MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 7450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021902	ATT	2	6	1621	1626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021902	GTT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021902	CTT	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021902	TAT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021902	ACT	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021902	GGC	2	6	7008	7013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021902	CTT	2	6	9909	9914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021902	GAA	2	6	9942	9947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021902	ATT	2	6	9986	9991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021902	TTA	2	6	10765	10770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021902	TCT	2	6	10776	10781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021902	CTT	2	6	10928	10933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021902	GTA	2	6	10955	10960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021902	TCC	2	6	12445	12450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021902	ACG	2	6	12511	12516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021902	TGT	2	6	14409	14414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021902	TGG	2	6	14482	14487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021902	TCT	2	6	14546	14551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021902	GAT	2	6	16366	16371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021902	TCA	2	6	18705	18710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021902	TCA	2	6	18738	18743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021902	AAC	2	6	18776	18781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021902	CGT	2	6	19952	19957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021902	ATT	2	6	21873	21878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021902	CCT	2	6	24341	24346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021902	ACA	2	6	29427	29432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021902	TGC	2	6	29456	29461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021902	GGC	2	6	29467	29472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021902	TTG	2	6	30920	30925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021902	GGC	2	6	31016	31021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021902	CAC	2	6	32740	32745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021902	AGC	2	6	32874	32879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021902	TAA	2	6	33539	33544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021902	AGC	2	6	33616	33621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021902	GAA	2	6	33834	33839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021902	AGA	2	6	33852	33857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021902	CAA	2	6	34033	34038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021902	CTC	2	6	42490	42495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021902	TTG	2	6	43810	43815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021902	TGA	2	6	43855	43860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021902	AGG	2	6	43936	43941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021902	TCG	2	6	44917	44922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021902	TGC	2	6	44957	44962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021902	GTA	2	6	45035	45040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021902	TGT	2	6	45052	45057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021902	ACG	2	6	45078	45083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021902	TAC	2	6	45100	45105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021902	GCG	2	6	45112	45117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021902	CAC	2	6	47352	47357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021902	CAA	2	6	48501	48506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021902	TTG	2	6	52726	52731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021902	TGG	2	6	52733	52738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021902	ATT	2	6	59008	59013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021902	AAT	2	6	60524	60529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021902	TCT	2	6	61155	61160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021902	ACG	2	6	61811	61816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021902	AGG	2	6	61834	61839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021902	GAC	2	6	61846	61851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021902	ATG	2	6	68743	68748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021902	CTT	2	6	69290	69295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021902	GAA	2	6	69920	69925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021902	CTT	3	9	71677	71685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021902	TCT	2	6	71687	71692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021902	GTC	2	6	72028	72033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021902	ATG	2	6	76102	76107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021902	TTA	2	6	77173	77178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021902	CGT	2	6	77252	77257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021902	GTC	2	6	77298	77303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021902	CGG	2	6	77326	77331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021902	GCA	2	6	77342	77347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021902	ATT	2	6	77544	77549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021902	TGG	2	6	77613	77618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021902	ATA	2	6	77701	77706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021902	GAT	2	6	77771	77776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021902	GGA	2	6	77807	77812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021902	GCG	2	6	77896	77901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021902	CGG	3	9	77926	77934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021902	GCG	2	6	77940	77945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021902	TGC	2	6	77963	77968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021902	GCA	2	6	77978	77983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021902	GAA	2	6	78147	78152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021902	GAT	2	6	78191	78196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021902	CAA	3	9	79396	79404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021902	TGC	2	6	79471	79476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021902	AAG	2	6	79517	79522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021902	CAA	2	6	79582	79587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021902	TGC	2	6	80623	80628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021902	CAC	2	6	80823	80828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021902	TCA	2	6	80969	80974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021902	CTG	2	6	81020	81025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021902	ACC	2	6	81054	81059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_021902	ATC	2	6	81125	81130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021902	TTA	2	6	81161	81166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021902	TAA	2	6	81282	81287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021902	CTA	2	6	81334	81339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021902	GTC	2	6	81364	81369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021902	GTG	3	9	81376	81384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021902	GTC	2	6	81385	81390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021902	CCG	2	6	81434	81439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021902	TGT	2	6	84301	84306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021902	ACT	2	6	84357	84362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021902	TAA	2	6	93043	93048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021902	ATG	2	6	93096	93101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021902	GCC	2	6	93693	93698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021902	ACG	2	6	93750	93755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021902	TCA	2	6	93779	93784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021902	CCT	2	6	93852	93857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021902	CAA	2	6	93974	93979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021902	CAA	2	6	97170	97175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021902	TTA	2	6	100731	100736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021902	CTC	2	6	101136	101141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021902	TCA	2	6	101197	101202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021902	CAT	2	6	101300	101305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021902	ATC	2	6	101341	101346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021902	GGC	2	6	101478	101483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021902	TCA	2	6	101506	101511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021902	TCA	3	9	101599	101607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021902	CTG	2	6	101612	101617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021902	AAC	2	6	101810	101815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021902	GAT	2	6	101840	101845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021902	AGC	2	6	101856	101861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021902	CTG	2	6	101864	101869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021902	ACA	2	6	101978	101983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021902	AGT	2	6	101987	101992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021902	TTC	2	6	102097	102102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021902	TGC	2	6	102141	102146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021902	AAT	2	6	102203	102208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021902	CAA	2	6	102736	102741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021902	ACG	2	6	102811	102816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021902	TGC	2	6	104026	104031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021902	ACG	2	6	104048	104053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021902	AAT	2	6	104070	104075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021902	ACT	2	6	106029	106034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021902	TCT	2	6	108897	108902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021902	TGA	2	6	108943	108948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021902	GCG	2	6	108965	108970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021902	GGC	2	6	110036	110041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021902	CAA	2	6	110100	110105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021902	CCT	2	6	113741	113746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021902	ATA	2	6	115818	115823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021902	TAA	2	6	115917	115922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021902	ATC	2	6	115971	115976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_021902	ACA	2	6	116066	116071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_021902	CCA	2	6	120655	120660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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162	NC_021902	CAA	2	6	121750	121755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021902	ATT	2	6	121801	121806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_021902	CCT	2	6	126638	126643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_021902	ATA	2	6	126687	126692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021902	AAT	2	6	127264	127269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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