MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021902	GT	4	8	1595060	1595067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021902	AGGGA	2	10	1595659	1595668	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021902	GAT	2	6	1595716	1595721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021902	GGCGC	2	10	1595729	1595738	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4005	NC_021902	AG	3	6	1596989	1596994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021902	TCG	2	6	1601210	1601215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_021902	AC	3	6	1601940	1601945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_021902	CA	3	6	1601946	1601951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_021902	AAT	2	6	1601959	1601964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021902	TAA	2	6	1602008	1602013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021902	CAA	2	6	1602038	1602043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021902	A	6	6	1602042	1602047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021902	GTG	2	6	1602171	1602176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021902	AGT	2	6	1602204	1602209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021902	TGT	2	6	1602216	1602221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021902	ATA	2	6	1602236	1602241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021902	TAA	2	6	1602272	1602277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021902	GAG	2	6	1602312	1602317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021902	A	6	6	1602337	1602342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021902	T	6	6	1602343	1602348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021902	A	6	6	1602430	1602435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021902	ATGA	2	8	1603438	1603445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021902	TCCTT	2	10	1603480	1603489	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4024	NC_021902	CCA	2	6	1603507	1603512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_021902	CTC	2	6	1603517	1603522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4028	NC_021902	CAT	2	6	1603582	1603587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4031	NC_021902	A	6	6	1604272	1604277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021902	GGC	2	6	1604341	1604346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_021902	CTTCA	2	10	1604512	1604521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4034	NC_021902	GC	3	6	1604595	1604600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4039	NC_021902	TG	3	6	1604772	1604777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021902	TAG	2	6	1604786	1604791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4042	NC_021902	CAT	2	6	1604825	1604830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_021902	TG	3	6	1604843	1604848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021902	GTT	2	6	1604890	1604895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4047	NC_021902	TAA	2	6	1605208	1605213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4050	NC_021902	CT	3	6	1605307	1605312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_021902	GGC	2	6	1605338	1605343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4054	NC_021902	TA	3	6	1605426	1605431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021902	ATGT	2	8	1605443	1605450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021902	CTA	2	6	1605465	1605470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4059	NC_021902	CGAT	2	8	1608687	1608694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_021902	TTGAT	2	10	1608768	1608777	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021902	AAT	2	6	1608792	1608797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021902	TAT	2	6	1608828	1608833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021902	GTT	2	6	1608843	1608848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021902	AC	3	6	1608899	1608904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_021902	TTG	2	6	1608982	1608987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021902	GC	3	6	1609047	1609052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_021902	TCA	2	6	1609346	1609351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4072	NC_021902	T	6	6	1611264	1611269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021902	TTAT	2	8	1611274	1611281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021902	ATAA	2	8	1612653	1612660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021902	T	7	7	1612682	1612688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021902	GAAA	2	8	1612736	1612743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021902	TAT	2	6	1612765	1612770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_021902	TGA	2	6	1613680	1613685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4081	NC_021902	A	6	6	1614942	1614947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021902	GC	3	6	1615041	1615046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_021902	CTTTT	2	10	1615050	1615059	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4084	NC_021902	T	7	7	1615076	1615082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021902	TAACGT	2	12	1615089	1615100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4090	NC_021902	CAA	2	6	1618164	1618169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021902	AGGG	2	8	1620169	1620176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021902	CGTT	2	8	1620184	1620191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_021902	AGTA	2	8	1620235	1620242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021902	CGT	2	6	1620271	1620276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_021902	AGA	2	6	1623095	1623100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021902	GCC	2	6	1623163	1623168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_021902	TAA	2	6	1624227	1624232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021902	ATT	2	6	1627889	1627894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021902	A	6	6	1627988	1627993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021902	TGGT	2	8	1628687	1628694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021902	CAG	2	6	1628712	1628717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_021902	GGA	2	6	1628746	1628751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021902	GTCGC	2	10	1629772	1629781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4105	NC_021902	ACTC	2	8	1629848	1629855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_021902	TG	3	6	1629927	1629932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021902	TTA	2	6	1629934	1629939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021902	TGCGG	2	10	1629967	1629976	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4109	NC_021902	T	6	6	1632511	1632516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021902	TCCC	2	8	1632523	1632530	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4111	NC_021902	GAGG	2	8	1632536	1632543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021902	GTG	2	6	1634871	1634876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021902	CG	3	6	1634887	1634892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_021902	TGCAAA	2	12	1634917	1634928	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4115	NC_021902	AAT	2	6	1634937	1634942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021902	AT	3	6	1634950	1634955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021902	TA	3	6	1634965	1634970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021902	ATA	2	6	1634979	1634984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021902	GTT	2	6	1640349	1640354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021902	ATA	2	6	1640386	1640391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021902	ATT	2	6	1640399	1640404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021902	T	6	6	1640410	1640415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021902	TG	3	6	1641771	1641776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021902	TATC	2	8	1644603	1644610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_021902	A	7	7	1644654	1644660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021902	TCTG	2	8	1645953	1645960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_021902	TTA	2	6	1646956	1646961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021902	CAG	3	9	1646990	1646998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021902	ATA	2	6	1647086	1647091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021902	ATT	2	6	1647095	1647100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021902	AAG	2	6	1647117	1647122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021902	GAA	2	6	1647139	1647144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021902	TG	3	6	1647166	1647171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4394	NC_021902	TCG	2	6	1760888	1760893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4396	NC_021902	GGCG	2	8	1765398	1765405	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4398	NC_021902	ATT	2	6	1765439	1765444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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