MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 23922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021984	GC	3	6	79179	79184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021984	TAC	2	6	79242	79247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021984	GTG	2	6	79260	79265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021984	CAA	2	6	79274	79279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021984	CCA	2	6	79393	79398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_021984	GAA	2	6	79400	79405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021984	GCT	2	6	79418	79423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021984	GTG	2	6	79452	79457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021984	GCT	2	6	79472	79477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021984	GTC	2	6	79573	79578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021984	ATC	2	6	79620	79625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021984	ACC	2	6	79629	79634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_021984	CGC	2	6	79671	79676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_021984	GC	3	6	79678	79683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_021984	CGG	2	6	79718	79723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021984	ACG	2	6	79731	79736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021984	CGG	2	6	79822	79827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021984	T	7	7	79884	79890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021984	TAA	2	6	79946	79951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021984	TTA	2	6	80030	80035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021984	T	7	7	81167	81173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021984	AAGCG	2	10	81235	81244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
523	NC_021984	CGG	2	6	82075	82080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021984	T	6	6	84952	84957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021984	TAA	2	6	86215	86220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021984	TAA	2	6	86256	86261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021984	GAA	2	6	86287	86292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021984	TCC	2	6	86302	86307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_021984	ACCC	2	8	86337	86344	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
530	NC_021984	CAG	2	6	86350	86355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021984	GAT	2	6	86365	86370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021984	C	14	14	86376	86389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
533	NC_021984	GGC	2	6	86410	86415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_021984	GAA	2	6	86508	86513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021984	TGG	2	6	86522	86527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021984	GGC	2	6	86544	86549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021984	GC	4	8	86566	86573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_021984	ACG	2	6	86575	86580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021984	CAG	3	9	86625	86633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021984	TGC	2	6	86639	86644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021984	GTACG	2	10	86711	86720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_021984	TA	3	6	86764	86769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021984	CAC	2	6	86773	86778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_021984	GCC	2	6	86811	86816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_021984	AGT	2	6	86888	86893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021984	ATG	2	6	86896	86901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021984	CAG	2	6	87028	87033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021984	ATG	3	9	87037	87045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021984	CCA	2	6	87149	87154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_021984	CGA	2	6	87167	87172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021984	AAC	2	6	87181	87186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021984	CGA	2	6	87206	87211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021984	CATC	2	8	87242	87249	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_021984	AGA	2	6	87260	87265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021984	CGG	2	6	87384	87389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021984	TAG	3	9	87400	87408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021984	CAGAA	2	10	87424	87433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
558	NC_021984	AGG	2	6	87449	87454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021984	CAT	2	6	87459	87464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021984	CCAG	2	8	87536	87543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_021984	GAC	2	6	87561	87566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021984	TAA	2	6	87623	87628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021984	ATT	2	6	87682	87687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021984	A	8	8	87696	87703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021984	T	6	6	87723	87728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021984	ATTT	2	8	87769	87776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021984	GTTT	2	8	87796	87803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021984	TAT	2	6	87807	87812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021984	TTG	2	6	87820	87825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021984	ATG	2	6	87865	87870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021984	T	6	6	87909	87914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021984	ATT	2	6	87921	87926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021984	TTTA	2	8	87951	87958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021984	TTA	2	6	87964	87969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021984	T	6	6	87977	87982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021984	T	6	6	87986	87991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021984	TTG	2	6	88011	88016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021984	TTTC	2	8	88056	88063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_021984	TG	3	6	88109	88114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021984	CCG	2	6	88181	88186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_021984	TGA	2	6	89068	89073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021984	GC	3	6	89077	89082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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584	NC_021984	AGA	2	6	89186	89191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021984	GCT	2	6	89211	89216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_021984	ACG	2	6	89335	89340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_021984	CGG	2	6	89393	89398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021984	CAG	2	6	89450	89455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_021984	CCGCA	2	10	89521	89530	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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595	NC_021984	GCA	2	6	89604	89609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_021984	GC	3	6	89805	89810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_021984	CAA	2	6	89827	89832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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602	NC_021984	CGGTT	2	10	90026	90035	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
603	NC_021984	GCG	2	6	90036	90041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021984	TGCT	2	8	90046	90053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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606	NC_021984	GAA	2	6	90104	90109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021984	CAT	2	6	90149	90154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_021984	TCG	2	6	90270	90275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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612	NC_021984	CTG	2	6	90471	90476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021984	GCC	2	6	90600	90605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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618	NC_021984	GAAT	2	8	90832	90839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021984	TGG	2	6	90853	90858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021984	GCG	3	9	90954	90962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021984	CGA	2	6	90989	90994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021984	AGCA	2	8	90999	91006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_021984	GTAT	2	8	91060	91067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021984	GCTCC	2	10	91162	91171	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
625	NC_021984	A	7	7	91185	91191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021984	GAA	2	6	91205	91210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021984	TCA	2	6	91219	91224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021984	TGA	2	6	91228	91233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_021984	T	6	6	93361	93366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_021984	CAGG	2	8	93441	93448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_021984	A	7	7	93567	93573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021984	ATG	2	6	93611	93616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021984	CAT	2	6	94065	94070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021984	CTGC	2	8	94113	94120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_021984	GC	4	8	94119	94126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_021984	TGCC	2	8	94141	94148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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642	NC_021984	CT	3	6	94238	94243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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928	NC_021984	GGC	2	6	149772	149777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_021984	GCG	2	6	152407	152412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1000	NC_021984	T	8	8	174512	174519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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