MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021844	AAAC	2	8	251414	251421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_021844	TTCC	2	8	251463	251470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_021844	GGC	2	6	252417	252422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021844	TAAA	2	8	254503	254510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021844	A	8	8	254508	254515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021844	T	8	8	254532	254539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021844	TAA	2	6	254568	254573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021844	ATTG	2	8	254603	254610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021844	CAGA	2	8	254714	254721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_021844	AAT	2	6	254748	254753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021844	GGC	2	6	254768	254773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021844	GAGT	2	8	254778	254785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021844	CAT	2	6	255077	255082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021844	T	6	6	255134	255139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021844	TGA	2	6	255188	255193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021844	TAC	2	6	255225	255230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021844	CGA	2	6	255237	255242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021844	TGG	2	6	255351	255356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021844	GTT	2	6	255419	255424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021844	GCA	2	6	255939	255944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021844	TTG	2	6	255958	255963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021844	GCT	2	6	255996	256001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021844	A	6	6	256026	256031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021844	ACG	2	6	256038	256043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021844	TGG	2	6	256070	256075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021844	GAA	2	6	256928	256933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021844	ACG	2	6	256935	256940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021844	TGA	2	6	256951	256956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021844	A	6	6	257038	257043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021844	TTG	2	6	257182	257187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021844	CTA	2	6	257803	257808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021844	A	7	7	257893	257899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021844	CAGG	2	8	257910	257917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_021844	A	6	6	258172	258177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021844	T	6	6	258215	258220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021844	GGCG	2	8	258342	258349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
537	NC_021844	TTTTA	2	10	258357	258366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021844	CGGG	2	8	258390	258397	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
539	NC_021844	CA	3	6	258752	258757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_021844	G	6	6	258813	258818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021844	CGC	2	6	258824	258829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_021844	AAT	2	6	258924	258929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021844	A	7	7	258940	258946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021844	T	6	6	258982	258987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021844	AATAA	2	10	259014	259023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021844	TTA	3	9	260961	260969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021844	CAT	2	6	260981	260986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021844	TGAA	2	8	261034	261041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021844	AAT	2	6	261047	261052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021844	AAT	2	6	261079	261084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021844	GCC	2	6	261103	261108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_021844	CGGTA	2	10	261114	261123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
553	NC_021844	T	6	6	261805	261810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021844	GAA	2	6	261857	261862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021844	GTAA	2	8	261888	261895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021844	ATAA	2	8	261910	261917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021844	AAT	2	6	261922	261927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021844	TTCA	2	8	265345	265352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_021844	AAT	2	6	265358	265363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021844	GTT	2	6	266183	266188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021844	ATC	2	6	266190	266195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021844	CCA	2	6	266209	266214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021844	GC	3	6	266284	266289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_021844	T	8	8	266303	266310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021844	A	7	7	266342	266348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021844	TAA	2	6	266353	266358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021844	TTAT	2	8	266377	266384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021844	GAA	2	6	266391	266396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021844	ATA	2	6	266397	266402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021844	ATTA	2	8	266404	266411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021844	TAA	2	6	266426	266431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021844	A	6	6	266430	266435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021844	TAAC	2	8	266490	266497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_021844	ATT	2	6	266499	266504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021844	TA	4	8	266507	266514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021844	T	6	6	267199	267204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021844	ATT	2	6	267942	267947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021844	GGAA	2	8	270483	270490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021844	T	6	6	272152	272157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021844	TCT	2	6	272165	272170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021844	GTTT	2	8	272317	272324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021844	TTCG	2	8	274137	274144	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_021844	T	7	7	274215	274221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021844	AGCGA	2	10	274275	274284	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
585	NC_021844	GA	3	6	274283	274288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021844	T	7	7	275402	275408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021844	A	6	6	275422	275427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021844	AGG	2	6	275478	275483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021844	T	7	7	276642	276648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021844	ACG	2	6	278019	278024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021844	T	6	6	278085	278090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021844	GAAA	2	8	278175	278182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021844	CTG	2	6	278272	278277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021844	T	7	7	278295	278301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021844	TTTG	2	8	278306	278313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021844	GTT	2	6	278326	278331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021844	ACT	2	6	278457	278462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021844	A	6	6	278476	278481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021844	A	6	6	278483	278488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021844	ACA	2	6	278522	278527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021844	AGA	2	6	278545	278550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021844	AGCGC	2	10	280199	280208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
603	NC_021844	GA	4	8	280298	280305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021844	TTA	2	6	282263	282268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021844	CGA	2	6	282298	282303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021844	GGT	2	6	282358	282363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021844	TGG	2	6	282513	282518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021844	GAT	2	6	282532	282537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021844	CGT	2	6	282635	282640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021844	AGCG	2	8	282642	282649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_021844	GGC	2	6	282722	282727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021844	TGA	2	6	282741	282746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021844	TGA	2	6	282787	282792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021844	GCT	3	9	282838	282846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021844	GCA	2	6	282853	282858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021844	TGG	2	6	282903	282908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021844	GCG	2	6	282914	282919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021844	GTC	2	6	282950	282955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021844	CG	3	6	282983	282988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_021844	GTG	2	6	283073	283078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021844	GACC	2	8	283091	283098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_021844	GAA	2	6	283154	283159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021844	CAAC	2	8	283168	283175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_021844	GTCA	2	8	283188	283195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021844	GAT	2	6	283214	283219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021844	A	6	6	283291	283296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021844	GAA	2	6	283308	283313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021844	CTG	2	6	283435	283440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021844	GAT	2	6	283443	283448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021844	CGG	2	6	283461	283466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021844	TTA	2	6	283473	283478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021844	GCG	2	6	283524	283529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021844	CGT	2	6	283645	283650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021844	GAT	2	6	283665	283670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021844	CGG	2	6	283725	283730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021844	CAGCGT	2	12	283732	283743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021844	CGA	2	6	283791	283796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021844	GC	3	6	283824	283829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_021844	TGA	2	6	283844	283849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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