MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021820	CGCA	2	8	2086114	2086121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_021820	GGA	2	6	2086126	2086131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_021820	CGT	2	6	2086141	2086146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_021820	AAT	2	6	2086194	2086199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021820	AGCGC	2	10	2089527	2089536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5506	NC_021820	TAA	2	6	2089587	2089592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021820	ATT	2	6	2089707	2089712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_021820	CAA	2	6	2089762	2089767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_021820	GCC	2	6	2089910	2089915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_021820	CGC	2	6	2094048	2094053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_021820	GC	3	6	2094081	2094086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_021820	T	6	6	2096247	2096252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021820	TTGT	2	8	2096262	2096269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021820	ATT	2	6	2096303	2096308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021820	AAT	2	6	2096336	2096341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021820	A	7	7	2096350	2096356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021820	TGG	2	6	2096359	2096364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021820	ATA	2	6	2096381	2096386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_021820	GCA	2	6	2096437	2096442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_021820	A	7	7	2096512	2096518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021820	GCA	2	6	2096525	2096530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_021820	ATT	2	6	2096697	2096702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021820	TAA	2	6	2096728	2096733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021820	ATT	2	6	2096776	2096781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021820	TTCG	2	8	2096800	2096807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_021820	TAA	2	6	2096919	2096924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021820	AG	3	6	2096929	2096934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021820	TGTT	2	8	2096979	2096986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021820	TTA	2	6	2097005	2097010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_021820	GTC	2	6	2097055	2097060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_021820	GAT	2	6	2097096	2097101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021820	TAAAA	2	10	2097147	2097156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021820	ATA	2	6	2097175	2097180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021820	A	6	6	2097199	2097204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021820	AAT	2	6	2097222	2097227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021820	T	6	6	2097247	2097252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021820	A	6	6	2097270	2097275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021820	CAAAAA	2	12	2097340	2097351	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5539	NC_021820	A	6	6	2097358	2097363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021820	ATT	2	6	2097389	2097394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021820	A	6	6	2097522	2097527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021820	TTCC	2	8	2097641	2097648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_021820	AAAT	2	8	2097676	2097683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021820	GTC	2	6	2099337	2099342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021820	CCT	2	6	2101039	2101044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_021820	AT	3	6	2101072	2101077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021820	C	6	6	2101097	2101102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5548	NC_021820	TAG	2	6	2101129	2101134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021820	TTG	2	6	2101156	2101161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021820	CGG	2	6	2101220	2101225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_021820	CAA	2	6	2101240	2101245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_021820	T	6	6	2102832	2102837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021820	AGTTG	2	10	2104099	2104108	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021820	TGG	2	6	2104119	2104124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021820	T	6	6	2106872	2106877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021820	CGT	2	6	2106885	2106890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_021820	TTG	2	6	2106929	2106934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_021820	AT	3	6	2106956	2106961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021820	GCC	2	6	2106962	2106967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_021820	AAC	2	6	2106985	2106990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021820	CCA	2	6	2107080	2107085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_021820	GGCGA	2	10	2107148	2107157	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5563	NC_021820	CAC	2	6	2107175	2107180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_021820	GTA	2	6	2107209	2107214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021820	AGG	2	6	2107254	2107259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021820	CGG	2	6	2107264	2107269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_021820	TCA	2	6	2107280	2107285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_021820	CAC	2	6	2107288	2107293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_021820	CCA	2	6	2107366	2107371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_021820	CCA	2	6	2107491	2107496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_021820	GGT	2	6	2107505	2107510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_021820	GGCGA	2	10	2107560	2107569	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5573	NC_021820	CCA	2	6	2107591	2107596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_021820	CCA	2	6	2107701	2107706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_021820	A	6	6	2107711	2107716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021820	T	6	6	2107732	2107737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_021820	GCG	2	6	2107810	2107815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_021820	CCA	2	6	2107856	2107861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_021820	A	6	6	2107866	2107871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021820	T	6	6	2107887	2107892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_021820	GCGA	2	8	2107982	2107989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_021820	CCA	2	6	2108010	2108015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_021820	GGC	2	6	2108033	2108038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_021820	TGCGC	2	10	2108100	2108109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_021820	CGC	2	6	2108159	2108164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_021820	ATT	2	6	2108186	2108191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021820	TTA	2	6	2108257	2108262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_021820	GTT	2	6	2108275	2108280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021820	GA	3	6	2109372	2109377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_021820	TCA	2	6	2111054	2111059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_021820	CAT	2	6	2111070	2111075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_021820	T	8	8	2111132	2111139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_021820	TGG	2	6	2111545	2111550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021820	GTCA	2	8	2111584	2111591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_021820	CGC	3	9	2111620	2111628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_021820	GCA	2	6	2111637	2111642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_021820	AAT	2	6	2111654	2111659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021820	TAGAT	2	10	2111691	2111700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021820	T	7	7	2111725	2111731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_021820	ATT	2	6	2111745	2111750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021820	AGAT	2	8	2111793	2111800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021820	CATT	2	8	2111812	2111819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_021820	ACCGG	2	10	2112963	2112972	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5604	NC_021820	CTCC	2	8	2114402	2114409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5605	NC_021820	AGGA	2	8	2114470	2114477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021820	TTA	2	6	2114490	2114495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021820	TAG	2	6	2114514	2114519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021820	ATT	2	6	2116424	2116429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021820	GTT	2	6	2116484	2116489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_021820	TTCT	2	8	2116505	2116512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_021820	ATTA	2	8	2116521	2116528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_021820	TTG	2	6	2116561	2116566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021820	GTT	2	6	2116591	2116596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021820	TAA	2	6	2116606	2116611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021820	ATT	2	6	2117922	2117927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021820	GGA	2	6	2118196	2118201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021820	GGC	2	6	2121314	2121319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_021820	GCA	2	6	2121375	2121380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_021820	CTG	2	6	2122123	2122128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_021820	TGT	2	6	2122138	2122143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021820	CAG	2	6	2122263	2122268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_021820	GGA	2	6	2122370	2122375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021820	TATT	2	8	2122376	2122383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_021820	ATAA	2	8	2122424	2122431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021820	AT	3	6	2122432	2122437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021820	AAT	2	6	2122443	2122448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_021820	TAA	2	6	2122473	2122478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_021820	GCGCT	2	10	2124364	2124373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5629	NC_021820	ATA	2	6	2125220	2125225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_021820	GGC	2	6	2125253	2125258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_021820	GTG	2	6	2125339	2125344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_021820	AAC	2	6	2128646	2128651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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