MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021820	CAG	2	6	1128997	1129002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021820	CAC	2	6	1129036	1129041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_021820	AAC	2	6	1129065	1129070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_021820	TGG	2	6	1129121	1129126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021820	TGT	2	6	1129170	1129175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021820	CGCC	2	8	1129178	1129185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3007	NC_021820	CGA	2	6	1129328	1129333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021820	ATT	2	6	1130485	1130490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021820	ACCC	2	8	1130519	1130526	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3010	NC_021820	TTTTCC	2	12	1130545	1130556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021820	GCCT	2	8	1130562	1130569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_021820	CTG	2	6	1130570	1130575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_021820	GT	3	6	1130584	1130589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021820	TTTA	2	8	1130618	1130625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021820	TCG	2	6	1133417	1133422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021820	GCC	2	6	1133974	1133979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_021820	GCC	2	6	1134019	1134024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_021820	CGG	2	6	1134025	1134030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_021820	AACC	2	8	1134498	1134505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_021820	A	9	9	1135942	1135950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021820	GAAA	2	8	1135987	1135994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021820	T	6	6	1136012	1136017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021820	AC	3	6	1136043	1136048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_021820	TCC	2	6	1136060	1136065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_021820	A	6	6	1136746	1136751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021820	TC	3	6	1138230	1138235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_021820	GCGCT	2	10	1139318	1139327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3028	NC_021820	GC	3	6	1139346	1139351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_021820	GCC	2	6	1139375	1139380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_021820	AAG	2	6	1141590	1141595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021820	GTT	2	6	1141675	1141680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021820	TGA	2	6	1141685	1141690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021820	ATCA	2	8	1141698	1141705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_021820	CTTA	2	8	1141721	1141728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_021820	AT	3	6	1141729	1141734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021820	A	6	6	1141755	1141760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021820	TAC	2	6	1141781	1141786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021820	ATT	2	6	1141820	1141825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021820	ATT	2	6	1141877	1141882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021820	TAT	2	6	1141918	1141923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021820	AAT	2	6	1141936	1141941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021820	GTA	2	6	1142168	1142173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021820	GGC	2	6	1142703	1142708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021820	CAT	2	6	1142748	1142753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_021820	GAT	2	6	1143818	1143823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021820	CGG	2	6	1143879	1143884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_021820	CTG	2	6	1145246	1145251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021820	CCTGC	2	10	1145297	1145306	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3049	NC_021820	GGCA	2	8	1145307	1145314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_021820	ACTC	2	8	1145321	1145328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_021820	CAT	2	6	1145373	1145378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_021820	AAT	2	6	1145908	1145913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021820	ATT	2	6	1145946	1145951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021820	ATA	2	6	1145965	1145970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021820	ATAA	2	8	1145981	1145988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021820	ATTT	2	8	1146524	1146531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021820	ACC	2	6	1146547	1146552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_021820	TAT	2	6	1146657	1146662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021820	TGT	2	6	1147923	1147928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021820	GGC	2	6	1147934	1147939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_021820	AAGCG	2	10	1148001	1148010	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_021820	CTT	2	6	1151334	1151339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_021820	GTG	2	6	1151340	1151345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021820	ATG	2	6	1151363	1151368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021820	AGCGC	2	10	1151387	1151396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3066	NC_021820	GGC	2	6	1151417	1151422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_021820	ACA	2	6	1152998	1153003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_021820	GTG	2	6	1153004	1153009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021820	TCG	2	6	1153023	1153028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_021820	GCC	2	6	1153110	1153115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_021820	TTA	2	6	1153207	1153212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021820	GAT	2	6	1153274	1153279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021820	CGA	2	6	1153282	1153287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021820	A	7	7	1153337	1153343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021820	GCGCT	2	10	1155574	1155583	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3076	NC_021820	CCG	2	6	1155624	1155629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_021820	ATG	2	6	1155660	1155665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021820	GAT	2	6	1156798	1156803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021820	TC	3	6	1158132	1158137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_021820	TTA	2	6	1158138	1158143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_021820	TTGTG	2	10	1160192	1160201	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021820	CTG	2	6	1161873	1161878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_021820	ATT	