MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022221	C	7	7	2703300	2703306	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10502	NC_022221	AAC	2	6	2703319	2703324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_022221	GACA	2	8	2703357	2703364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10504	NC_022221	AGG	2	6	2703418	2703423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_022221	TTCAG	2	10	2703831	2703840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10506	NC_022221	GGA	2	6	2705373	2705378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_022221	TGG	2	6	2705767	2705772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_022221	CCG	2	6	2705778	2705783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10509	NC_022221	CCA	2	6	2706776	2706781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_022221	CCCG	2	8	2706816	2706823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10511	NC_022221	CTG	2	6	2706868	2706873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_022221	CTG	2	6	2706880	2706885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_022221	CAA	2	6	2706886	2706891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_022221	ACG	2	6	2706929	2706934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_022221	AGC	2	6	2706944	2706949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_022221	TTG	2	6	2706992	2706997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_022221	GACC	2	8	2707017	2707024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10518	NC_022221	TGCAG	2	10	2707041	2707050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10519	NC_022221	TGA	2	6	2707103	2707108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_022221	CGT	2	6	2707111	2707116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_022221	CAC	2	6	2707140	2707145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10522	NC_022221	G	7	7	2707159	2707165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_022221	ACC	2	6	2707883	2707888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_022221	TA	3	6	2707939	2707944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_022221	GAAA	2	8	2707948	2707955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_022221	A	6	6	2708891	2708896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_022221	GAAAA	2	10	2708900	2708909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_022221	ACGG	2	8	2708951	2708958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10529	NC_022221	CAGG	2	8	2708986	2708993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10530	NC_022221	TGC	2	6	2709103	2709108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_022221	GAT	2	6	2709124	2709129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_022221	GA	3	6	2711114	2711119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_022221	ATT	2	6	2711151	2711156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_022221	GTC	2	6	2711967	2711972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_022221	AC	4	8	2711989	2711996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10536	NC_022221	GCAC	2	8	2712077	2712084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_022221	CGA	2	6	2713372	2713377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_022221	GCA	2	6	2714224	2714229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_022221	CACT	2	8	2715140	2715147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10540	NC_022221	GTTT	2	8	2715165	2715172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_022221	AAT	2	6	2715193	2715198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_022221	CAG	2	6	2716389	2716394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_022221	AATTT	2	10	2716453	2716462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_022221	AAT	2	6	2718323	2718328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_022221	TAA	2	6	2718375	2718380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_022221	ACGG	2	8	2718389	2718396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10547	NC_022221	CAGG	2	8	2718424	2718431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10548	NC_022221	ACC	2	6	2718606	2718611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10549	NC_022221	GCC	2	6	2718620	2718625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10550	NC_022221	GCG	2	6	2718669	2718674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_022221	TCCT	2	8	2718715	2718722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10552	NC_022221	GCC	2	6	2718734	2718739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10553	NC_022221	TGC	3	9	2718741	2718749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_022221	ATT	2	6	2718754	2718759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_022221	CTG	2	6	2718780	2718785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_022221	TC	3	6	2718793	2718798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_022221	AC	3	6	2718880	2718885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10558	NC_022221	CGT	3	9	2718898	2718906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_022221	AGC	2	6	2719079	2719084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_022221	C	6	6	2719084	2719089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10561	NC_022221	ACG	2	6	2719133	2719138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_022221	TGA	2	6	2719213	2719218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_022221	CCG	2	6	2719241	2719246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_022221	ACC	2	6	2719328	2719333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10565	NC_022221	CCT	2	6	2719410	2719415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10566	NC_022221	CTC	2	6	2719447	2719452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_022221	AGG	2	6	2719464	2719469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_022221	CCA	2	6	2719491	2719496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10569	NC_022221	GGT	2	6	2719551	2719556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_022221	CAT	2	6	2719746	2719751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_022221	GCC	2	6	2719821	2719826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10572	NC_022221	TAA	2	6	2719946	2719951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_022221	CAGC	2	8	2719959	2719966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10574	NC_022221	GACT	2	8	2719977	2719984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10575	NC_022221	TC	3	6	2720075	2720080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10576	NC_022221	ACC	2	6	2720105	2720110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10577	NC_022221	TCA	2	6	2720204	2720209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10578	NC_022221	AC	4	8	2720245	2720252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10579	NC_022221	C	6	6	2720305	2720310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10580	NC_022221	AACG	2	8	2720547	2720554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10581	NC_022221	CGACT	2	10	2720566	2720575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10582	NC_022221	TCGCT	2	10	2720593	2720602	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10583	NC_022221	CTTT	2	8	2720721	2720728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10584	NC_022221	ATG	2	6	2720731	2720736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_022221	GCT	2	6	2720737	2720742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10586	NC_022221	GTT	2	6	2720827	2720832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_022221	ACG	2	6	2720842	2720847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_022221	GT	3	6	2720864	2720869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_022221	TGA	2	6	2720876	2720881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_022221	TCGGT	2	10	2721073	2721082	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10591	NC_022221	CA	3	6	2721257	2721262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_022221	GTAC	2	8	2721287	2721294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10593	NC_022221	GTCA	2	8	2721370	2721377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10594	NC_022221	GGA	2	6	2721393	2721398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_022221	C	6	6	2721403	2721408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10596	NC_022221	CG	3	6	2721495	2721500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_022221	AC	3	6	2721522	2721527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10598	NC_022221	CTC	2	6	2721548	2721553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_022221	TCGC	2	8	2721559	2721566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10600	NC_022221	TCA	2	6	2721841	2721846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_022221	GA	3	6	2721864	2721869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_022221	AAC	2	6	2721876	2721881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_022221	GTT	2	6	2721886	2721891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_022221	TCAC	2	8	2721988	2721995	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_022221	CCG	2	6	2722039	2722044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10606	NC_022221	TCA	2	6	2722122	2722127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_022221	TG	3	6	2722135	2722140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_022221	CTT	2	6	2722157	2722162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_022221	AGG	2	6	2722170	2722175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_022221	CTAC	2	8	2722268	2722275	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10611	NC_022221	GT	3	6	2722311	2722316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_022221	ACG	2	6	2722412	2722417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_022221	GT	3	6	2722480	2722485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_022221	ATG	2	6	2722505	2722510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_022221	TCC	2	6	2722531	2722536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10616	NC_022221	CAA	2	6	2722583	2722588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_022221	GAC	2	6	2722644	2722649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_022221	GCA	2	6	2722656	2722661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_022221	TTC	2	6	2722702	2722707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_022221	TTC	2	6	2722732	2722737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_022221	GCC	2	6	2722975	2722980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_022221	TCC	2	6	2722995	2723000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10623	NC_022221	C	6	6	2723039	2723044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10624	NC_022221	TGCG	2	8	2723127	2723134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10625	NC_022221	GCT	2	6	2723185	2723190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_022221	CTT	2	6	2723210	2723215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10627	NC_022221	TGC	2	6	2723233	2723238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10628	NC_022221	TTA	2	6	2723241	2723246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_022221	TCC	2	6	2723259	2723264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10753	NC_022221	CGG	2	6	2751112	2751117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11000	NC_022221	GACT	2	8	2766236	2766243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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