MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 23922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021984	GC	3	6	247358	247363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_021984	CAT	2	6	247372	247377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021984	TAT	2	6	247414	247419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021984	GCG	2	6	247425	247430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_021984	GC	3	6	247461	247466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_021984	GT	3	6	247634	247639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021984	ATG	2	6	247652	247657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021984	TGA	2	6	247719	247724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021984	GAA	2	6	247739	247744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021984	TGG	2	6	247758	247763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021984	GGC	2	6	247782	247787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021984	GGT	2	6	247788	247793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021984	CAG	2	6	247843	247848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_021984	AAC	2	6	247879	247884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021984	TGG	2	6	247913	247918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021984	ATC	2	6	247964	247969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021984	AGC	2	6	247982	247987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021984	CCGGG	2	10	248051	248060	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1519	NC_021984	GC	3	6	248086	248091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_021984	GAT	2	6	248097	248102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021984	AG	3	6	248124	248129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021984	TGC	2	6	248156	248161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021984	GGC	2	6	248185	248190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021984	GC	3	6	248209	248214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_021984	AAC	2	6	248242	248247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021984	TTA	2	6	248251	248256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021984	CGG	2	6	248449	248454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021984	AT	3	6	248480	248485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021984	AC	3	6	248525	248530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_021984	TCA	2	6	248932	248937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_021984	AAT	2	6	248952	248957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021984	CCA	2	6	248979	248984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_021984	A	7	7	248993	248999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021984	AGA	2	6	249014	249019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021984	GCG	2	6	249047	249052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021984	G	6	6	250475	250480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021984	ATAA	2	8	251346	251353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021984	CT	3	6	254174	254179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_021984	GCC	2	6	254181	254186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_021984	GAT	2	6	255084	255089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021984	AAT	2	6	255096	255101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021984	TCAG	2	8	255124	255131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_021984	GT	3	6	255186	255191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021984	T	6	6	255200	255205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021984	ACTG	2	8	255216	255223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_021984	GCC	2	6	255253	255258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_021984	CAA	2	6	255302	255307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_021984	GC	3	6	255341	255346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_021984	AC	3	6	255372	255377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_021984	AAC	2	6	255410	255415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021984	AC	4	8	255414	255421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_021984	GGC	2	6	256281	256286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021984	GTA	2	6	256394	256399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021984	GAG	2	6	257356	257361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021984	CTT	2	6	257376	257381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021984	GAAA	2	8	257484	257491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021984	TTA	2	6	258267	258272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021984	TG	3	6	258317	258322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021984	GTCTG	2	10	258326	258335	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_021984	GTG	2	6	258974	258979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021984	AGA	2	6	258995	259000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021984	GCG	2	6	259019	259024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021984	AGA	2	6	260276	260281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021984	T	6	6	260348	260353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021984	T	6	6	260383	260388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021984	A	6	6	260561	260566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021984	TTAG	2	8	263571	263578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021984	GAA	2	6	263579	263584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021984	ATA	2	6	263588	263593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021984	TTA	2	6	267732	267737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021984	T	8	8	275283	275290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021984	GCAG	2	8	275386	275393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_021984	T	6	6	277241	277246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021984	GCGCT	2	10	281202	281211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_021984	CAC	2	6	281259	281264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_021984	CAA	2	6	281272	281277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_021984	CCT	2	6	281735	281740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_021984	CAA	2	6	283685	283690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_021984	A	7	7	285470	285476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021984	AATG	2	8	286648	286655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021984	AAT	2	6	286721	286726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021984	TGTGT	2	10	287593	287602	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021984	TTAT	2	8	289290	289297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021984	GTCT	2	8	289328	289335	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_021984	ATCA	2	8	289388	289395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_021984	CTG	2	6	289423	289428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_021984	CGG	2	6	290135	290140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_021984	CA	3	6	290154	290159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_021984	CGGT	2	8	290166	290173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_021984	TG	3	6	290296	290301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021984	GGC	2	6	290450	290455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_021984	AGC	2	6	290490	290495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_021984	TGC	2	6	290497	290502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021984	ACT	2	6	290564	290569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_021984	TTG	2	6	290661	290666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021984	CGA	2	6	290689	290694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_021984	GCA	2	6	290763	290768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021984	GAA	2	6	290822	290827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021984	GGA	2	6	290858	290863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021984	TAA	2	6	290876	290881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021984	GCA	2	6	290884	290889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_021984	AGA	2	6	290905	290910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021984	CAG	2	6	290931	290936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_021984	G	6	6	291078	291083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021984	GGA	2	6	291122	291127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021984	GGC	2	6	291142	291147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_021984	GAA	2	6	291385	291390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021984	AGA	2	6	291414	291419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021984	TGC	2	6	291461	291466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021984	GTC	2	6	291473	291478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021984	TTG	2	6	291534	291539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021984	GGA	2	6	291586	291591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021984	TCA	2	6	291611	291616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_021984	AC	3	6	291637	291642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_021984	CGT	2	6	291705	291710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021984	AC	3	6	291806	291811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_021984	GTAG	2	8	291847	291854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021984	CCT	2	6	291947	291952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_021984	AAG	2	6	291960	291965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021984	CA	3	6	291982	291987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_021984	TGA	2	6	291995	292000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021984	GGT	2	6	292038	292043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021984	GGT	2	6	292073	292078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021984	AGG	2	6	292252	292257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021984	CCA	2	6	292282	292287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_021984	A	6	6	292305	292310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021984	AAC	2	6	292392	292397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021984	GTT	2	6	292402	292407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021984	TC	3	6	292414	292419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_021984	GAT	2	6	292435	292440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021984	GAG	2	6	292730	292735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021984	TG	3	6	292755	292760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021984	GC	3	6	292782	292787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_021984	G	6	6	292875	292880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021984	TCC	2	6	292885	292890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_021984	CTGA	2	8	292905	292912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1637	NC_021984	GTAC	2	8	292989	292996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1774	NC_021984	TGC	2	6	325974	325979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1795	NC_021984	CGG	2	6	327963	327968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1803	NC_021984	GCT	2	6	328440	328445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_021984	AAC	2	6	384318	384323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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