MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021818	CCT	2	6	1877802	1877807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_021818	AAT	2	6	1877876	1877881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021818	T	9	9	1877901	1877909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021818	GGC	2	6	1877946	1877951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021818	TA	3	6	1878106	1878111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021818	AAGG	2	8	1878127	1878134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021818	TCA	2	6	1878157	1878162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021818	A	6	6	1878181	1878186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021818	CTG	2	6	1878214	1878219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_021818	T	6	6	1878305	1878310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021818	T	6	6	1878320	1878325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021818	AGTC	2	8	1880489	1880496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_021818	GAA	2	6	1880583	1880588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021818	CT	3	6	1880625	1880630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_021818	A	8	8	1880642	1880649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021818	TAT	2	6	1880657	1880662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021818	CAT	2	6	1880737	1880742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021818	A	7	7	1880750	1880756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021818	GAC	2	6	1880825	1880830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021818	GA	3	6	1883197	1883202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021818	CGT	2	6	1883246	1883251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021818	AGC	2	6	1884194	1884199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021818	AATT	2	8	1884254	1884261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021818	AT	4	8	1884308	1884315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021818	TA	3	6	1884384	1884389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021818	CCA	2	6	1884516	1884521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_021818	GAA	2	6	1884530	1884535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021818	TAA	2	6	1885563	1885568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021818	CA	3	6	1887303	1887308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_021818	T	7	7	1888062	1888068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021818	T	6	6	1888887	1888892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021818	TTC	2	6	1893039	1893044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021818	GTC	3	9	1893079	1893087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_021818	AAT	2	6	1893136	1893141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021818	GA	3	6	1893142	1893147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021818	GTCC	2	8	1894649	1894656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_021818	GGC	2	6	1894712	1894717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021818	ACG	2	6	1894738	1894743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_021818	AATC	2	8	1899303	1899310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_021818	GATT	2	8	1899311	1899318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021818	GAATG	2	10	1900296	1900305	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021818	TTA	2	6	1900320	1900325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021818	TGA	2	6	1900408	1900413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021818	AAT	2	6	1900460	1900465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021818	TCAT	2	8	1900494	1900501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_021818	T	6	6	1900510	1900515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021818	A	7	7	1900592	1900598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021818	AAT	2	6	1900610	1900615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021818	GGC	2	6	1900630	1900635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_021818	GAGT	2	8	1900640	1900647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021818	ATGG	2	8	1900745	1900752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021818	AAT	2	6	1900806	1900811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021818	TGG	2	6	1900878	1900883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021818	AT	3	6	1902160	1902165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021818	TTAA	2	8	1902170	1902177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021818	AGT	2	6	1907649	1907654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021818	GCC	2	6	1909133	1909138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_021818	A	6	6	1909152	1909157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021818	GACG	2	8	1912387	1912394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_021818	AACA	2	8	1912408	1912415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_021818	ACA	2	6	1912484	1912489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021818	TC	3	6	1912793	1912798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_021818	TGA	2	6	1912837	1912842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021818	T	6	6	1912852	1912857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021818	ATT	2	6	1912925	1912930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021818	AATT	2	8	1912931	1912938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021818	GAT	2	6	1913041	1913046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021818	A	6	6	1913390	1913395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021818	CG	3	6	1913402	1913407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_021818	CGAG	2	8	1913458	1913465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_021818	GGT	2	6	1913479	1913484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021818	CGC	2	6	1913518	1913523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_021818	GTG	2	6	1918202	1918207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021818	GTT	2	6	1918324	1918329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021818	AAC	2	6	1919254	1919259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021818	TTG	2	6	1919291	1919296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021818	TTAA	2	8	1919309	1919316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021818	TG	3	6	1919321	1919326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021818	ATT	2	6	1919332	1919337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021818	AAT	2	6	1919341	1919346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021818	CAGG	2	8	1919407	1919414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_021818	TA	3	6	1919430	1919435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021818	CCT	2	6	1919516	1919521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_021818	AGAT	2	8	1919545	1919552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021818	T	6	6	1920131	1920136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021818	TAT	2	6	1920180	1920185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021818	TGG	2	6	1920221	1920226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021818	TAA	2	6	1920228	1920233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021818	A	6	6	1920249	1920254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021818	A	6	6	1920259	1920264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021818	A	6	6	1920271	1920276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021818	AAT	2	6	1920294	1920299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021818	CAT	2	6	1920340	1920345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_021818	A	6	6	1921260	1921265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021818	CGG	2	6	1921308	1921313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_021818	A	8	8	1921328	1921335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021818	AAT	2	6	1921394	1921399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021818	CGC	2	6	1921416	1921421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_021818	ATT	2	6	1921428	1921433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021818	AT	3	6	1921554	1921559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021818	ACTT	2	8	1921572	1921579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_021818	GGT	2	6	1921593	1921598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021818	TGAAAA	2	12	1922125	1922136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021818	T	8	8	1922156	1922163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021818	CCTG	2	8	1923811	1923818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_021818	A	6	6	1923828	1923833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021818	AGA	2	6	1923879	1923884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021818	AAG	2	6	1923899	1923904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021818	CCG	2	6	1923910	1923915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_021818	GAAA	2	8	1923916	1923923	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021818	CCT	2	6	1924157	1924162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_021818	TACA	2	8	1924202	1924209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_021818	T	6	6	1924254	1924259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021818	GCAG	2	8	1925949	1925956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_021818	TAG	2	6	1926912	1926917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021818	T	7	7	1926997	1927003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021818	ATA	2	6	1927062	1927067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021818	T	6	6	1927084	1927089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021818	ATTTTT	2	12	1928747	1928758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021818	TA	4	8	1928779	1928786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021818	AGA	2	6	1928818	1928823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021818	AT	3	6	1928846	1928851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021818	CAA	2	6	1928924	1928929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021818	GAAT	2	8	1928933	1928940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021818	TTA	3	9	1929930	1929938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021818	AAT	2	6	1929997	1930002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021818	AAT	2	6	1930121	1930126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021818	TCA	2	6	1930251	1930256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_021818	TTGC	2	8	1930438	1930445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_021818	GTG	2	6	1930595	1930600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021818	ACG	2	6	1930617	1930622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_021818	ATT	2	6	1930623	1930628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021818	GTA	2	6	1930632	1930637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021818	TCA	2	6	1932049	1932054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_021818	TTCG	2	8	1932058	1932065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5136	NC_021818	AAAT	2	8	1932231	1932238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_021818	TTA	2	6	1932259	1932264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5142	NC_021818	TGA	2	6	1936734	1936739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_021818	GC	3	6	1997921	1997926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5263	NC_021818	CGGT	2	8	1997964	1997971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5264	NC_021818	C	6	6	1997981	1997986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5265	NC_021818	G	7	7	1998059	1998065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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