MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	TTCGC	2	10	45	54	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_022001	GGGCG	2	10	178	187	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022001	CACCT	2	10	1006	1015	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_022001	CGTCG	2	10	2694	2703	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022001	GGGGC	2	10	2934	2943	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022001	CCCCG	2	10	2969	2978	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_022001	GCTGA	2	10	9554	9563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022001	GTTCC	2	10	9669	9678	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_022001	CCTGT	2	10	11541	11550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022001	GCCGT	2	10	16714	16723	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022001	ACGGT	2	10	16929	16938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022001	CCCGT	2	10	18714	18723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_022001	ACCGG	2	10	19462	19471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022001	GGCGC	2	10	20161	20170	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022001	CGTCT	2	10	25224	25233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022001	CCAAA	2	10	31788	31797	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_022001	CCGCC	2	10	32070	32079	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_022001	TGACA	2	10	40109	40118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022001	CTCGC	2	10	47283	47292	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_022001	AGGCC	2	10	47653	47662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022001	GCAAG	2	10	47680	47689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022001	CGAGG	2	10	47776	47785	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022001	GGCGC	2	10	51375	51384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_022001	CACCC	2	10	52190	52199	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_022001	CCGGC	2	10	60301	60310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_022001	GGCAT	2	10	60676	60685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022001	GACGG	2	10	61124	61133	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022001	TCGGG	2	10	65453	65462	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022001	AATCG	2	10	69243	69252	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022001	CGGGC	2	10	69739	69748	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_022001	GCAGG	2	10	69796	69805	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022001	GCCGC	2	10	71302	71311	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_022001	GGTCG	2	10	74764	74773	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022001	GTGCG	2	10	77298	77307	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022001	GCTGG	2	10	77324	77333	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022001	CAGCG	2	10	81759	81768	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.