MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021844	CTTT	2	8	1276388	1276395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_021844	AAT	2	6	1276422	1276427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021844	GAG	2	6	1276477	1276482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021844	TGT	2	6	1279138	1279143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021844	T	8	8	1279165	1279172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021844	TAA	2	6	1279195	1279200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021844	CCA	2	6	1279215	1279220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_021844	AAC	2	6	1279230	1279235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_021844	GCC	2	6	1279245	1279250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_021844	AAG	2	6	1279270	1279275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021844	TG	3	6	1279397	1279402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021844	GGC	2	6	1279551	1279556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021844	AGC	2	6	1279591	1279596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021844	TGC	2	6	1279598	1279603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021844	ACT	2	6	1279665	1279670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021844	CGA	2	6	1279790	1279795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021844	GCA	2	6	1279864	1279869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_021844	GAA	2	6	1279923	1279928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021844	GGA	2	6	1279959	1279964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021844	TAA	2	6	1279977	1279982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021844	GCA	2	6	1279985	1279990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021844	AGA	2	6	1280006	1280011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021844	CAG	2	6	1280032	1280037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021844	G	6	6	1280179	1280184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021844	GGA	2	6	1280223	1280228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021844	GGC	2	6	1280243	1280248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_021844	GAA	2	6	1280486	1280491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021844	TGC	2	6	1280562	1280567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_021844	GTC	2	6	1280574	1280579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_021844	TTG	2	6	1280635	1280640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021844	GGA	2	6	1280687	1280692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021844	TCA	2	6	1280712	1280717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021844	AC	3	6	1280738	1280743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_021844	CGT	2	6	1280806	1280811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021844	AC	3	6	1280907	1280912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_021844	GTAG	2	8	1280948	1280955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021844	CCT	2	6	1281048	1281053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_021844	AAG	2	6	1281061	1281066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021844	CA	3	6	1281083	1281088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_021844	CGG	2	6	1281179	1281184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021844	TG	3	6	1281229	1281234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021844	AAC	2	6	1281332	1281337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021844	GTT	2	6	1281342	1281347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021844	TC	3	6	1281354	1281359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_021844	GAT	2	6	1281375	1281380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021844	GAAA	2	8	1281386	1281393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021844	GCG	2	6	1281654	1281659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021844	GAG	2	6	1281670	1281675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021844	TG	3	6	1281695	1281700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021844	GC	3	6	1281722	1281727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_021844	G	6	6	1281815	1281820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021844	TCC	2	6	1281825	1281830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_021844	CTGA	2	8	1281845	1281852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_021844	GTAC	2	8	1281929	1281936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_021844	GGA	2	6	1282134	1282139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021844	AC	3	6	1282352	1282357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_021844	CGTC	2	8	1282370	1282377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_021844	AAC	2	6	1282389	1282394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021844	AGC	2	6	1282479	1282484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021844	CAT	2	6	1282485	1282490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021844	AAAG	2	8	1282493	1282500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021844	TG	3	6	1282582	1282587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021844	TTG	2	6	1282588	1282593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021844	GT	3	6	1282624	1282629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021844	G	6	6	1282829	1282834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021844	GT	4	8	1282887	1282894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021844	TGA	2	6	1282930	1282935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021844	CAA	2	6	1282957	1282962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_021844	GGT	2	6	1283029	1283034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021844	GA	3	6	1283059	1283064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021844	AGTC	2	8	1283155	1283162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_021844	GCTG	2	8	1283173	1283180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_021844	TTA	2	6	1283188	1283193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021844	CGG	2	6	1283312	1283317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_021844	ATG	2	6	1283388	1283393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021844	ACC	2	6	1283583	1283588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_021844	TGG	2	6	1283643	1283648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021844	TCC	2	6	1283669	1283674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_021844	GGA	2	6	1283686	1283691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021844	AGG	2	6	1283724	1283729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021844	GGT	2	6	1283806	1283811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021844	CGG	2	6	1283893	1283898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021844	TCA	2	6	1283921	1283926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_021844	CGT	2	6	1284001	1284006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021844	G	6	6	1284050	1284055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021844	GAC	3	9	1284232	1284240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_021844	GT	3	6	1284254	1284259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021844	ACA	2	6	1284348	1284353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021844	GGC	2	6	1284400	1284405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_021844	TGAC	2	8	1284440	1284447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_021844	AGC	2	6	1284457	1284462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_021844	GGC	2	6	1284514	1284519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021844	GGT	2	6	1284528	1284533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021844	TTTTGT	2	12	1284665	1284676	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021844	ACCC	2	8	1284770	1284777	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3596	NC_021844	TA	3	6	1284812	1284817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021844	CAAA	2	8	1285298	1285305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_021844	TTTA	2	8	1285316	1285323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021844	CAA	2	6	1285378	1285383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021844	TCT	2	6	1288427	1288432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_021844	GAC	2	6	1288464	1288469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_021844	AAT	2	6	1288480	1288485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021844	CG	3	6	1292453	1292458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_021844	GAG	2	6	1292487	1292492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021844	ACA	2	6	1292503	1292508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021844	TGG	2	6	1292606	1292611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021844	CG	3	6	1293680	1293685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_021844	ATG	2	6	1293694	1293699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021844	CTT	2	6	1294503	1294508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_021844	TCA	2	6	1294628	1294633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_021844	TA	4	8	1294693	1294700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021844	CAA	2	6	1294709	1294714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_021844	CCGA	2	8	1294742	1294749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_021844	AAT	2	6	1294755	1294760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021844	TAA	2	6	1295176	1295181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021844	A	7	7	1295861	1295867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021844	TG	3	6	1298178	1298183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021844	T	6	6	1298275	1298280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021844	GTT	2	6	1298286	1298291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021844	TTA	2	6	1300730	1300735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021844	ATAAA	2	10	1300739	1300748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021844	GA	3	6	1300757	1300762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021844	A	6	6	1300771	1300776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021844	ACG	2	6	1300847	1300852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021844	GTT	2	6	1300880	1300885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021844	ACA	2	6	1300925	1300930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021844	ACAA	2	8	1300933	1300940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_021844	TTGC	2	8	1300988	1300995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_021844	TTTGG	2	10	1301040	1301049	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021844	GTT	2	6	1303789	1303794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_021844	TGTAG	2	10	1303905	1303914	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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