MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021871	ATT	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021871	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021871	TTAA	2	8	72	79	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021871	GAT	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021871	GAT	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021871	GCA	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021871	GT	3	6	854	859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021871	ATG	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021871	CTG	2	6	894	899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021871	AGT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021871	CAT	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021871	CAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021871	CGGGC	2	10	1078	1087	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021871	GGC	3	9	1085	1093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021871	GTG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021871	GAT	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021871	TTAT	3	12	1301	1312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021871	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021871	AAG	2	6	1337	1342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021871	AGA	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021871	GA	3	6	1522	1527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021871	GAA	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021871	TCC	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021871	TGG	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021871	TCA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021871	CGC	3	9	1712	1720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021871	CCG	2	6	1749	1754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021871	GCT	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021871	CGC	2	6	1836	1841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021871	GT	3	6	2154	2159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021871	GTCA	2	8	2520	2527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021871	TGAT	2	8	2616	2623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021871	TCT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021871	AG	3	6	2674	2679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021871	TCA	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021871	GCCA	2	8	2754	2761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021871	CTT	2	6	2831	2836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021871	CCT	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021871	TAC	2	6	3128	3133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021871	ACTT	2	8	3152	3159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021871	T	6	6	3596	3601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021871	TCC	2	6	4931	4936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021871	T	6	6	4959	4964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021871	ATT	2	6	12554	12559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021871	CGG	2	6	12617	12622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021871	AT	3	6	13393	13398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021871	TTA	2	6	13436	13441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021871	CA	3	6	13445	13450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021871	TG	3	6	13456	13461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021871	CCT	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021871	ACGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021871	GTCATA	2	12	27758	27769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021871	CAG	2	6	27832	27837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021871	CTGC	2	8	27842	27849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021871	T	7	7	27864	27870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021871	ACTA	2	8	29477	29484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021871	AAC	2	6	32854	32859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021871	TAT	2	6	32868	32873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021871	AAC	2	6	32880	32885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021871	ACC	2	6	32932	32937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021871	A	6	6	32938	32943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021871	ATG	2	6	33163	33168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021871	A	6	6	33174	33179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021871	A	6	6	33242	33247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021871	ATCAC	2	10	33313	33322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021871	CCT	2	6	33632	33637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021871	TGG	2	6	33658	33663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021871	G	8	8	33676	33683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021871	TAAA	2	8	33718	33725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021871	TTC	2	6	33730	33735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021871	AAT	2	6	33744	33749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021871	ACA	2	6	33772	33777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021871	AATA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021871	A	6	6	33836	33841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021871	GCAAA	2	10	33859	33868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021871	GTT	2	6	33891	33896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021871	GGAA	2	8	33899	33906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021871	TAA	2	6	33941	33946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021871	GAAA	2	8	33956	33963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021871	ATGA	2	8	34158	34165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021871	ATT	2	6	34179	34184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021871	CCT	2	6	34238	34243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021871	AGG	2	6	34260	34265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021871	ATAA	2	8	34270	34277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021871	AAT	2	6	34693	34698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021871	ATTA	2	8	34703	34710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021871	A	7	7	34761	34767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021871	GTT	2	6	34794	34799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021871	TAA	2	6	34859	34864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021871	TTA	2	6	34882	34887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021871	T	6	6	34927	34932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021871	ATA	3	9	34945	34953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021871	GT	3	6	35006	35011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021871	CGGGC	2	10	35050	35059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021871	TTA	2	6	35090	35095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021871	AGC	2	6	36280	36285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021871	GCG	2	6	36417	36422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021871	GCA	2	6	36437	36442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021871	ATA	2	6	36626	36631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021871	AAT	2	6	36655	36660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021871	GCG	2	6	36665	36670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021871	TAT	2	6	36685	36690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021871	GC	3	6	36703	36708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021871	GT	3	6	37836	37841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021871	GCA	2	6	38254	38259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021871	CGC	2	6	38263	38268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021871	TGG	2	6	38671	38676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021871	TC	3	6	38685	38690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021871	GGC	2	6	38703	38708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021871	AGG	2	6	38733	38738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021871	GAC	2	6	38817	38822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021871	CGG	2	6	38910	38915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021871	ACG	2	6	38917	38922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021871	GCG	2	6	38968	38973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021871	TTC	2	6	39155	39160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021871	CAG	2	6	39173	39178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021871	A	6	6	39203	39208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021871	GCT	2	6	39362	39367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021871	C	6	6	39391	39396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_021871	CTG	2	6	39685	39690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021871	AT	3	6	39710	39715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021871	TCAT	2	8	39719	39726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021871	TGA	2	6	43516	43521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021871	GCT	2	6	43542	43547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021871	GTTT	2	8	44429	44436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021871	GGA	2	6	44579	44584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021871	A	6	6	44678	44683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021871	CGC	2	6	44708	44713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021871	ACG	2	6	44715	44720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021871	TCC	2	6	45369	45374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021871	TCC	2	6	46183	46188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021871	A	6	6	46545	46550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021871	TCC	2	6	46551	46556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021871	GTC	2	6	46566	46571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021871	CGACA	2	10	46594	46603	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_021871	GGA	2	6	46618	46623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021871	CGCAG	2	10	46644	46653	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021871	A	6	6	46655	46660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021871	GCA	2	6	46956	46961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021871	CCGCC	2	10	46965	46974	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
142	NC_021871	CCGC	2	8	47442	47449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_021871	GCC	2	6	47508	47513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_021871	CGC	2	6	48389	48394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_021871	GCG	2	6	48399	48404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021871	AGG	2	6	49774	49779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021871	CTG	2	6	49802	49807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021871	CGC	2	6	49821	49826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.