MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021902	T	7	7	230491	230497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021902	CA	3	6	233655	233660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_021902	CAT	2	6	234042	234047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021902	GGC	2	6	236570	236575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021902	TAAA	2	8	238656	238663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021902	CTA	2	6	239268	239273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021902	A	8	8	239358	239365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021902	CAGG	2	8	239376	239383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_021902	A	6	6	239638	239643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021902	T	6	6	239681	239686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021902	TTTTA	2	10	239823	239832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021902	CGGG	2	8	239856	239863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
513	NC_021902	G	6	6	240279	240284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021902	CGC	2	6	240290	240295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_021902	TACGC	2	10	240327	240336	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
516	NC_021902	TTA	3	9	242427	242435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021902	AAT	2	6	242447	242452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021902	TGAA	2	8	242500	242507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021902	AAT	2	6	242513	242518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021902	AAT	2	6	242545	242550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021902	GCC	2	6	242569	242574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_021902	CGGTA	2	10	242580	242589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
523	NC_021902	T	6	6	243271	243276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021902	GAA	2	6	243323	243328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021902	GTAA	2	8	243354	243361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021902	ATAA	2	8	243376	243383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021902	AAT	2	6	243388	243393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021902	TTCA	2	8	246811	246818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021902	AAT	2	6	246824	246829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021902	T	8	8	247769	247776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021902	A	7	7	247808	247814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021902	TAA	2	6	247819	247824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021902	ATTTA	2	10	247836	247845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021902	GAA	2	6	247857	247862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021902	ATA	2	6	247863	247868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021902	ATTA	2	8	247870	247877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021902	TAA	2	6	247892	247897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021902	A	6	6	247896	247901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021902	TAAC	2	8	247956	247963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_021902	ATT	2	6	247965	247970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021902	TA	4	8	247973	247980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021902	T	6	6	248665	248670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021902	ATT	2	6	249408	249413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021902	GGAA	2	8	251949	251956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021902	T	6	6	253618	253623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021902	TCT	2	6	253631	253636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021902	GTTT	2	8	253783	253790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021902	TTCG	2	8	255603	255610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021902	T	7	7	255681	255687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021902	AGCGA	2	10	255741	255750	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
551	NC_021902	GA	3	6	255749	255754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021902	T	6	6	255850	255855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021902	AGCGA	2	10	255909	255918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
554	NC_021902	GA	3	6	255917	255922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021902	T	7	7	258276	258282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021902	ACG	2	6	259653	259658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021902	T	6	6	259719	259724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021902	GAAA	2	8	259809	259816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021902	CTG	2	6	259906	259911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021902	T	7	7	259929	259935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021902	TTTG	2	8	259940	259947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021902	GTT	2	6	259960	259965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021902	ACT	2	6	260091	260096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021902	A	6	6	260110	260115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021902	A	6	6	260117	260122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021902	ACA	2	6	260156	260161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_021902	AGA	2	6	260179	260184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021902	GAA	2	6	260199	260204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021902	AGCGC	2	10	261833	261842	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
570	NC_021902	GA	4	8	261932	261939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021902	GGC	2	6	265903	265908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021902	CT	3	6	267311	267316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_021902	TGC	2	6	267326	267331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021902	GAG	2	6	267590	267595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021902	CAG	2	6	267736	267741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021902	CGG	2	6	267790	267795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021902	CCG	2	6	268052	268057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_021902	ATG	2	6	271700	271705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021902	CGT	2	6	282350	282355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021902	AGCGC	2	10	282366	282375	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
581	NC_021902	CT	3	6	282428	282433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_021902	GGC	2	6	282461	282466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021902	TGT	2	6	284579	284584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021902	ATG	2	6	286025	286030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021902	ATT	2	6	286038	286043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021902	CTT	2	6	286047	286052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021902	TTA	2	6	286133	286138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021902	TTG	2	6	286145	286150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021902	GCC	2	6	287655	287660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_021902	AAT	2	6	288694	288699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021902	ATT	2	6	288716	288721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021902	T	7	7	288720	288726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021902	TCC	2	6	289675	289680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_021902	GAA	2	6	289719	289724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021902	GAT	2	6	291818	291823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_021902	A	7	7	293250	293256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021902	AGCC	2	8	293280	293287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_021902	TAAA	2	8	293350	293357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021902	ATGAG	2	10	293388	293397	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021902	CCG	2	6	293421	293426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_021902	GAC	2	6	293475	293480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021902	CGTG	2	8	293483	293490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_021902	GCA	2	6	293498	293503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021902	TCA	2	6	294557	294562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021902	TAT	2	6	295524	295529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021902	TAA	2	6	295586	295591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021902	GCG	2	6	295641	295646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021902	TACA	2	8	295755	295762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_021902	TCG	2	6	295782	295787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021902	T	6	6	295810	295815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021902	T	6	6	295835	295840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021902	ATTAA	2	10	295898	295907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021902	TAA	2	6	295936	295941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021902	CTT	2	6	296070	296075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021902	TAT	2	6	296115	296120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021902	TGC	2	6	297143	297148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021902	GCAG	2	8	297178	297185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
619	NC_021902	CGC	2	6	297213	297218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_021902	TCT	2	6	297260	297265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021902	ATTAAG	2	12	297281	297292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021902	A	6	6	297327	297332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021902	TCG	2	6	297357	297362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021902	CGT	2	6	300662	300667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021902	A	6	6	300773	300778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021902	ATA	2	6	300947	300952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021902	T	8	8	301744	301751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021902	ATA	3	9	301793	301801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021902	GGAT	2	8	302847	302854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021902	A	6	6	302855	302860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021902	ACAA	2	8	302885	302892	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_021902	ACTC	2	8	303773	303780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021902	AGG	2	6	303791	303796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021902	TTA	2	6	305152	305157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021902	GAA	2	6	305172	305177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021902	AGG	2	6	308662	308667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021902	TAT	2	6	309329	309334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021902	GAT	2	6	309335	309340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021902	TAA	2	6	309383	309388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021902	AGAAA	2	10	309390	309399	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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