MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021818	TGC	2	6	217860	217865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021818	CA	3	6	217882	217887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_021818	TAA	2	6	217906	217911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021818	ATT	2	6	217928	217933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021818	A	6	6	217938	217943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021818	GTCT	2	8	217959	217966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_021818	GCA	2	6	218013	218018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021818	TAACC	2	10	218086	218095	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
509	NC_021818	GTTG	3	12	218120	218131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021818	TTC	2	6	218233	218238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021818	CAA	2	6	219397	219402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021818	CTGG	2	8	219420	219427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_021818	CGC	2	6	219438	219443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_021818	AAT	2	6	219621	219626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021818	CGC	2	6	219637	219642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_021818	GCTT	2	8	219672	219679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_021818	GAT	2	6	219696	219701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021818	GCC	2	6	225502	225507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_021818	AT	3	6	225516	225521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021818	ATT	2	6	225588	225593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021818	AC	3	6	225682	225687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_021818	T	6	6	225783	225788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021818	TG	3	6	225839	225844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021818	ACC	2	6	226875	226880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_021818	TTG	2	6	227289	227294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021818	G	7	7	227310	227316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021818	AGG	2	6	227413	227418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021818	CATA	2	8	227442	227449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021818	TA	3	6	227456	227461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021818	GTA	2	6	227515	227520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021818	ATA	2	6	227560	227565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021818	CCAA	2	8	227571	227578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_021818	ATATT	2	10	227587	227596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021818	ATA	2	6	227611	227616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021818	TC	3	6	227639	227644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_021818	CGT	2	6	227698	227703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021818	C	6	6	227722	227727	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
538	NC_021818	T	6	6	227745	227750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021818	AAT	2	6	227765	227770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021818	AAC	2	6	228687	228692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021818	CTT	2	6	229217	229222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021818	TTG	2	6	229225	229230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021818	AAG	2	6	229242	229247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021818	TAAC	2	8	229251	229258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_021818	TG	3	6	229264	229269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021818	TC	3	6	230235	230240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_021818	A	6	6	232131	232136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021818	CAT	2	6	232826	232831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021818	TGTGT	2	10	233514	233523	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021818	ACG	2	6	233529	233534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021818	A	6	6	233536	233541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021818	TTGT	2	8	235413	235420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021818	ACTT	2	8	237371	237378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_021818	CGC	2	6	237406	237411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_021818	AATAA	2	10	237454	237463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021818	GCA	2	6	239768	239773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021818	GCG	2	6	239776	239781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021818	CGA	2	6	240059	240064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021818	TTG	2	6	241439	241444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021818	CAA	2	6	241474	241479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021818	A	6	6	242330	242335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021818	GT	3	6	242359	242364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021818	ATT	2	6	242420	242425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021818	TGA	2	6	242431	242436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021818	CTT	2	6	242533	242538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021818	GAG	2	6	242558	242563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021818	CT	3	6	243337	243342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_021818	CTTTT	2	10	243367	243376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
569	NC_021818	AGT	2	6	244911	244916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021818	CTT	2	6	244961	244966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021818	T	6	6	248007	248012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021818	GTC	2	6	248084	248089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021818	TCA	2	6	248184	248189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021818	CCGC	2	8	249805	249812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
575	NC_021818	GTTG	2	8	251215	251222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021818	GAT	2	6	251261	251266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021818	ATG	2	6	251279	251284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021818	GCG	2	6	252811	252816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021818	CCTA	2	8	253609	253616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_021818	ATTA	2	8	253632	253639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021818	TAA	2	6	253695	253700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021818	TA	3	6	253746	253751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021818	ATTT	2	8	253758	253765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021818	AGTT	2	8	253790	253797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021818	ATTT	2	8	253798	253805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021818	A	6	6	255663	255668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021818	CGGG	2	8	255680	255687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
588	NC_021818	TTG	2	6	255734	255739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021818	CGC	2	6	255797	255802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_021818	GT	3	6	259256	259261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021818	TAA	2	6	259271	259276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021818	AAAT	2	8	259282	259289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021818	A	7	7	259374	259380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021818	AGA	2	6	263414	263419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021818	CCA	2	6	263468	263473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_021818	AAC	2	6	263483	263488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021818	GCC	2	6	263498	263503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_021818	CGC	2	6	263594	263599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_021818	AAGCG	2	10	263607	263616	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
600	NC_021818	TG	3	6	263648	263653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021818	GGC	2	6	263802	263807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021818	AGC	2	6	263842	263847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021818	TGC	2	6	263849	263854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021818	ACT	2	6	263916	263921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021818	CGA	2	6	264041	264046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021818	GCA	2	6	264115	264120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_021818	GGA	2	6	264210	264215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021818	TAA	2	6	264228	264233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021818	AGA	2	6	264257	264262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021818	CAG	2	6	264283	264288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021818	G	6	6	264430	264435	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021818	GGA	2	6	264474	264479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021818	GGC	2	6	264494	264499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021818	GAA	2	6	264737	264742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021818	TGC	2	6	264813	264818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021818	GTC	2	6	264825	264830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021818	TTG	2	6	264886	264891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021818	GGA	2	6	264938	264943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021818	TCA	2	6	264963	264968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021818	AC	3	6	264989	264994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_021818	CGT	2	6	265057	265062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021818	AC	3	6	265158	265163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_021818	GTAG	2	8	265199	265206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021818	CCT	2	6	265299	265304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_021818	AAG	2	6	265312	265317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021818	CA	3	6	265334	265339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_021818	TGA	2	6	265347	265352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021818	GGT	2	6	265390	265395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021818	GGT	2	6	265425	265430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021818	TGT	2	6	265470	265475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021818	GCTTC	2	10	265500	265509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
633	NC_021818	CGC	2	6	265514	265519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_021818	AGG	2	6	265602	265607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021818	CCA	2	6	265632	265637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_021818	A	6	6	265655	265660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021818	AAC	2	6	265742	265747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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639	NC_021818	TC	3	6	265764	265769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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