MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021902	T	6	6	2001048	2001053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021902	G	7	7	2001150	2001156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021902	TGA	2	6	2001211	2001216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021902	GGA	2	6	2001226	2001231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021902	GTTT	2	8	2003933	2003940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021902	CCA	2	6	2007093	2007098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_021902	TAAA	2	8	2007110	2007117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021902	CCT	2	6	2007146	2007151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_021902	TA	3	6	2007422	2007427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021902	AGGCG	2	10	2007508	2007517	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5011	NC_021902	CAGG	2	8	2007526	2007533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_021902	G	6	6	2007532	2007537	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021902	GTTA	2	8	2007622	2007629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021902	GATT	2	8	2007646	2007653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021902	GAC	2	6	2007711	2007716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_021902	T	7	7	2010391	2010397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021902	TCA	2	6	2010466	2010471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021902	G	6	6	2010485	2010490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021902	A	8	8	2010498	2010505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021902	A	7	7	2010556	2010562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021902	AGT	2	6	2010584	2010589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021902	TTC	2	6	2010610	2010615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021902	T	6	6	2010701	2010706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021902	AT	3	6	2010708	2010713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021902	TGG	2	6	2010721	2010726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021902	ATA	2	6	2010800	2010805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021902	TA	3	6	2010808	2010813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021902	ATT	2	6	2010833	2010838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021902	GTT	2	6	2010887	2010892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021902	CAG	2	6	2011242	2011247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021902	CAGA	2	8	2011251	2011258	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_021902	T	6	6	2011271	2011276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021902	GA	3	6	2011283	2011288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021902	TCA	2	6	2011394	2011399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_021902	AAG	2	6	2011419	2011424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021902	G	7	7	2011480	2011486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021902	TCG	2	6	2011530	2011535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021902	C	7	7	2011585	2011591	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5039	NC_021902	A	8	8	2011611	2011618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021902	G	7	7	2011661	2011667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021902	AC	3	6	2011695	2011700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_021902	TGC	2	6	2011749	2011754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021902	G	6	6	2011765	2011770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021902	CTA	2	6	2011781	2011786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_021902	TCAT	2	8	2014474	2014481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_021902	A	6	6	2014497	2014502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021902	GCC	2	6	2014529	2014534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_021902	GAG	2	6	2014546	2014551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021902	CTT	2	6	2014828	2014833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_021902	AC	3	6	2014896	2014901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_021902	CGC	2	6	2014907	2014912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_021902	TAC	2	6	2014933	2014938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021902	GCA	2	6	2015044	2015049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_021902	A	6	6	2015066	2015071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021902	AAT	2	6	2015826	2015831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021902	CAGG	2	8	2019355	2019362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_021902	ACG	2	6	2019374	2019379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_021902	T	6	6	2019407	2019412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021902	GTT	2	6	2020418	2020423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021902	A	7	7	2020463	2020469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021902	ATC	2	6	2020538	2020543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021902	TTAA	2	8	2020551	2020558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021902	CT	3	6	2020600	2020605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_021902	TGT	2	6	2020621	2020626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021902	CTG	2	6	2020659	2020664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021902	GAA	2	6	2020684	2020689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021902	A	6	6	2020688	2020693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021902	TATG	2	8	2020700	2020707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021902	TGC	2	6	2020708	2020713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021902	CATG	2	8	2020719	2020726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_021902	TCT	2	6	2020815	2020820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021902	GC	3	6	2020839	2020844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_021902	CAGG	2	8	2020912	2020919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_021902	AG	3	6	2020936	2020941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021902	CAA	2	6	2025702	2025707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021902	TCT	2	6	2025720	2025725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021902	ATG	2	6	2027801	2027806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021902	TGA	3	9	2027825	2027833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021902	GTT	2	6	2027894	2027899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021902	GTC	2	6	2027903	2027908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_021902	TCA	2	6	2027956	2027961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_021902	ATC	2	6	2027977	2027982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_021902	TAT	2	6	2028002	2028007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021902	T	7	7	2029360	2029366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021902	AAT	2	6	2029387	