MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021818	AAAAAG	2	12	2260642	2260653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_021818	T	6	6	2260675	2260680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021818	TAA	2	6	2261668	2261673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_021818	ATT	2	6	2261681	2261686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021818	GGC	2	6	2261724	2261729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_021818	CGC	2	6	2265289	2265294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_021818	GCT	2	6	2265316	2265321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_021818	GC	3	6	2265334	2265339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_021818	TAT	2	6	2265398	2265403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021818	GTT	2	6	2265412	2265417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_021818	CCG	2	6	2265434	2265439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_021818	TA	3	6	2265556	2265561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021818	A	7	7	2269677	2269683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_021818	GTT	2	6	2269687	2269692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021818	ACGTT	2	10	2270554	2270563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6016	NC_021818	CTT	2	6	2272458	2272463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6019	NC_021818	CAG	2	6	2272550	2272555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6021	NC_021818	ACA	2	6	2272595	2272600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_021818	A	7	7	2272619	2272625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021818	ATCCG	2	10	2272648	2272657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6024	NC_021818	ATT	2	6	2272670	2272675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_021818	CGT	2	6	2272750	2272755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6027	NC_021818	AAG	2	6	2273959	2273964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6032	NC_021818	TTG	2	6	2276190	2276195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6035	NC_021818	CGG	2	6	2278915	2278920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6039	NC_021818	AGGC	2	8	2282396	2282403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6042	NC_021818	TTA	2	6	2287116	2287121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6044	NC_021818	GGC	2	6	2287159	2287164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6048	NC_021818	TAAAAA	2	12	2288567	2288578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021818	TAT	2	6	2288602	2288607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021818	A	6	6	2288638	2288643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021818	ATCC	2	8	2288680	2288687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_021818	TG	4	8	2288749	2288756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021818	ATG	2	6	2288766	2288771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021818	TG	3	6	2288770	2288775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021818	T	6	6	2288785	2288790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021818	TTA	2	6	2288800	2288805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_021818	TGT	2	6	2288810	2288815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_021818	TAT	2	6	2288816	2288821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021818	ATA	2	6	2288826	2288831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021818	GGC	2	6	2288923	2288928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_021818	TAT	2	6	2290141	2290146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_021818	CTT	2	6	2290187	2290192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_021818	TATT	2	8	2290216	2290223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021818	TG	3	6	2290250	2290255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_021818	CAG	2	6	2290294	2290299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6069	NC_021818	A	6	6	2290485	2290490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021818	TTA	2	6	2290500	2290505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6074	NC_021818	ATA	2	6	2290729	2290734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6078	NC_021818	GTT	2	6	2290849	2290854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_021818	GCC	2	6	2293374	2293379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_021818	TGT	3	9	2293437	2293445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_021818	TAA	2	6	2293859	2293864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6110	NC_021818	GC	3	6	2294135	2294140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_021818	AGCC	2	8	2294141	2294148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_021818	TA	3	6	2294166	2294171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_021818	TTC	2	6	2294227	2294232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_021818	G	8	8	2294252	2294259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_021818	AT	3	6	2294267	2294272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021818	AAAT	2	8	2294302	2294309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021818	A	6	6	2294403	2294408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021818	ACAA	2	8	2294632	2294639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6124	NC_021818	CAT	2	6	2294818	2294823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6126	NC_021818	GCTT	2	8	2294864	2294871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_021818	GGT	2	6	2294888	2294893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_021818	TAC	2	6	2294904	2294909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_021818	ATG	2	6	2294934	2294939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_021818	TGT	2	6	2294942	2294947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_021818	ATG	2	6	2295019	2295024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6134	NC_021818	TGT	2	6	2295278	2295283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6145	NC_021818	T	6	6	2296480	2296485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_021818	CT	3	6	2296486	2296491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6259	NC_021818	TAT	2	6	2317012	2317017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6261	NC_021818	GTT	2	6	2317090	2317095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_021818	CGGCG	2	10	2317115	2317124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6392	NC_021818	TA	3	6	2369766	2369771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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