MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022221	GTG	2	6	4400241	4400246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_022221	GTT	2	6	4400262	4400267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_022221	GGC	2	6	4400331	4400336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_022221	TATTCG	2	12	4400345	4400356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17005	NC_022221	A	6	6	4400376	4400381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_022221	GAG	2	6	4400382	4400387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_022221	CTGGCG	2	12	4400388	4400399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_022221	CCA	2	6	4400413	4400418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_022221	CGG	2	6	4400527	4400532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_022221	CGC	2	6	4400594	4400599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17011	NC_022221	CAC	2	6	4400612	4400617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17012	NC_022221	CGCC	2	8	4400647	4400654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17013	NC_022221	A	6	6	4400677	4400682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_022221	ATC	2	6	4400706	4400711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_022221	CGT	2	6	4400712	4400717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_022221	GCA	2	6	4400873	4400878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_022221	CAC	3	9	4400921	4400929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17018	NC_022221	ATG	2	6	4400970	4400975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_022221	TGT	2	6	4401052	4401057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_022221	TCA	2	6	4401122	4401127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_022221	CAG	2	6	4401180	4401185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_022221	ACG	2	6	4401192	4401197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_022221	GGA	2	6	4401206	4401211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_022221	CGC	2	6	4401251	4401256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17025	NC_022221	CCG	2	6	4401280	4401285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17026	NC_022221	GCG	2	6	4401294	4401299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17027	NC_022221	CG	3	6	4401298	4401303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17028	NC_022221	CGG	2	6	4401326	4401331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17030	NC_022221	GGT	2	6	4401366	4401371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17033	NC_022221	CGA	2	6	4401442	4401447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_022221	CGG	2	6	4401521	4401526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_022221	GC	3	6	4401634	4401639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17036	NC_022221	TTG	2	6	4401712	4401717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17038	NC_022221	GCA	2	6	4401750	4401755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_022221	ACA	2	6	4401789	4401794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17040	NC_022221	GCT	2	6	4401933	4401938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_022221	GCC	2	6	4401978	4401983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17042	NC_022221	ATGA	2	8	4402037	4402044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_022221	GCCT	2	8	4402059	4402066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17044	NC_022221	TTA	2	6	4403431	4403436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_022221	GA	3	6	4404767	4404772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_022221	A	6	6	4404806	4404811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_022221	GCC	2	6	4404812	4404817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17048	NC_022221	GAT	2	6	4404838	4404843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_022221	CGG	2	6	4404852	4404857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_022221	ACC	2	6	4407241	4407246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17051	NC_022221	GGT	2	6	4407263	4407268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_022221	TTGC	2	8	4408912	4408919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17053	NC_022221	T	6	6	4408992	4408997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_022221	AAAT	2	8	4409012	4409019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_022221	ATC	2	6	4409045	4409050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_022221	GGA	2	6	4409547	4409552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_022221	AGA	2	6	4412016	4412021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_022221	AAC	2	6	4412072	4412077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17059	NC_022221	T	6	6	4412831	4412836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_022221	CCAT	2	8	4412847	4412854	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17061	NC_022221	T	8	8	4412865	4412872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_022221	TTTA	2	8	4412919	4412926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_022221	A	6	6	4412928	4412933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_022221	GAGATA	2	12	4412934	4412945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_022221	GGC	2	6	4413360	4413365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17066	NC_022221	AGA	2	6	4413423	4413428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17068	NC_022221	AGC	2	6	4413464	4413469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17070	NC_022221	GGC	2	6	4413603	4413608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_022221	CGC	2	6	4413627	4413632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17072	NC_022221	GAA	2	6	4413652	4413657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_022221	GAA	2	6	4413688	4413693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_022221	AGC	2	6	4413776	4413781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17075	NC_022221	GC	4	8	4413816	4413823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17076	NC_022221	GAC	2	6	4413834	4413839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17077	NC_022221	CGG	3	9	4413872	4413880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17078	NC_022221	GCC	2	6	4413934	4413939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17079	NC_022221	CAA	2	6	4414054	4414059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17081	NC_022221	GTA	2	6	4419742	4419747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_022221	TTA	2	6	4420062	4420067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_022221	TGTT	2	8	4420108	4420115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_022221	AATC	2	8	4420169	4420176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17085	NC_022221	ATT	2	6	4420626	4420631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17087	NC_022221	GAT	2	6	4422227	4422232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_022221	A	6	6	4422267	4422272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_022221	CAGC	2	8	4423294	4423301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17090	NC_022221	TGTT	2	8	4423380	4423387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_022221	AAG	2	6	4423440	4423445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_022221	T	6	6	4423457	4423462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_022221	AGA	2	6	4423490	4423495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_022221	GAA	2	6	4423558	4423563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_022221	TTAT	2	8	4423569	4423576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_022221	ATT	2	6	4423603	4423608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_022221	TTG	2	6	4423642	4423647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_022221	ATT	2	6	4423676	4423681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_022221	ACA	2	6	4423738	4423743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_022221	T	7	7	4423753	4423759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_022221	A	7	7	4428199	4428205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_022221	CCT	2	6	4428541	4428546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17103	NC_022221	CAG	2	6	4428547	4428552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17104	NC_022221	CGC	2	6	4428616	4428621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17105	NC_022221	TGT	2	6	4428646	4428651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_022221	A	6	6	4428654	4428659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_022221	T	6	6	4428674	4428679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17108	NC_022221	AAC	2	6	4428688	4428693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17109	NC_022221	AGG	2	6	4428972	4428977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_022221	AAT	2	6	4428981	4428986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_022221	TGA	2	6	4429404	4429409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_022221	C	6	6	4429446	4429451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17113	NC_022221	GTG	2	6	4429543	4429548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17114	NC_022221	T	6	6	4430500	4430505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17115	NC_022221	ATT	2	6	4430566	4430571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_022221	CCT	2	6	4432209	4432214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17117	NC_022221	TCC	2	6	4432338	4432343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17118	NC_022221	AGA	2	6	4432362	4432367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_022221	TGC	2	6	4432381	4432386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17120	NC_022221	T	6	6	4432394	4432399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_022221	GAT	2	6	4433060	4433065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17122	NC_022221	CAG	2	6	4433098	4433103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17123	NC_022221	ATTTT	2	10	4433112	4433121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_022221	CGT	2	6	4433130	4433135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17125	NC_022221	CCG	2	6	4433232	4433237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17126	NC_022221	TCG	2	6	4433274	4433279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17128	NC_022221	GAA	2	6	4433328	4433333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17254	NC_022221	CAT	2	6	4492650	4492655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17373	NC_022221	TA	3	6	4513369	4513374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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