MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021902	AGA	2	6	2680469	2680474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_021902	CGT	2	6	2688554	2688559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_021902	ATG	2	6	2688580	2688585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_021902	TTC	2	6	2688587	2688592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_021902	A	6	6	2689534	2689539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021902	CATTAA	2	12	2690396	2690407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7007	NC_021902	CA	3	6	2690421	2690426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_021902	A	7	7	2690491	2690497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_021902	CGC	2	6	2690582	2690587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_021902	GCG	2	6	2690595	2690600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_021902	CTC	2	6	2691345	2691350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_021902	TC	3	6	2691349	2691354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_021902	TCAA	2	8	2691369	2691376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7014	NC_021902	AGG	2	6	2691404	2691409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021902	TGC	2	6	2691444	2691449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_021902	GGT	2	6	2691463	2691468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_021902	ATTA	2	8	2691522	2691529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_021902	CAC	2	6	2691594	2691599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_021902	CA	3	6	2691607	2691612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_021902	CCG	2	6	2691684	2691689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_021902	TTCCCC	2	12	2693310	2693321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_021902	GCC	2	6	2693356	2693361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_021902	ATAA	2	8	2693589	2693596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021902	ATC	2	6	2693665	2693670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_021902	CGG	2	6	2693678	2693683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_021902	GAC	2	6	2694812	2694817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_021902	GCT	2	6	2694841	2694846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_021902	ACT	2	6	2694851	2694856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_021902	TTA	2	6	2694884	2694889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_021902	AAT	3	9	2694899	2694907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_021902	ATT	2	6	2694909	2694914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021902	CTTAA	2	10	2694977	2694986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7033	NC_021902	TCCT	2	8	2697930	2697937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7034	NC_021902	AAC	2	6	2697952	2697957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_021902	GAA	2	6	2697974	2697979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7037	NC_021902	AAAT	2	8	2698026	2698033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7039	NC_021902	ATG	2	6	2698187	2698192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_021902	GCC	2	6	2698246	2698251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_021902	T	6	6	2698253	2698258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_021902	AAT	2	6	2699330	2699335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_021902	GGC	2	6	2699382	2699387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_021902	C	6	6	2699423	2699428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7045	NC_021902	GCC	2	6	2699470	2699475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_021902	TAT	2	6	2700766	2700771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_021902	CGC	3	9	2700801	2700809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7048	NC_021902	CCG	2	6	2700885	2700890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_021902	TTGC	2	8	2700892	2700899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7050	NC_021902	GAA	2	6	2700926	2700931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_021902	AAC	2	6	2700943	2700948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_021902	TC	3	6	2700958	2700963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_021902	A	6	6	2707645	2707650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021902	CG	3	6	2707651	2707656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_021902	AC	3	6	2707677	2707682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_021902	TAT	2	6	2707755	2707760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_021902	ATG	2	6	2707799	2707804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_021902	AATG	2	8	2707817	2707824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_021902	CGT	2	6	2707838	2707843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_021902	TGC	3	9	2707859	2707867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_021902	TGC	2	6	2707935	2707940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_021902	CCG	2	6	2707967	2707972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_021902	T	6	6	2707984	2707989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021902	GCC	2	6	2709485	2709490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_021902	GC	3	6	2709510	2709515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_021902	GCT	2	6	2711021	2711026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_021902	GTT	2	6	2711054	2711059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_021902	CAA	2	6	2711123	2711128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_021902	CAT	2	6	2711999	2712004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_021902	CCT	2	6	2712069	2712074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_021902	AAT	2	6	2712088	2712093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021902	GGC	2	6	2712108	2712113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_021902	GAGT	2	8	2712118	2712125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_021902	AGT	2	6	2712197	2712202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021902	GTT	2	6	2712206	2712211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_021902	TA	3	6	2712260	2712265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_021902	CTG	2	6	2712381	2712386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_021902	ATT	2	6	2712396	2712401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_021902	GCG	2	6	2712422	2712427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_021902	CCT	2	6	2712835	2712840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7081	NC_021902	ACA	2	6	2712897	2712902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_021902	TTG	2	6	2712992	2712997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7084	NC_021902	CTT	2	6	2713024	2713029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_021902	ATA	2	6	2713077	2713082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_021902	TAAT	2	8	2713090	2713097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_021902	ATG	3	9	2713113	2713121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7090	NC_021902	ATA	2	6	2713301	2713306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_021902	ACC	2	6	2713315	2713320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7092	NC_021902	AT	3	6	2714385	2714390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_021902	AAT	2	6	2714401	2714406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_021902	AGTATA	2	12	2714457	2714468	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021902	AAT	2	6	2714528	2714533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021902	ATT	2	6	2714545	2714550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021902	CAT	2	6	2714553	2714558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_021902	ACG	2	6	2714565	2714570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_021902	GGC	2	6	2716815	2716820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_021902	TGAC	2	8	2717459	2717466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7101	NC_021902	ATG	2	6	2719416	2719421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_021902	ATA	2	6	2719430	2719435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021902	AGCGC	2	10	2719489	2719498	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7104	NC_021902	A	7	7	2719504	2719510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_021902	GTT	2	6	2721193	2721198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_021902	CTT	2	6	2722776	2722781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_021902	GTT	2	6	2722783	2722788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_021902	ATT	2	6	2722865	2722870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_021902	T	6	6	2722869	2722874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_021902	AG	3	6	2726555	2726560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_021902	AGGA	2	8	2730882	2730889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_021902	TAA	2	6	2732646	2732651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_021902	T	6	6	2732713	2732718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021902	CAG	2	6	2732719	2732724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_021902	TAA	2	6	2732770	2732775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_021902	TTG	2	6	2732781	2732786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_021902	ACCG	2	8	2732834	2732841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7118	NC_021902	GCA	2	6	2732861	2732866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_021902	TTC	2	6	2732867	2732872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_021902	CCTT	2	8	2734400	2734407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7121	NC_021902	GAA	2	6	2735847	2735852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_021902	ATC	2	6	2735956	2735961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_021902	TAAAA	2	10	2735964	2735973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021902	TAA	2	6	2736001	2736006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_021902	ACAA	2	8	2736031	2736038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_021902	CT	3	6	2738699	2738704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7127	NC_021902	CATT	2	8	2738803	2738810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7128	NC_021902	G	6	6	2740303	2740308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_021902	TTTATG	2	12	2740323	2740334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_021902	CTTT	2	8	2740468	2740475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7397	NC_021902	GAT	2	6	2824299	2824304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7398	NC_021902	TAAG	2	8	2825115	2825122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_021902	GCCT	2	8	2825908	2825915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7400	NC_021902	CTC	2	6	2828620	2828625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7402	NC_021902	AAC	2	6	2828706	2828711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7403	NC_021902	ATAA	2	8	2828769	2828776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7435	NC_021902	TC	3	6	2835374	2835379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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