MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022221	T	6	6	255907	255912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022221	ACTG	2	8	255923	255930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_022221	GCC	2	6	255960	255965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_022221	CAA	2	6	256009	256014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022221	GC	3	6	256048	256053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_022221	AC	3	6	256079	256084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_022221	AAC	2	6	256117	256122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_022221	AC	4	8	256121	256128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_022221	GGC	2	6	256988	256993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_022221	GTA	2	6	257101	257106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022221	GAG	2	6	258063	258068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022221	CTT	2	6	258083	258088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_022221	GAAA	2	8	258191	258198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022221	TTA	2	6	258974	258979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022221	TG	3	6	259024	259029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022221	GTCTG	2	10	259033	259042	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_022221	AGA	2	6	260983	260988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022221	T	6	6	261055	261060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022221	T	6	6	261090	261095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022221	A	6	6	261268	261273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022221	TGT	2	6	261281	261286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022221	CTC	2	6	264430	264435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_022221	TTA	2	6	268439	268444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022221	T	8	8	275990	275997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022221	GCAG	2	8	276093	276100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_022221	T	6	6	277948	277953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022221	GCGCT	2	10	281909	281918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1028	NC_022221	CAC	2	6	281966	281971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_022221	CAA	2	6	281979	281984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_022221	CCT	2	6	282442	282447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_022221	CAA	2	6	284392	284397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_022221	A	7	7	286177	286183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022221	AATG	2	8	287355	287362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022221	AAT	2	6	287428	287433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022221	TGTGT	2	10	288300	288309	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022221	TTAT	2	8	289997	290004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022221	GTCT	2	8	290035	290042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_022221	ATCA	2	8	290095	290102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_022221	CTG	2	6	290130	290135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_022221	TG	3	6	291003	291008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022221	GGC	2	6	291157	291162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_022221	AGC	2	6	291197	291202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_022221	TGC	2	6	291204	291209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022221	ACT	2	6	291271	291276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_022221	TTG	2	6	291368	291373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022221	CGA	2	6	291396	291401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_022221	GCA	2	6	291470	291475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_022221	GAA	2	6	291529	291534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022221	GGA	2	6	291565	291570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022221	TAA	2	6	291583	291588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022221	GCA	2	6	291591	291596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_022221	AGA	2	6	291612	291617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_022221	CAG	2	6	291638	291643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_022221	G	6	6	291785	291790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022221	GGA	2	6	291829	291834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022221	GGC	2	6	291849	291854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_022221	GAA	2	6	292092	292097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022221	AGA	2	6	292121	292126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022221	TGC	2	6	292168	292173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_022221	GTC	2	6	292180	292185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_022221	TTG	2	6	292241	292246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022221	GGA	2	6	292293	292298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022221	TCA	2	6	292318	292323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_022221	AC	3	6	292344	292349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_022221	CGT	2	6	292412	292417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_022221	AC	3	6	292513	292518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_022221	GTAG	2	8	292554	292561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022221	CCT	2	6	292654	292659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_022221	AAG	2	6	292667	292672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022221	CA	3	6	292689	292694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_022221	TGA	2	6	292702	292707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022221	GGT	2	6	292745	292750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022221	GGT	2	6	292780	292785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022221	AGG	2	6	292959	292964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022221	CCA	2	6	292989	292994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_022221	A	6	6	293012	293017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022221	AAC	2	6	293099	293104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022221	GTT	2	6	293109	293114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022221	TC	3	6	293121	293126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_022221	GAT	2	6	293142	293147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022221	GCG	2	6	293421	293426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_022221	GAG	2	6	293437	293442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022221	TG	3	6	293462	293467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_022221	GC	3	6	293489	293494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_022221	G	6	6	293582	293587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_022221	TCC	2	6	293592	293597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_022221	CTGA	2	8	293612	293619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_022221	GTAC	2	8	293696	293703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_022221	TG	3	6	293728	293733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022221	GGA	2	6	293903	293908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022221	AC	3	6	294121	294126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_022221	CGTC	2	8	294139	294146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_022221	AAC	2	6	294158	294163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_022221	