MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021819	TGGA	2	8	1208	1215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021819	TAAA	2	8	3255	3262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021819	AGAT	2	8	3357	3364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021819	TCAT	2	8	3602	3609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021819	ATTT	2	8	4395	4402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021819	GGGC	2	8	5153	5160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021819	ATCT	2	8	5250	5257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021819	TATG	2	8	13382	13389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021819	CAGA	2	8	24594	24601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021819	GGAT	2	8	25178	25185	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021819	AGCC	2	8	26024	26031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021819	GAAT	2	8	27624	27631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021819	CAGC	2	8	33110	33117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021819	TTAT	2	8	39008	39015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021819	TCAA	2	8	39043	39050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021819	TAGA	2	8	44072	44079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021819	CTTA	2	8	44084	44091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021819	GGTA	2	8	44218	44225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021819	TTAT	2	8	44317	44324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021819	ATCG	2	8	44669	44676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021819	TATT	2	8	48811	48818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021819	CCAG	2	8	50484	50491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021819	GATA	2	8	50667	50674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021819	ATTT	2	8	50981	50988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021819	TGAA	2	8	51045	51052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021819	AAGT	2	8	56766	56773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021819	GATA	2	8	57927	57934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021819	TTAA	2	8	57981	57988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021819	GAAA	2	8	60414	60421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021819	GAAA	2	8	60487	60494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021819	CAGA	2	8	61979	61986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021819	CCCT	2	8	62559	62566	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_021819	TCAC	2	8	62610	62617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021819	AGAT	2	8	64801	64808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021819	TGCC	2	8	68969	68976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021819	ATTA	2	8	69210	69217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021819	TAGA	2	8	69247	69254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021819	AGCC	2	8	71302	71309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021819	TTTA	2	8	71319	71326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021819	GATT	2	8	71383	71390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021819	TTCC	2	8	71501	71508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021819	ATAA	2	8	71631	71638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021819	TTTC	2	8	71744	71751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021819	AACA	2	8	71797	71804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021819	GTCT	2	8	72087	72094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021819	TGGA	2	8	72495	72502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021819	AGTA	2	8	77145	77152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021819	TTTC	2	8	77374	77381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021819	TGAT	2	8	77386	77393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021819	TCTG	2	8	77553	77560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021819	TAGG	2	8	77713	77720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021819	CAGA	2	8	77750	77757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021819	CATT	2	8	83741	83748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021819	CCTT	2	8	83812	83819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021819	GCGA	2	8	83894	83901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021819	TGAA	2	8	86138	86145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021819	AAAT	2	8	91285	91292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021819	AACC	2	8	91482	91489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021819	CTTC	2	8	91573	91580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021819	CTGT	2	8	91582	91589	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021819	CTAT	2	8	91605	91612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021819	TACT	2	8	92827	92834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021819	ACTG	2	8	114495	114502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021819	TAAA	2	8	116360	116367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021819	CAAT	2	8	119772	119779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021819	AGAT	2	8	122217	122224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.