MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Syncytium symbiont of Diaphorina citri

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021885	TAAATA	2	12	1561	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021885	ATTTTT	2	12	4876	4887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021885	AAATTA	2	12	9158	9169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021885	AATTTA	2	12	9235	9246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021885	TATAAA	2	12	13087	13098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021885	TTATTT	2	12	19919	19930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021885	AAATTT	2	12	24070	24081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021885	ATTTTT	2	12	29376	29387	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021885	ATAAAA	2	12	43677	43688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021885	ATTTAT	2	12	57947	57958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021885	TTAAAT	2	12	94540	94551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021885	TTTAAT	2	12	94662	94673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021885	TAGTAA	2	12	106355	106366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021885	TAAAAA	2	12	119657	119668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021885	TGAAAT	2	12	129696	129707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021885	AAATTT	2	12	174514	174525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021885	TTATAT	2	12	177058	177069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021885	TTAAAT	2	12	177932	177943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021885	ATTAAA	2	12	182955	182966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021885	TTAAAC	2	12	185590	185601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021885	ATTTTT	2	12	187190	187201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021885	TTAAAT	2	12	190906	190917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021885	ATTATA	2	12	191428	191439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021885	ATTATA	2	12	191455	191466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021885	TTAAAT	2	12	203865	203876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021885	TTAAAA	2	12	214296	214307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021885	ATATTA	2	12	226857	226868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021885	TAATAT	2	12	226910	226921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021885	ATATTT	2	12	230558	230569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021885	AAATAT	2	12	260551	260562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021885	AAAATA	2	12	264109	264120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021885	TATAAA	2	12	267743	267754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021885	TAATTT	2	12	268799	268810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021885	AAATTT	2	12	279600	279611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021885	TAAAAT	2	12	286202	286213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021885	AATTTT	2	12	302000	302011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021885	ATTTTT	2	12	305677	305688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021885	TAAATT	2	12	306477	306488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021885	TAAAAA	2	12	308852	308863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021885	TAATTA	2	12	310320	310331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021885	TAAATT	2	12	313591	313602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021885	ATTATA	2	12	336751	336762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021885	TAAAAA	2	12	336820	336831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021885	AAATAA	2	12	339679	339690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021885	AAAATA	2	12	339733	339744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021885	TTTAAA	2	12	339750	339761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021885	TAAAAA	2	12	342368	342379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021885	ATTATA	2	12	342393	342404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021885	AATTAA	2	12	344012	344023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021885	TAAAAA	2	12	351163	351174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021885	CCAATA	2	12	352054	352065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021885	ATTTTT	2	12	352164	352175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021885	TAAAAA	2	12	355887	355898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021885	ATATTT	2	12	358998	359009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021885	ATTTTT	2	12	359292	359303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021885	TATTAA	2	12	361070	361081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021885	TAGAAT	2	12	361171	361182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021885	AATTTT	2	12	363558	363569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021885	TTTTAT	2	12	366526	366537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021885	AAATTT	2	12	370364	370375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021885	TTATAT	2	12	374292	374303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021885	ATATAA	2	12	374313	374324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021885	TTTTTG	2	12	379063	379074	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021885	TTAAAT	2	12	386551	386562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021885	AATTAA	2	12	400718	400729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021885	ATTTAA	2	12	403286	403297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021885	TAAATT	2	12	405803	405814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021885	TTAAAT	2	12	406796	406807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021885	ATAAAA	2	12	422890	422901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021885	ATTTAA	2	12	424311	424322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021885	TTTAAT	2	12	426404	426415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021885	TAAATT	2	12	435193	435204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021885	ATATTT	2	12	435256	435267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021885	ATTAAA	2	12	441580	441591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021885	TATATT	2	12	449006	449017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021885	AATTTT	2	12	451072	451083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021885	AAATTA	2	12	458053	458064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.