MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 23922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021984	TTA	2	6	705626	705631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021984	CTG	2	6	705665	705670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_021984	TGC	2	6	705726	705731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_021984	GCAG	3	12	705787	705798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_021984	GAT	2	6	705832	705837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021984	A	6	6	705863	705868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021984	TCA	2	6	705908	705913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_021984	TCT	2	6	705925	705930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_021984	CCG	2	6	705970	705975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_021984	GAT	2	6	706008	706013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021984	T	6	6	706051	706056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021984	CCA	2	6	706094	706099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_021984	CGC	2	6	706108	706113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_021984	C	7	7	706139	706145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4015	NC_021984	A	6	6	706163	706168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021984	T	7	7	706177	706183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021984	GCCG	2	8	706236	706243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_021984	ACG	2	6	706246	706251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021984	GGA	2	6	706254	706259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021984	CAG	2	6	706266	706271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_021984	GGA	2	6	706308	706313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021984	CATT	2	8	706317	706324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_021984	GTCA	2	8	706383	706390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_021984	TGA	2	6	706395	706400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021984	GAG	2	6	706474	706479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021984	C	7	7	706506	706512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4027	NC_021984	C	7	7	706514	706520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4028	NC_021984	CAG	2	6	706544	706549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021984	ATG	2	6	706553	706558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021984	AGA	2	6	706593	706598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021984	GCA	2	6	706612	706617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_021984	TGCC	2	8	706635	706642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_021984	AAT	2	6	706645	706650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021984	ACC	2	6	706687	706692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_021984	ATA	2	6	706739	706744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021984	GCC	2	6	706827	706832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_021984	TAA	2	6	706917	706922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021984	TAA	2	6	707037	707042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021984	TA	3	6	707138	707143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021984	TAA	2	6	707157	707162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021984	TGC	2	6	707243	707248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_021984	TGC	2	6	707303	707308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_021984	ACT	2	6	707316	707321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_021984	TCAT	2	8	707369	707376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_021984	GC	3	6	707456	707461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_021984	ATA	2	6	707479	707484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021984	C	6	6	707510	707515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4048	NC_021984	GGC	2	6	707538	707543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_021984	CTGG	2	8	707550	707557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_021984	TGCC	2	8	707558	707565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_021984	CAGA	2	8	707588	707595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_021984	TGAG	2	8	707654	707661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021984	CTGG	2	8	707709	707716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_021984	T	7	7	707803	707809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021984	GAA	2	6	707819	707824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021984	GCG	2	6	707874	707879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_021984	TGA	2	6	707963	707968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021984	CTGG	2	8	707978	707985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_021984	GAA	2	6	708002	708007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021984	A	6	6	708112	708117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021984	CGT	2	6	708402	708407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_021984	GGTGC	2	10	708430	708439	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4063	NC_021984	AAC	2	6	708460	708465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_021984	GAT	2	6	708479	708484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021984	CTT	2	6	708506	708511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_021984	GCG	2	6	708522	708527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_021984	GAT	2	6	708538	708543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021984	CGCGC	2	10	708546	708555	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4069	NC_021984	TGATG	2	10	708750	708759	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021984	GGAG	2	8	708914	708921	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021984	CAT	2	6	708962	708967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021984	AT	3	6	708987	708992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021984	A	7	7	708993	708999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021984	GGCT	2	8	709012	709019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_021984	TAC	2	6	709126	709131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021984	TAAT	2	8	709177	709184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021984	TCT	2	6	709206	709211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_021984	GCA	3	9	709222	709230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021984	TCT	2	6	709258	709263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_021984	TTA	2	6	709296	709301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021984	GCG	2	6	709321	709326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_021984	GCC	2	6	709353	709358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_021984	GAC	2	6	709372	709377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_021984	TTCG	2	8	709412	709419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_021984	TCA	2	6	709459	709464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_021984	TTC	2	6	709568	709573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_021984	GATT	2	8	709660	709667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021984	GGC	2	6	709685	709690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_021984	TCA	2	6	709728	709733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_021984	CTGG	2	8	709811	709818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_021984	GAA	2	6	709886	709891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021984	TGG	2	6	709950	709955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021984	CCAT	2	8	709964	709971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_021984	AGC	2	6	710132	710137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_021984	CAG	2	6	710251	710256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_021984	AG	3	6	710296	710301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021984	GATGC	2	10	710367	710376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4098	NC_021984	TCAA	2	8	710477	710484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_021984	TAA	2	6	710502	710507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021984	CG	3	6	710523	710528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_021984	TGA	2	6	710550	710555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021984	AAC	2	6	710621	710626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_021984	TGTT	2	8	711193	711200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021984	T	8	8	711233	711240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021984	TTGC	2	8	711300	711307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_021984	GGT	2	6	711322	711327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021984	GTC	2	6	713056	713061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_021984	A	6	6	713080	713085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021984	CGGGG	2	10	713092	713101	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_021984	TTC	2	6	713105	713110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_021984	TC	3	6	713414	713419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_021984	TAA	2	6	713422	713427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021984	GGCG	2	8	713482	713489	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_021984	T	6	6	715392	715397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021984	TAT	2	6	715420	715425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021984	GC	3	6	717362	717367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_021984	GAA	2	6	717385	717390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021984	GGC	2	6	717397	717402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_021984	TCA	2	6	717476	717481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_021984	TCC	2	6	717485	717490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_021984	TTTAT	2	10	717497	717506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021984	CAT	2	6	717533	717538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_021984	CGC	2	6	717587	717592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_021984	GA	3	6	717648	717653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021984	ATG	2	6	717689	717694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021984	GAAA	2	8	717741	717748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021984	AAT	2	6	723654	723659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021984	AGT	2	6	725382	725387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021984	GT	3	6	725444	725449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021984	ATA	2	6	725505	725510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021984	GTC	2	6	725543	725548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_021984	TCA	2	6	725549	725554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_021984	TGC	2	6	725571	725576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_021984	TGA	2	6	725578	725583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_021984	AAT	2	6	726302	726307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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