MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 7637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021814	CGT	2	6	45	50	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021814	GAC	3	9	276	284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021814	AGA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021814	GGC	2	6	455	460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021814	GGT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021814	CAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021814	GGC	2	6	700	705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021814	GGT	2	6	714	719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021814	TGT	2	6	863	868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021814	AGT	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021814	GAG	2	6	889	894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021814	CCG	2	6	902	907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021814	GCA	2	6	928	933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021814	TAA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021814	AAT	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021814	TAT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021814	ACC	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021814	ATC	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021814	ATT	2	6	6430	6435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021814	ATG	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021814	TAT	2	6	6611	6616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021814	GTT	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021814	CTT	2	6	9569	9574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021814	GGC	2	6	12200	12205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021814	TGT	2	6	12259	12264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021814	CGG	2	6	12337	12342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021814	TTC	2	6	12382	12387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021814	AAT	2	6	12409	12414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021814	TGC	2	6	12601	12606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021814	AAC	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021814	AGC	2	6	12687	12692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021814	AAG	2	6	12717	12722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021814	TGA	2	6	12741	12746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021814	ATG	2	6	12752	12757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021814	GAA	2	6	15424	15429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021814	ATG	2	6	15444	15449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021814	TCT	2	6	17513	17518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021814	TCG	2	6	17625	17630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021814	CAC	2	6	19361	19366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021814	GTA	2	6	20541	20546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021814	TTG	2	6	22648	22653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021814	TGC	2	6	22707	22712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021814	GAT	2	6	22790	22795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021814	GCT	2	6	22810	22815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021814	CGC	2	6	27639	27644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021814	AAC	2	6	31581	31586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021814	GCC	2	6	33119	33124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021814	ATA	2	6	34175	34180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021814	TAT	2	6	34213	34218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021814	GCG	2	6	34267	34272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021814	ATG	2	6	37559	37564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021814	TAG	2	6	37567	37572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021814	TGG	2	6	37599	37604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021814	GTC	2	6	37919	37924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021814	GAC	2	6	37931	37936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021814	TCG	2	6	38587	38592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021814	TCA	2	6	38626	38631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021814	GTG	2	6	38833	38838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021814	GCG	2	6	38883	38888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021814	CCG	2	6	38913	38918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021814	ACG	3	9	38920	38928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021814	ACA	2	6	39438	39443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021814	AAT	2	6	39499	39504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021814	ATG	2	6	39603	39608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021814	GTA	2	6	39622	39627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021814	CAC	2	6	39639	39644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021814	TGA	2	6	39731	39736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021814	CGC	3	9	39773	39781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021814	ATA	2	6	39808	39813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021814	CTT	2	6	40799	40804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021814	CTC	2	6	40848	40853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021814	TTA	2	6	40866	40871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021814	TTC	2	6	42204	42209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021814	AAT	2	6	42312	42317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021814	TGG	2	6	45219	45224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021814	ATA	3	9	45240	45248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021814	GGC	2	6	45267	45272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021814	TTA	2	6	45289	45294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021814	CCT	2	6	45326	45331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021814	GAG	2	6	47398	47403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021814	ACG	2	6	49469	49474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021814	CGT	2	6	49488	49493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021814	CGT	2	6	50574	50579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021814	GCA	3	9	50594	50602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021814	TGC	2	6	52029	52034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021814	ATA	2	6	52109	52114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021814	ACG	2	6	52734	52739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021814	TAT	2	6	53931	53936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021814	CGG	2	6	55082	55087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021814	TCC	2	6	55124	55129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021814	ATT	2	6	55141	55146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021814	CAC	2	6	56068	56073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021814	ATC	2	6	56098	56103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021814	ATG	2	6	56158	56163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021814	TAT	2	6	57478	57483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021814	TAT	2	6	58350	58355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021814	TGC	2	6	58357	58362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021814	TCA	2	6	58409	58414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021814	ACA	2	6	59360	59365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021814	GCC	2	6	59394	59399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021814	ACA	2	6	59413	59418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021814	TCG	2	6	59423	59428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021814	AGT	2	6	60970	60975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021814	GTG	2	6	63049	63054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021814	CCG	2	6	65634	65639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021814	ATA	2	6	65641	65646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021814	ATT	2	6	65697	65702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021814	GAG	2	6	66970	66975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021814	CAT	2	6	73005	73010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021814	ATG	2	6	73094	73099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021814	GCT	2	6	73251	73256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021814	ATC	2	6	73441	73446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021814	TGA	2	6	74523	74528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021814	TAT	2	6	74580	74585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021814	TTA	2	6	77015	77020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021814	TGA	2	6	77021	77026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021814	ATT	2	6	77136	77141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021814	AGG	2	6	77162	77167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021814	GGC	2	6	78567	78572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021814	GTC	2	6	78602	78607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021814	TCA	2	6	79460	79465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021814	AGC	2	6	83058	83063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021814	TTC	2	6	87482	87487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021814	CAA	2	6	87657	87662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021814	AGC	2	6	90858	90863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021814	AAC	2	6	92562	92567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021814	GTT	2	6	92589	92594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021814	AAC	2	6	92930	92935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021814	CGA	2	6	92937	92942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021814	GGC	2	6	92996	93001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021814	TTA	2	6	93071	93076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021814	CGC	2	6	94191	94196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021814	TAC	2	6	98824	98829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021814	TTG	2	6	99533	99538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021814	TAA	2	6	100792	100797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021814	ACA	2	6	102765	102770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021814	GGC	2	6	105056	105061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021814	GCC	2	6	105066	105071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021814	GGT	2	6	105610	105615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021814	GGT	2	6	105641	105646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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