MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma diminutum CUAS-1

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021833	ATTTT	2	10	35259	35268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021833	GAAAG	2	10	37431	37440	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021833	ATATT	2	10	38905	38914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021833	TAAAA	2	10	74001	74010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021833	TAAAA	2	10	82844	82853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021833	AAATT	2	10	106653	106662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021833	ATATA	2	10	116612	116621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021833	TATAA	2	10	119408	119417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021833	AATAA	2	10	140770	140779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021833	TTATT	2	10	140802	140811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021833	ATTTT	2	10	144882	144891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021833	TAATA	2	10	153095	153104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021833	AAAAT	2	10	157892	157901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021833	TTTTA	2	10	158961	158970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021833	TAATA	2	10	192147	192156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021833	TATAA	2	10	196129	196138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021833	TATAA	2	10	198423	198432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021833	TATAA	2	10	215704	215713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021833	TATAA	2	10	231802	231811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021833	ACTTT	2	10	236161	236170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021833	TAAAG	2	10	248890	248899	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021833	TAATA	2	10	278158	278167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021833	ATTTA	2	10	278191	278200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021833	TAATT	2	10	284083	284092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021833	ACTTT	2	10	290615	290624	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021833	TTATA	2	10	295612	295621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021833	AATAT	2	10	295634	295643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021833	GTTCT	2	10	309246	309255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021833	TAAAA	2	10	329426	329435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021833	ATAGA	2	10	333844	333853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021833	TTAAT	2	10	340290	340299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021833	TATAA	2	10	367085	367094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021833	AAAGA	2	10	367095	367104	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021833	ATTAA	2	10	367817	367826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021833	ATATT	2	10	372765	372774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021833	TTATA	2	10	376603	376612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021833	TGATT	2	10	378399	378408	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021833	ATTAA	2	10	389538	389547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021833	TTATT	2	10	405525	405534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021833	TATAA	2	10	408290	408299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021833	ATATT	2	10	409222	409231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021833	ATATT	2	10	419181	419190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021833	AAAGA	2	10	422349	422358	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021833	TATAA	2	10	423286	423295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021833	AATAA	2	10	431282	431291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021833	AATTT	2	10	433000	433009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021833	TAAAT	2	10	433047	433056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021833	ATTTT	2	10	439472	439481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021833	ATATA	2	10	446054	446063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021833	ATATA	2	10	451282	451291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021833	GTTTT	2	10	451909	451918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021833	ATTTT	2	10	453456	453465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021833	TAATA	2	10	454102	454111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021833	ATATA	2	10	454510	454519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021833	TAATT	2	10	476478	476487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021833	AAAGT	2	10	484853	484862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021833	TTTAC	2	10	484919	484928	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021833	TTAAT	2	10	494865	494874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021833	TAATT	2	10	495022	495031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021833	CTTTT	2	10	495665	495674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021833	AATCA	2	10	500521	500530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021833	AAATA	3	15	502221	502235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021833	TAAAT	2	10	515020	515029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021833	CTCTT	2	10	515673	515682	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021833	TATCT	2	10	520363	520372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021833	TAAAT	2	10	520498	520507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021833	TTATT	2	10	520667	520676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021833	TTAAA	2	10	525736	525745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021833	CTTTT	2	10	530718	530727	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021833	CTTTT	2	10	531725	531734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021833	TAAAA	2	10	534616	534625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021833	TTAAA	2	10	546144	546153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021833	TATTG	2	10	547357	547366	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021833	TTAAA	2	10	547380	547389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021833	ATATT	2	10	561837	561846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021833	AATTA	2	10	575186	575195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021833	TTTTA	2	10	575275	575284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021833	TAAAA	2	10	575291	575300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021833	TTATT	2	10	576402	576411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021833	AATTT	2	10	576584	576593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021833	ATTTA	2	10	577772	577781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021833	AAATT	2	10	587303	587312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021833	CTAAT	2	10	592625	592634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021833	ATTTT	2	10	593098	593107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021833	AAATA	2	10	598250	598259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021833	ATATT	2	10	601219	601228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021833	AATAT	2	10	602314	602323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021833	AAATA	2	10	604748	604757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021833	ATATT	2	10	608617	608626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021833	CTTTT	2	10	650831	650840	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021833	TTTGA	2	10	674685	674694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021833	TTTTA	2	10	674836	674845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021833	TATAT	2	10	677853	677862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021833	CTAAA	2	10	684243	684252	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021833	TTTTC	2	10	713701	713710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021833	AAAAT	2	10	714041	714050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021833	TAGAT	2	10	715625	715634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021833	TAATT	2	10	721309	721318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021833	ATTTT	2	10	736777	736786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021833	AATTA	2	10	759343	759352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021833	TTTTC	2	10	781190	781199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021833	ATTTT	2	10	784090	784099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021833	TAAAA	2	10	822047	822056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021833	TAATC	2	10	830425	830434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021833	TTTTA	2	10	842332	842341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021833	ATAAA	2	10	877849	877858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021833	TTTAA	2	10	886610	886619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021833	TGATA	2	10	892201	892210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021833	ATTTT	2	10	896260	896269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021833	TAAAA	2	10	909834	909843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021833	TAAAA	2	10	924920	924929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021833	TAAAA	2	10	932766	932775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021833	TTATT	2	10	938936	938945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021833	AATTA	2	10	939456	939465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.