2029392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021902	CCCTA	2	10	2029393	2029402	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5087	NC_021902	AT	4	8	2029464	2029471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021902	TA	3	6	2029496	2029501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021902	T	8	8	2029525	2029532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021902	AGC	2	6	2029539	2029544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_021902	AGA	2	6	2033604	2033609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021902	AT	3	6	2033709	2033714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021902	AAATC	2	10	2033732	2033741	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5095	NC_021902	ATG	2	6	2033804	2033809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021902	AAT	2	6	2035056	2035061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021902	AAAAT	2	10	2035091	2035100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021902	CTC	2	6	2035124	2035129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_021902	TC	3	6	2035135	2035140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_021902	GCA	2	6	2036732	2036737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_021902	CAG	3	9	2036759	2036767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_021902	A	6	6	2037817	2037822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021902	T	6	6	2038054	2038059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021902	TGT	2	6	2038079	2038084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021902	AAT	2	6	2038097	2038102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021902	A	6	6	2038247	2038252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021902	AAT	2	6	2038287	2038292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021902	T	6	6	2039300	2039305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021902	ACCT	2	8	2041629	2041636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_021902	T	6	6	2041648	2041653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021902	TGC	2	6	2042499	2042504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_021902	CT	4	8	2042546	2042553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_021902	TTA	2	6	2042554	2042559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021902	CGA	2	6	2042566	2042571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_021902	TAA	2	6	2042686	2042691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021902	AAAT	2	8	2042692	2042699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021902	T	6	6	2042725	2042730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021902	CTC	2	6	2042736	2042741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_021902	CTG	2	6	2042742	2042747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_021902	TTAA	2	8	2042753	2042760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021902	CAA	2	6	2042772	2042777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_021902	AATT	2	8	2042799	2042806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021902	CAA	2	6	2042813	2042818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021902	TTA	2	6	2042835	2042840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021902	ATAA	2	8	2042863	2042870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021902	CGG	2	6	2044781	2044786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_021902	TGT	2	6	2045576	2045581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021902	GCG	2	6	2045624	2045629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_021902	TGTC	2	8	2045680	2045687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_021902	GTG	2	6	2045707	2045712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021902	T	6	6	2046817	2046822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021902	T	6	6	2046859	2046864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021902	GAGTT	2	10	2046867	2046876	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_021902	AAG	2	6	2093356	2093361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_021902	TGAA	2	8	2093373	2093380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_021902	GCG	2	6	2093424	2093429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_021902	ACA	2	6	2093457	2093462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_021902	TTCT	2	8	2093502	2093509	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5259	NC_021902	TA	3	6	2093527	2093532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_021902	GTT	2	6	2093535	2093540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_021902	GC	3	6	2093808	2093813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_021902	TGC	3	9	2093850	2093858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5391	NC_021902	T	7	7	2131048	2131054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5395	NC_021902	GTT	2	6	2132254	2132259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_021902	TAT	2	6	2132302	2132307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_021902	TAA	2	6	2132313	2132318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_021902	GA	3	6	2132365	2132370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_021902	CAA	2	6	2134092	2134097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5400	NC_021902	TG	3	6	2138166	2138171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_021902	TGC	2	6	2138182	2138187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5402	NC_021902	T	6	6	2141717	2141722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_021902	TTTTC	2	10	2141839	2141848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5405	NC_021902	TTATT	2	10	2142679	2142688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_021902	T	6	6	2144502	2144507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5407	NC_021902	TGT	2	6	2144512	2144517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5411	NC_021902	A	6	6	2145163	2145168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5418	NC_021902	AATC	2	8	2147122	2147129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5423	NC_021902	CCCG	2	8	2152746	2152753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5424	NC_021902	TGC	2	6	2153269	2153274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5427	NC_021902	GC	3	6	2153295	2153300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5428	NC_021902	TAA	2	6	2154007	2154012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5429	NC_021902	TACA	2	8	2154600	2154607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5431	NC_021902	CCAG	2	8	2156241	2156248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5432	NC_021902	TGG	2	6	2156310	2156315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5493	NC_021902	TTTA	2	8	2171547	2171554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_021902	ATA	2	6	2171567	2171572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_021902	T	6	6	2171584	2171589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5497	NC_021902	AGGG	2	8	2171666	2171673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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