_022221	AACA	2	8	431303	431310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_022221	TGC	2	6	432637	432642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_022221	CGC	2	6	433417	433422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_022221	CGG	2	6	433425	433430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_022221	TAA	2	6	433827	433832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022221	TGT	2	6	435315	435320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_022221	CGT	2	6	435343	435348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_022221	TGA	2	6	435390	435395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022221	T	6	6	435446	435451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022221	CAT	2	6	436612	436617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_022221	GCC	2	6	436626	436631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_022221	TGA	2	6	436646	436651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_022221	T	7	7	436677	436683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_022221	GCC	2	6	436743	436748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_022221	TTC	2	6	436774	436779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_022221	TAA	2	6	436792	436797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_022221	CAT	2	6	436802	436807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_022221	T	7	7	436821	436827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_022221	CG	3	6	436892	436897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1906	NC_022221	T	6	6	500885	500890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1909	NC_022221	TTAT	2	8	502029	502036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_022221	AAC	2	6	503025	503030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1913	NC_022221	T	6	6	504076	504081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1959	NC_022221	TGTT	2	8	513225	513232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1968	NC_022221	GCT	2	6	516034	516039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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