AGC	2	6	294248	294253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022221	CAT	2	6	294254	294259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022221	AAAG	2	8	294262	294269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022221	AGCGA	2	10	294388	294397	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_022221	AGTCG	2	10	294415	294424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_022221	CGTT	2	8	294436	294443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_022221	G	6	6	294680	294685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022221	GT	4	8	294738	294745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022221	TGA	2	6	294781	294786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022221	GGT	2	6	294880	294885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022221	GA	3	6	294910	294915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022221	AGTC	2	8	295006	295013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_022221	GCTG	2	8	295024	295031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_022221	TTA	2	6	295039	295044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022221	CGG	2	6	295163	295168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_022221	ATG	2	6	295239	295244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022221	ACC	2	6	295434	295439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_022221	TGG	2	6	295494	295499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022221	TCC	2	6	295520	295525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_022221	GGA	2	6	295537	295542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022221	AGG	2	6	295575	295580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022221	GGT	2	6	295657	295662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022221	CGG	2	6	295744	295749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_022221	TCA	2	6	295772	295777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_022221	CGT	2	6	295852	295857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_022221	G	6	6	295901	295906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022221	GAC	3	9	296083	296091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_022221	GT	3	6	296105	296110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022221	GA	3	6	296192	296197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022221	CAG	2	6	296205	296210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_022221	AAT	2	6	296231	296236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022221	GCA	3	9	296241	296249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022221	GGC	2	6	296251	296256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_022221	AAGGA	2	10	296262	296271	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022221	CGC	2	6	296316	296321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_022221	GGC	2	6	296365	296370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022221	GGT	2	6	296379	296384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022221	TTTTGT	2	12	296516	296527	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022221	GGC	2	6	296543	296548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_022221	CCCA	2	8	296622	296629	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1134	NC_022221	TA	3	6	296663	296668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022221	CAAA	2	8	297149	297156	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_022221	TTTA	2	8	297167	297174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022221	CAA	2	6	297229	297234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_022221	TCT	2	6	300278	300283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_022221	CAGC	2	8	303863	303870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_022221	ACC	2	6	303912	303917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1147	NC_022221	AAC	2	6	304169	304174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1182	NC_022221	A	6	6	312622	312627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1268	NC_022221	T	6	6	357927	357932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_022221	AAACT	2	10	357952	357961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1270	NC_022221	AAAT	2	8	358024	358031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_022221	A	6	6	358096	358101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_022221	AT	3	6	358126	358131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_022221	AT	3	6	358151	358156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_022221	CGG	2	6	359158	359163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_022221	CCG	2	6	359178	359183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1312	NC_022221	TAAC	2	8	385867	385874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1320	NC_022221	AAC	2	6	391373	391378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1321	NC_022221	CG	3	6	391392	391397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1332	NC_022221	TTAT	2	8	393411	393418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1333	NC_022221	CTTTT	2	10	393452	393461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1334	NC_022221	AT	3	6	393467	393472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1363	NC_022221	GCC	2	6	402286	402291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1409	NC_022221	CG	3	6	404647	404652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1410	NC_022221	CA	3	6	404700	404705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_022221	CGA	2	6	404719	404724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_022221	ACT	2	6	404731	404736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_022221	CGG	2	6	404854	404859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_022221	GGTGAA	2	12	404921	404932	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_022221	CAG	2	6	405535	405540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_022221	CGG	2	6	405636	405641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_022221	AAC	2	6	405665	405670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_022221	CTGC	2	8	405681	405688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1441	NC_022221	GC	3	6	405867	405872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1442	NC_022221	AGG	2	6	405878	405883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_022221	GCG	2	6	406004	406009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_022221	ACT	2	6	406118	406123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_022221	CAG	2	6	406152	406157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_022221	GGCGT	2	10	406159	406168	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1453	NC_022221	GCT	2	6	406179	406184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_022221	CTA	2	6	406236	406241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1457	NC_022221	CAA	3	9	406413	406421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1458	NC_022221	TGG	2	6	406435	406440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_022221	CCG	2	6	406913	406918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1481	NC_022221	CAGT	2	8	407352	407359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1482	NC_022221	ATA	3	9	407381	407389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1498	NC_022221	ACC	3	9	408565	408573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_022221	CGGATA	2	12	408734	408745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1500	NC_022221	GTT	2	6	408750	408755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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