MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021844	TTG	2	6	1922127	1922132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021844	AG	4	8	1922199	1922206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021844	CAA	2	6	1922256	1922261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_021844	TAG	2	6	1922403	1922408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021844	ACGA	2	8	1922516	1922523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_021844	CCAT	2	8	1922540	1922547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_021844	GACT	2	8	1922576	1922583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_021844	ATGCTG	2	12	1922587	1922598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5009	NC_021844	CTG	2	6	1922637	1922642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_021844	TCC	2	6	1922650	1922655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_021844	GTCG	2	8	1922656	1922663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_021844	CGC	2	6	1922884	1922889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_021844	GCA	2	6	1922971	1922976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_021844	ATGAAG	2	12	1923023	1923034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021844	GCA	2	6	1923084	1923089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_021844	CTGG	2	8	1923130	1923137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_021844	TAT	2	6	1923197	1923202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021844	TAT	2	6	1923276	1923281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021844	GCTG	2	8	1923305	1923312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_021844	CCG	2	6	1923343	1923348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_021844	ATC	2	6	1923416	1923421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021844	TCA	2	6	1923456	1923461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021844	TAG	2	6	1923622	1923627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021844	GGC	2	6	1926477	1926482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021844	GTA	2	6	1926552	1926557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021844	GC	3	6	1926579	1926584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_021844	ATTT	2	8	1926641	1926648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021844	T	9	9	1926646	1926654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021844	TTA	2	6	1926736	1926741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021844	ATC	2	6	1926768	1926773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021844	ACTAAC	4	24	1926778	1926801	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_021844	TA	3	6	1926812	1926817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021844	T	6	6	1926827	1926832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021844	GTA	3	9	1930918	1930926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021844	TTTA	2	8	1930946	1930953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021844	T	7	7	1930974	1930980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021844	TCA	2	6	1931037	1931042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021844	T	6	6	1931155	1931160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021844	TAC	2	6	1931195	1931200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021844	ATTA	2	8	1931215	1931222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021844	TAA	2	6	1931242	1931247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021844	A	8	8	1931312	1931319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021844	T	6	6	1931364	1931369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021844	CACT	2	8	1931434	1931441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_021844	CTG	2	6	1931543	1931548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021844	CTTA	2	8	1931574	1931581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_021844	A	6	6	1931612	1931617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021844	AAT	2	6	1931918	1931923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021844	CTG	3	9	1933395	1933403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_021844	TGAA	2	8	1933447	1933454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021844	TCA	2	6	1933508	1933513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021844	ACCG	2	8	1933640	1933647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_021844	GGT	2	6	1933720	1933725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021844	TCA	3	9	1933772	1933780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021844	TCG	2	6	1933889	1933894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021844	CGGG	2	8	1934265	1934272	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_021844	AAT	2	6	1938254	1938259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021844	GAG	2	6	1938315	1938320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021844	GA	3	6	1938334	1938339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021844	TTC	2	6	1938343	1938348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_021844	AAT	2	6	1938362	1938367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021844	GTT	2	6	1938385	1938390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021844	ATA	2	6	1938400	1938405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021844	TGA	2	6	1938412	1938417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021844	TTA	2	6	1938418	1938423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021844	TA	3	6	1938429	1938434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021844	A	6	6	1938527	1938532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021844	CTG	2	6	1938564	1938569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021844	TTG	2	6	1939369	1939374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021844	CTGC	2	8	1939410	1939417	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_021844	CAT	2	6	1939439	1939444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021844	C	6	6	1939446	1939451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5073	NC_021844	TCT	2	6	1939470	1939475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_021844	CGA	2	6	1939590	1939595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_021844	GCA	2	6	1939664	1939669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021844	GTAAA	2	10	1939699	1939708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021844	AGG	2	6	1940225	1940230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021844	A	6	6	1940290	1940295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021844	T	6	6	1940340	1940345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021844	CTC	2	6	1940390	1940395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_021844	CCG	2	6	1940433	1940438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_021844	GTTT	2	8	1940530	1940537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021844	ACA	2	6	1940548	1940553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_021844	TGA	2	6	1940666	1940671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021844	GGCA	2	8	1940685	1940692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_021844	AAT	2	6	1940700	1940705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021844	CGA	2	6	1940892	1940897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5089	NC_021844	T	6	6	1940953	1940958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021844	CAG	2	6	1940982	1940987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_021844	TCAG	2	8	1941176	1941183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_021844	GAA	2	6	1941288	1941293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021844	CTC	2	6	1941360	1941365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_021844	CCG	2	6	1941403	1941408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_021844	ATA	2	6	1941451	1941456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021844	CAATT	2	10	1941497	1941506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5098	NC_021844	TTAA	2	8	1941509	1941516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021844	CAT	2	6	1942403	1942408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_021844	GA	3	6	1942420	1942425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021844	CT	3	6	1942497	1942502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_021844	TCT	2	6	1942529	1942534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_021844	AGA	2	6	1942627	1942632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021844	GCG	2	6	1942739	1942744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_021844	CGT	2	6	1942754	1942759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5108	NC_021844	GA	4	8	1942981	1942988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021844	CGA	2	6	1943004	1943009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_021844	GC	3	6	1943043	1943048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_021844	ATA	2	6	1943057	1943062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021844	TA	3	6	1943069	1943074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021844	ATC	2	6	1944822	1944827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_021844	CA	3	6	1944851	1944856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_021844	A	6	6	1945028	1945033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021844	T	7	7	1945043	1945049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021844	AGT	2	6	1945123	1945128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021844	TCA	2	6	1945143	1945148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_021844	T	7	7	1945176	1945182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021844	CT	3	6	1945183	1945188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_021844	TTC	2	6	1945196	1945201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_021844	TAA	2	6	1945472	1945477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021844	T	6	6	1945570	1945575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021844	AAT	2	6	1945651	1945656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021844	T	6	6	1945680	1945685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021844	GAT	2	6	1945693	1945698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021844	ATC	2	6	1945700	1945705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_021844	CATC	2	8	1945718	1945725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_021844	A	6	6	1945784	1945789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021844	TAA	2	6	1945868	1945873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_021844	CAA	2	6	1947173	1947178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5266	NC_021844	CTC	2	6	1994825	1994830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5267	NC_021844	AGCC	2	8	1994854	1994861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5268	NC_021844	TG	3	6	1995328	1995333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_021844	TG	3	6	1995377	1995382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5275	NC_021844	AATA	2	8	1996863	1996870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5278	NC_021844	GCTG	2	8	1997913	1997920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5281	NC_021844	TCT	2	6	1998054	1998059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5298	NC_021844	ATTA	2	8	2001419	2001426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_021844	TAAAA	2	10	2001463	2001472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5394	NC_021844	TCA	2	6	2035919	2035924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5397	NC_021844	GAT	2	6	2037579	2037584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_021844	TG	3	6	2039903	2039908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_021844	T	6	6	2039914	2039919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_021844	TG	3	6	2039924	2039929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_021844	CAG	2	6	2039972	2039977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5403	NC_021844	TAC	2	6	2041005	2041010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5421	NC_021844	TA	3	6	2049321	2049326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5424	NC_021844	CTT	2	6	2050147	2050152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5478	NC_021844	TCG	2	6	2060915	2060920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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