MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021820	GCA	2	6	559960	559965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021820	TTG	2	6	559979	559984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021820	A	6	6	560047	560052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021820	ACG	2	6	560059	560064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_021820	TGG	2	6	560091	560096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021820	GAA	2	6	560949	560954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021820	ACG	2	6	560956	560961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021820	TGA	2	6	560972	560977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021820	A	6	6	561059	561064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021820	TTG	2	6	561201	561206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021820	CTA	2	6	561822	561827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021820	G	6	6	561897	561902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021820	A	8	8	561912	561919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021820	CAGG	2	8	561930	561937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_021820	A	6	6	562192	562197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021820	T	6	6	562235	562240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021820	GGCG	2	8	562362	562369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_021820	TTTTA	2	10	562377	562386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021820	CGGG	2	8	562410	562417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021820	CA	3	6	562773	562778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_021820	G	6	6	562834	562839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021820	CGC	2	6	562845	562850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_021820	TACGC	2	10	562882	562891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1524	NC_021820	AAT	2	6	562945	562950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021820	A	7	7	562961	562967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021820	T	6	6	563003	563008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021820	AATAA	2	10	563035	563044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021820	TTA	3	9	564982	564990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021820	AAT	2	6	565002	565007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021820	TGAA	2	8	565055	565062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021820	AAT	2	6	565068	565073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021820	AAT	2	6	565100	565105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021820	GCC	2	6	565124	565129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_021820	CGGTA	2	10	565135	565144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_021820	T	6	6	565826	565831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021820	GAA	2	6	565878	565883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021820	GTAA	2	8	565909	565916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021820	ATAA	2	8	565931	565938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021820	AAT	2	6	565943	565948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021820	TTCA	2	8	569366	569373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_021820	AAT	2	6	569379	569384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021820	CCA	2	6	570230	570235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_021820	T	8	8	570324	570331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021820	A	7	7	570363	570369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021820	TAA	2	6	570374	570379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021820	TTAT	2	8	570398	570405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021820	GAA	2	6	570412	570417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021820	ATA	2	6	570418	570423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021820	ATTA	2	8	570425	570432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021820	TAA	2	6	570447	570452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021820	A	6	6	570451	570456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021820	AT	3	6	570483	570488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021820	TAAC	2	8	570511	570518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_021820	ATT	2	6	570520	570525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021820	TA	4	8	570528	570535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021820	T	6	6	571220	571225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021820	ATT	2	6	571963	571968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021820	GGAA	2	8	574504	574511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021820	CCA	2	6	574642	574647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_021820	TAAA	2	8	574648	574655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021820	TGA	2	6	574754	574759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021820	CT	3	6	574763	574768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_021820	AG	3	6	574823	574828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021820	AAT	3	9	574848	574856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021820	GCGA	2	8	574866	574873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_021820	G	6	6	574886	574891	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021820	GAG	2	6	574894	574899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021820	AC	3	6	574909	574914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_021820	ACAA	2	8	574928	574935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_021820	AGT	2	6	574961	574966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021820	TAT	2	6	575041	575046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021820	AAT	2	6	575059	575064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021820	CGT	2	6	575112	575117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_021820	TA	3	6	575121	575126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021820	GCA	2	6	575172	575177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_021820	TTG	2	6	575463	575468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021820	ACC	2	6	575519	575524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_021820	GCCG	2	8	575533	575540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_021820	CCA	2	6	575562	575567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_021820	T	6	6	576163	576168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021820	TCT	2	6	576176	576181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_021820	GTTT	2	8	576328	576335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021820	TTCG	2	8	578148	578155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_021820	T	7	7	578226	578232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021820	AGCGA	2	10	578286	578295	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1586	NC_021820	GA	3	6	578294	578299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021820	T	7	7	579427	579433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021820	A	6	6	579447	579452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021820	AGG	2	6	579503	579508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021820	T	7	7	580667	580673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021820	ACG	2	6	582044	582049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_021820	T	6	6	582110	582115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021820	GAAA	2	8	582200	582207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021820	CTG	2	6	582297	582302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_021820	T	7	7	582320	582326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021820	TTTG	2	8	582331	582338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021820	GTT	2	6	582351	582356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021820	ACT	2	6	582482	582487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1600	NC_021820	A	6	6	582508	582513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021820	ACA	2	6	582547	582552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_021820	AGA	2	6	582570	582575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021820	AGCGC	2	10	584224	584233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1604	NC_021820	GA	4	8	584323	584330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021820	TTA	2	6	586288	586293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021820	CGA	2	6	586323	586328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_021820	GGT	2	6	586383	586388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021820	TGG	2	6	586538	586543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021820	GAT	2	6	586557	586562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021820	CGT	2	6	586660	586665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021820	AGCG	2	8	586667	586674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_021820	GGC	2	6	586747	586752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021820	TGA	2	6	586766	586771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021820	GCT	3	9	586863	586871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021820	GCA	2	6	586878	586883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021820	TGG	2	6	586928	586933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021820	GCG	2	6	586939	586944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_021820	GTC	2	6	586975	586980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021820	CG	3	6	587008	587013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_021820	CG	3	6	587044	587049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_021820	GC	3	6	587074	587079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_021820	GTG	2	6	587098	587103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021820	GACC	2	8	587116	587123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_021820	GAA	2	6	587179	587184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021820	CAAC	2	8	587193	587200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_021820	GTCA	2	8	587213	587220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_021820	GAT	2	6	587239	587244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021820	A	6	6	587316	587321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021820	GAA	2	6	587333	587338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021820	CTG	2	6	587460	587465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_021820	GAT	2	6	587468	587473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021820	CGG	2	6	587486	587491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_021820	TTA	2	6	587498	587503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021820	GCG	2	6	587549	587554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_021820	CGT	2	6	587670	587675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_021820	GAT	2	6	587690	587695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_021820	CGG	2	6	587750	587755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_021820	CAGCGT	2	12	587757	587768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_021820	TCACT	2	10	721514	721523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1909	NC_021820	G	6	6	721533	721538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_021820	A	6	6	721667	721672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_021820	CAT	2	6	721748	721753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_021820	TATT	2	8	763353	763360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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