MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022221	AAT	2	6	1513344	1513349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_022221	T	6	6	1513360	1513365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_022221	TCG	2	6	1515317	1515322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_022221	TAA	2	6	1515401	1515406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_022221	T	6	6	1515419	1515424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_022221	TGCT	2	8	1515444	1515451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_022221	AAT	2	6	1515568	1515573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_022221	C	6	6	1516487	1516492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6009	NC_022221	TCTA	2	8	1516567	1516574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_022221	AG	3	6	1516590	1516595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_022221	AAT	2	6	1516614	1516619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_022221	GGTG	2	8	1516622	1516629	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_022221	CGT	2	6	1516678	1516683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_022221	CGG	2	6	1516690	1516695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_022221	CA	3	6	1516697	1516702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_022221	ACG	2	6	1516760	1516765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_022221	TCA	2	6	1516775	1516780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_022221	GCAG	2	8	1516824	1516831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_022221	ATC	2	6	1516875	1516880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_022221	CG	3	6	1516929	1516934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_022221	GGCG	2	8	1516943	1516950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_022221	A	6	6	1517149	1517154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_022221	CGG	2	6	1517168	1517173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_022221	GTC	2	6	1517265	1517270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_022221	GCA	2	6	1517330	1517335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6027	NC_022221	TGC	2	6	1517414	1517419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_022221	CG	3	6	1517436	1517441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_022221	TGG	2	6	1517455	1517460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_022221	CAT	2	6	1517488	1517493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_022221	GCC	2	6	1517512	1517517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_022221	CGG	2	6	1517542	1517547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_022221	GGC	2	6	1517553	1517558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_022221	ATT	2	6	1519247	1519252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_022221	CGG	2	6	1519340	1519345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_022221	ACA	2	6	1519353	1519358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_022221	GAT	2	6	1519363	1519368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_022221	AAT	2	6	1521130	1521135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_022221	CTG	2	6	1521700	1521705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_022221	TAC	2	6	1521722	1521727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_022221	AAG	2	6	1521748	1521753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_022221	CTT	2	6	1521770	1521775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_022221	T	7	7	1521774	1521780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_022221	AAT	2	6	1523338	1523343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_022221	GAT	2	6	1523357	1523362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_022221	AGGA	2	8	1523382	1523389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_022221	CAA	2	6	1523396	1523401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_022221	GCG	2	6	1523433	1523438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_022221	GAAGA	2	10	1525944	1525953	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_022221	A	6	6	1525953	1525958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_022221	TAA	2	6	1525959	1525964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_022221	TTA	2	6	1525996	1526001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_022221	GA	3	6	1526013	1526018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_022221	CAA	2	6	1526020	1526025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_022221	CA	3	6	1526418	1526423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_022221	TGA	2	6	1527311	1527316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_022221	GCC	2	6	1527335	1527340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_022221	ATT	2	6	1528115	1528120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_022221	A	6	6	1528139	1528144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_022221	GTG	2	6	1528152	1528157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_022221	GAC	2	6	1529186	1529191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_022221	CCACT	2	10	1535295	1535304	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6063	NC_022221	ATCA	2	8	1535341	1535348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_022221	AT	3	6	1535362	1535367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_022221	A	6	6	1535368	1535373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_022221	A	7	7	1535380	1535386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_022221	AT	3	6	1535389	1535394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_022221	TTC	2	6	1535437	1535442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6070	NC_022221	AAC	2	6	1535475	1535480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_022221	ACG	2	6	1535487	1535492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6073	NC_022221	AAT	2	6	1535689	1535694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_022221	T	7	7	1535760	1535766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6078	NC_022221	TTG	2	6	1535984	1535989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_022221	AAAGA	2	10	1536051	1536060	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_022221	C	6	6	1536112	1536117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6081	NC_022221	AAG	2	6	1536125	1536130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_022221	ATCTTC	2	12	1536152	1536163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6088	NC_022221	TATTT	2	10	1536416	1536425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_022221	T	7	7	1536423	1536429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_022221	TAA	2	6	1536472	1536477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_022221	GGCG	2	8	1536548	1536555	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_022221	TAC	2	6	1536604	1536609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_022221	CTCG	2	8	1536614	1536621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_022221	TTA	2	6	1536666	1536671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_022221	A	6	6	1536693	1536698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_022221	GTA	3	9	1536757	1536765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_022221	AT	3	6	1536843	1536848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_022221	AAG	2	6	1536851	1536856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_022221	GA	3	6	1536904	1536909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_022221	T	7	7	1536935	1536941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_022221	AT	3	6	1536996	1537001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_022221	A	6	6	1537007	1537012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_022221	A	6	6	1537035	1537040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_022221	TAT	2	6	1537053	1537058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_022221	GAT	2	6	1537060	1537065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_022221	TAT	2	6	1537150	