MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021902	TCA	2	6	496276	496281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021902	CGG	2	6	496465	496470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021902	CA	3	6	496484	496489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_021902	GCCG	2	8	496494	496501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_021902	TG	3	6	496624	496629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021902	GGC	2	6	496778	496783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021902	AGC	2	6	496818	496823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021902	TGC	2	6	496825	496830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021902	ACT	2	6	496892	496897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021902	CGA	2	6	497017	497022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021902	GCA	2	6	497091	497096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021902	GAA	2	6	497150	497155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021902	GGA	2	6	497186	497191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021902	TAA	2	6	497204	497209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021902	GCA	2	6	497212	497217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021902	AGA	2	6	497233	497238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021902	CAG	2	6	497259	497264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021902	G	6	6	497406	497411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021902	GGA	2	6	497450	497455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021902	AGCA	2	8	497517	497524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_021902	GAA	2	6	497714	497719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021902	TGC	2	6	497790	497795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021902	GTC	2	6	497802	497807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021902	TTG	2	6	497863	497868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021902	GGA	2	6	497915	497920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021902	TCA	2	6	497940	497945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021902	AC	3	6	497966	497971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_021902	CGT	2	6	498034	498039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021902	AC	3	6	498135	498140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_021902	GTAG	2	8	498176	498183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021902	CCT	2	6	498276	498281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_021902	GAAA	2	8	498287	498294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021902	CA	3	6	498311	498316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_021902	TGA	2	6	498324	498329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021902	GAA	2	6	498370	498375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021902	CGG	2	6	498492	498497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021902	AAC	2	6	498645	498650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021902	GTT	2	6	498655	498660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021902	TC	3	6	498667	498672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_021902	GCG	2	6	498957	498962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021902	GAG	2	6	498973	498978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021902	TG	3	6	498998	499003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021902	GC	3	6	499025	499030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_021902	G	6	6	499118	499123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021902	TCC	2	6	499128	499133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_021902	CTGA	2	8	499148	499155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_021902	GTAC	2	8	499232	499239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_021902	TG	3	6	499264	499269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021902	GGA	2	6	499439	499444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021902	AC	3	6	499657	499662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_021902	CGTC	2	8	499675	499682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021902	AAC	2	6	499694	499699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021902	AGC	2	6	499784	499789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_021902	CAT	2	6	499790	499795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021902	AAAG	2	8	499798	499805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021902	AGCGA	2	10	499924	499933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_021902	AGTCG	2	10	499951	499960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_021902	CGTT	2	8	499972	499979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_021902	G	6	6	500216	500221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021902	GT	4	8	500274	500281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021902	GAC	2	6	500318	500323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021902	CAA	2	6	500344	500349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021902	GGT	2	6	500416	500421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021902	GA	3	6	500446	500451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021902	AGTC	2	8	500542	500549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_021902	GCTG	2	8	500560	500567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_021902	TTA	2	6	500575	500580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021902	CGG	2	6	500699	500704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_021902	ATG	2	6	500775	500780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021902	ACC	2	6	500970	500975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_021902	TGG	2	6	501030	501035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021902	TCC	2	6	501056	501061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021902	GGA	2	6	501073	501078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021902	AGG	2	6	501111	501116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021902	GGT	2	6	501193	501198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021902	CGG	2	6	501280	501285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_021902	TCA	2	6	501308	501313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021902	CGT	2	6	501388	501393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021902	G	6	6	501437	501442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021902	GAC	3	9	501619	501627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021902	GT	3	6	501641	501646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021902	ACA	2	6	501735	501740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021902	GGC	2	6	501787	501792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021902	TGAC	2	8	501827	501834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_021902	AGC	2	6	501844	501849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021902	GGC	2	6	501901	501906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021902	GGT	2	6	501915	501920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021902	GCA	2	6	502091	502096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_021902	CGCC	2	8	502122	502129	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1090	NC_021902	GAA	2	6	502155	502160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021902	CGTC	2	8	502164	502171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_021902	T	6	6	502181	502186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021902	GT	3	6	502189	502194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021902	AGCGC	2	10	502222	502231	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_021902	CCG	2	6	502248	502253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_021902	GCA	2	6	502295	502300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021902	T	6	6	502755	502760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021902	TTCTA	2	10	502767	502776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_021902	TCT	2	6	503832	503837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021902	T	6	6	503893	503898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021902	TCA	2	6	503915	503920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021902	ATTTA	2	10	503930	503939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021902	AATTA	2	10	503965	503974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021902	TTTTGA	2	12	503989	504000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021902	AGT	2	6	504011	504016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021902	TTCG	2	8	504052	504059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_021902	CAA	2	6	504080	504085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021902	GAG	2	6	504087	504092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021902	CAC	2	6	505704	505709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_021902	GCGCT	2	10	510202	510211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_021902	ACA	2	6	514108	514113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021902	TCTT	2	8	514141	514148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_021902	GAAG	2	8	514168	514175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021902	GGC	2	6	514199	514204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021902	CAG	2	6	514263	514268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021902	TCA	2	6	516773	516778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021902	TAA	2	6	516794	516799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021902	ATG	2	6	516839	516844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021902	GAC	2	6	516882	516887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021902	ATT	2	6	516942	516947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021902	AG	3	6	517543	517548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021902	TGT	2	6	522865	522870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021902	CAA	2	6	522906	522911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021902	GTT	2	6	522919	522924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021902	TGT	2	6	522996	523001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021902	TG	3	6	523004	523009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021902	GAG	2	6	523032	523037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021902	CCG	2	6	523106	523111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_021902	CCG	2	6	523131	523136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_021902	TA	3	6	523218	523223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021902	CGG	2	6	527373	527378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021902	G	6	6	527377	527382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021902	AAT	2	6	527407	527412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021902	AAT	2	6	530340	530345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021902	AAG	2	6	530364	530369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021902	CAG	2	6	530420	530425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021902	GCT	2	6	535989	535994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_021902	A	6	6	539225	539230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_021902	AATA	2	8	540607	540614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_021902	TGC	2	6	540690	540695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_021902	TTA	2	6	580487	580492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_021902	TGA	2	6	580601	580606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_021902	TAT	2	6	580645	580650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_021902	AAT	2	6	580672	580677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_021902	A	7	7	580694	580700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_021902	TTAA	2	8	580713	580720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_021902	TGT	2	6	580733	580738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_021902	CGT	2	6	580755	580760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_021902	ACA	2	6	580923	580928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_021902	TTG	2	6	580959	580964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_021902	TAA	2	6	581020	581025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_021902	ATT	2	6	581030	581035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_021902	TAA	2	6	581143	581148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_021902	CGGA	2	8	581172	581179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1270	NC_021902	AGG	2	6	581199	581204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_021902	A	6	6	581254	581259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_021902	AGA	2	6	581302	581307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_021902	AGA	2	6	581335	581340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_021902	ATT	2	6	581432	581437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_021902	TG	3	6	641478	641483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_021902	AAT	2	6	641517	641522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_021902	A	7	7	641595	641601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_021902	TAT	2	6	641637	641642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_021902	GCA	2	6	641649	641654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_021902	CCG	2	6	644016	644021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1411	NC_021902	ATT	2	6	644089	644094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_021902	ATT	2	6	644098	644103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_021902	T	6	6	644102	644107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_021902	CCG	2	6	644148	644153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1443	NC_021902	TAA	2	6	652130	652135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_021902	AAT	2	6	654871	654876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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