MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021902	CAT	2	6	1204141	1204146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021902	CGC	2	6	1204150	1204155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_021902	AACG	2	8	1205154	1205161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_021902	ACGC	2	8	1205755	1205762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_021902	TAA	2	6	1205775	1205780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021902	GCG	2	6	1207086	1207091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_021902	AAAG	2	8	1207093	1207100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021902	GA	3	6	1209614	1209619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021902	TCT	3	9	1209622	1209630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_021902	GTC	2	6	1209631	1209636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021902	GAA	2	6	1209642	1209647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021902	TCC	2	6	1212321	1212326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_021902	ATAA	2	8	1212327	1212334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021902	CTC	2	6	1212535	1212540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_021902	GTA	2	6	1212560	1212565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021902	TGA	2	6	1218768	1218773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021902	AAT	2	6	1218796	1218801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021902	A	6	6	1219212	1219217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021902	TTAT	2	8	1219269	1219276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021902	GTT	2	6	1219283	1219288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021902	CTT	2	6	1219291	1219296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_021902	ATATA	2	10	1219330	1219339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021902	CTA	2	6	1219343	1219348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_021902	TAA	2	6	1219411	1219416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021902	ATC	2	6	1219994	1219999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_021902	A	7	7	1220034	1220040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021902	TA	3	6	1220046	1220051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021902	A	8	8	1225925	1225932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021902	GGC	2	6	1225940	1225945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_021902	GTT	2	6	1225965	1225970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021902	TCT	2	6	1227429	1227434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_021902	A	7	7	1233270	1233276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021902	CGG	2	6	1233340	1233345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021902	C	6	6	1234746	1234751	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3035	NC_021902	TGCTC	2	10	1234824	1234833	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3036	NC_021902	AGG	2	6	1234836	1234841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021902	CGG	2	6	1236008	1236013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021902	AT	3	6	1236039	1236044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021902	AC	3	6	1236084	1236089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_021902	AAT	2	6	1236511	1236516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021902	CCA	2	6	1236538	1236543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_021902	A	7	7	1236552	1236558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021902	AGA	2	6	1236573	1236578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021902	GCG	2	6	1236606	1236611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_021902	G	6	6	1238034	1238039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021902	ATAA	2	8	1238905	1238912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021902	TGG	2	6	1241616	1241621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021902	CT	3	6	1241733	1241738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_021902	GCC	2	6	1241740	1241745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_021902	GAT	2	6	1242643	1242648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021902	AAT	2	6	1242655	1242660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021902	TCAG	2	8	1242683	1242690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_021902	GCC	2	6	1242811	1242816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_021902	CAA	2	6	1242860	1242865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_021902	GC	3	6	1242899	1242904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_021902	AC	3	6	1242930	1242935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_021902	AAC	2	6	1242968	1242973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_021902	AC	4	8	1242972	1242979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_021902	GGC	2	6	1243839	1243844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_021902	GTA	2	6	1243952	1243957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021902	GAG	2	6	1244914	1244919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021902	CTT	2	6	1244934	1244939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_021902	CT	3	6	1244947	1244952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_021902	GAAA	2	8	1245042	1245049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021902	TTA	2	6	1245825	1245830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021902	TG	3	6	1245875	1245880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021902	GTCTG	2	10	1245884	1245893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_021902	AGA	2	6	1247833	1247838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021902	T	6	6	1247905	1247910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021902	T	6	6	1247940	1247945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021902	A	6	6	1248118	1248123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021902	TGT	2	6	1248131	1248136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021902	CTC	2	6	1251280	1251285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_021902	TTA	2	6	1255289	1255294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021902	ACT	2	6	1258381	1258386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021902	AGG	2	6	1262816	1262821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021902	T	8	8	1262839	1262846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021902	GCAG	2	8	1262942	1262949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_021902	T	6	6	1264797	1264802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021902	GCGCT	2	10	1268758	1268767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3081	NC_021902	CAC	2	6	1268815	1268820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_021902	CAA	2	6	1268828	1268833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_021902	CAA	2	6	1271241	1271246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_021902	A	7	7	1273026	1273032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021902	GC	3	6	1273926	1273931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_021902	CGC	2	6	1273979	1273984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_021902	AAC	2	6	1274144	1274149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_021902	ATA	2	6	1274191	1274196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021902	AATG	2	8	1274204	1274211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021902	AAT	2	6	1274277	1274282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021902	TGTGT	2	10	1275149	1275158	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021902	TAT	2	6	1276851	1276856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021902	AATGA	2	10	1276860	1276869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021902	ATCA	2	8	1276944	1276951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_021902	CTG	2	6	1276979	1276984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_021902	TG	3	6	1277852	1277857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021902	GGC	2	6	1278006	1278011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021902	AGC	2	6	1278046	1278051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_021902	TGC	2	6	1278053	1278058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021902	ACT	2	6	1278120	1278125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021902	CGA	2	6	1278245	1278250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021902	GCA	2	6	1278319	1278324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_021902	GAA	2	6	1278378	1278383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021902	GGA	2	6	1278414	1278419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021902	TAA	2	6	1278432	1278437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021902	AGA	2	6	1278461	1278466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021902	CAG	2	6	1278487	1278492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_021902	G	6	6	1278634	1278639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021902	GGA	2	6	1278678	1278683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021902	GGC	2	6	1278698	1278703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_021902	GAA	2	6	1278941	1278946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021902	TGC	2	6	1279017	1279022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_021902	GTC	2	6	1279029	1279034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021902	TTG	2	6	1279090	1279095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021902	GGA	2	6	1279142	1279147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021902	TCA	2	6	1279167	1279172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021902	AC	3	6	1279193	1279198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_021902	CGT	2	6	1279261	1279266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_021902	AC	3	6	1279362	1279367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_021902	GTAG	2	8	1279403	1279410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021902	CCT	2	6	1279503	1279508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_021902	CA	3	6	1279538	1279543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_021902	TGA	2	6	1279551	1279556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021902	GGT	2	6	1279594	1279599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021902	GGT	2	6	1279629	1279634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021902	TGT	2	6	1279674	1279679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021902	GCTTC	2	10	1279704	1279713	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3128	NC_021902	CGC	2	6	1279718	1279723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_021902	AGG	2	6	1279806	1279811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021902	CCA	2	6	1279836	1279841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3132	NC_021902	AAC	2	6	1279946	1279951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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