1537155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_022221	TGG	2	6	1537394	1537399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_022221	GCG	2	6	1537596	1537601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_022221	AC	3	6	1537615	1537620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_022221	AAT	2	6	1537658	1537663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_022221	A	6	6	1537700	1537705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_022221	GCGG	2	8	1538539	1538546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_022221	TGC	2	6	1538555	1538560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_022221	CTCA	2	8	1538570	1538577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_022221	TA	3	6	1538591	1538596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_022221	ATCG	2	8	1538690	1538697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_022221	GTC	2	6	1538780	1538785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_022221	T	6	6	1538834	1538839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_022221	CCG	2	6	1538992	1538997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_022221	TAT	2	6	1539030	1539035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_022221	CG	3	6	1539038	1539043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_022221	AG	4	8	1539075	1539082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_022221	TCA	2	6	1539205	1539210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6126	NC_022221	CG	3	6	1539326	1539331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_022221	GGC	2	6	1539355	1539360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_022221	CCG	2	6	1539361	1539366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_022221	TCC	2	6	1539383	1539388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_022221	CGG	2	6	1539405	1539410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_022221	ATG	2	6	1539435	1539440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_022221	AC	3	6	1539506	1539511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6133	NC_022221	CTT	2	6	1539523	1539528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_022221	CTC	2	6	1539546	1539551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_022221	CATC	2	8	1539553	1539560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6136	NC_022221	GCC	2	6	1539577	1539582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6137	NC_022221	CAACC	2	10	1539599	1539608	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6138	NC_022221	TCA	2	6	1539629	1539634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_022221	GAC	3	9	1539649	1539657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_022221	T	6	6	1539741	1539746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_022221	GCG	2	6	1539803	1539808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6142	NC_022221	TGC	2	6	1539883	1539888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_022221	GCTC	2	8	1541891	1541898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6144	NC_022221	TTTCT	2	10	1541928	1541937	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6145	NC_022221	TCT	3	9	1541935	1541943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6146	NC_022221	CTTT	2	8	1542102	1542109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6147	NC_022221	GGC	2	6	1544127	1544132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_022221	ATA	2	6	1544134	1544139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6149	NC_022221	CAT	2	6	1544205	1544210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_022221	ATT	2	6	1544432	1544437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_022221	CT	3	6	1544467	1544472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6152	NC_022221	CTGT	2	8	1544475	1544482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6153	NC_022221	CTC	2	6	1544486	1544491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6154	NC_022221	ATC	2	6	1545296	1545301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6155	NC_022221	CT	4	8	1545302	1545309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6156	NC_022221	TGT	2	6	1545346	1545351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6157	NC_022221	CGT	2	6	1545363	1545368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6158	NC_022221	TTTTA	2	10	1545460	1545469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6159	NC_022221	TATAGT	2	12	1545472	1545483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6160	NC_022221	GA	3	6	1545513	1545518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6161	NC_022221	ATA	2	6	1545773	1545778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6162	NC_022221	CTT	2	6	1546934	1546939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6163	NC_022221	TCA	2	6	1547074	1547079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6164	NC_022221	TGT	2	6	1547084	1547089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_022221	T	7	7	1547104	1547110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_022221	CG	3	6	1548684	1548689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6167	NC_022221	CCA	2	6	1548704	1548709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6170	NC_022221	GCCT	2	8	1550322	1550329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6171	NC_022221	CTC	2	6	1553034	1553039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6172	NC_022221	TTA	2	6	1553082	1553087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6174	NC_022221	AAC	2	6	1553120	1553125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6182	NC_022221	AATC	2	8	1553851	1553858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6186	NC_022221	ATA	2	6	1555125	1555130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6194	NC_022221	TCTGCG	2	12	1558077	1558088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6196	NC_022221	CA	3	6	1558161	1558166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6200	NC_022221	AGTC	2	8	1559788	1559795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6201	NC_022221	TC	3	6	1559794	1559799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6202	NC_022221	GAA	2	6	1559821	1559826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6209	NC_022221	GTA	2	6	1562360	1562365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6215	NC_022221	T	8	8	1564121	1564128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6234	NC_022221	T	6	6	1573445	1573450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6236	NC_022221	TGA	2	6	1574163	1574168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6238	NC_022221	GGCT	2	8	1574352	1574359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6240	NC_022221	TGA	2	6	1575682	1575687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6244	NC_022221	TAG	2	6	1576356	1576361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6246	NC_022221	ACA	2	6	1576403	1576408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_022221	GC	3	6	1577887	1577892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6253	NC_022221	ATG	2	6	1577906	1577911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6258	NC_022221	AAC	2	6	1578436	1578441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_022221	AAG	2	6	1581191	1581196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_022221	A	6	6	1585163	1585168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_022221	TGG	2	6	1586916	1586921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6264	NC_022221	TCG	2	6	1586994	1586999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6390	NC_022221	AT	3	6	1600547	1600552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6391	NC_022221	ATT	3	9	1600558	1600566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_022221	TGA	2	6	1600575	1600580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6393	NC_022221	CCG	2	6	1600797	1600802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6397	NC_022221	GC	3	6	1607619	1607624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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