2	6	1161900	1161905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021820	GCT	2	6	1161922	1161927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_021820	TGG	2	6	1161973	1161978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_021820	TGG	2	6	1162135	1162140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021820	T	7	7	1162142	1162148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021820	ATTT	2	8	1162199	1162206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021820	AT	3	6	1162218	1162223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021820	C	6	6	1162320	1162325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3096	NC_021820	GAGC	2	8	1162755	1162762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_021820	TAT	2	6	1162802	1162807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021820	GCA	2	6	1162815	1162820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_021820	CAGC	2	8	1162887	1162894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_021820	GCG	2	6	1163097	1163102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021820	T	6	6	1163133	1163138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021820	GAC	2	6	1163151	1163156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_021820	T	6	6	1163288	1163293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021820	TGA	2	6	1163423	1163428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021820	CCG	2	6	1163443	1163448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_021820	GAA	2	6	1163457	1163462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_021820	GAT	2	6	1163511	1163516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021820	GCT	2	6	1163525	1163530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021820	GAA	2	6	1163531	1163536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021820	GGC	2	6	1163616	1163621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_021820	TGC	2	6	1163714	1163719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_021820	TCC	2	6	1163732	1163737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_021820	ATC	2	6	1163898	1163903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_021820	TTA	2	6	1163950	1163955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021820	GAT	2	6	1164043	1164048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021820	GCC	2	6	1164108	1164113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_021820	A	6	6	1164114	1164119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021820	TTC	2	6	1164135	1164140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_021820	CTG	2	6	1164177	1164182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_021820	TAAA	2	8	1164382	1164389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021820	A	6	6	1164447	1164452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021820	ATT	2	6	1164482	1164487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021820	CCG	2	6	1164628	1164633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_021820	AAC	2	6	1164644	1164649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_021820	GCA	2	6	1164656	1164661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_021820	CAG	2	6	1164696	1164701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3130	NC_021820	GCTG	2	8	1164782	1164789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_021820	GAC	2	6	1164821	1164826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_021820	ACT	2	6	1164829	1164834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021820	GTTG	2	8	1164844	1164851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_021820	TGA	2	6	1164869	1164874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_021820	AAAT	2	8	1199683	1199690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_021820	GTT	2	6	1199725	1199730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_021820	A	6	6	1199731	1199736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_021820	T	6	6	1199742	1199747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_021820	T	6	6	1199762	1199767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_021820	GGTCA	2	10	1199803	1199812	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3258	NC_021820	AAT	2	6	1199872	1199877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_021820	AATT	2	8	1199880	1199887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_021820	ATG	2	6	1199890	1199895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_021820	TGA	2	6	1199913	1199918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_021820	ATC	2	6	1199936	1199941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_021820	AT	3	6	1199950	1199955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_021820	AAT	2	6	1199962	1199967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_021820	GGC	2	6	1199982	1199987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3268	NC_021820	ATGG	2	8	1200060	1200067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3272	NC_021820	TTG	3	9	1201517	1201525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3274	NC_021820	AAGAA	2	10	1201566	1201575	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3276	NC_021820	A	6	6	1203005	1203010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3277	NC_021820	A	6	6	1204298	1204303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3280	NC_021820	ACAG	2	8	1204438	1204445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3281	NC_021820	TAA	2	6	1204593	1204598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3293	NC_021820	TTATG	2	10	1207268	1207277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3294	NC_021820	TGA	2	6	1208421	1208426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3296	NC_021820	AT	3	6	1208547	1208552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3297	NC_021820	ATA	2	6	1208578	1208583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3302	NC_021820	TTA	2	6	1215315	1215320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3342	NC_021820	TAA	2	6	1233171	1233176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_021820	G	8	8	1241883	1241890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_021820	GATT	2	8	1242050	1242057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3381	NC_021820	T	6	6	1246595	1246600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_021820	TGA	2	6	1246649	1246654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3386	NC_021820	TCC	2	6	1247525	1247530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3388	NC_021820	AT	3	6	1247816	1247821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3389	NC_021820	A	7	7	1247897	1247903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_021820	GCC	2	6	1249778	1249783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3391	NC_021820	GGC	2	6	1252231	1252236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3394	NC_021820	GCGCT	2	10	1253243	1253252	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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