MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021814	TTA	2	6	1283802	1283807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021814	TAT	2	6	1283873	1283878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021814	TA	3	6	1283922	1283927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021814	ATA	3	9	1283959	1283967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021814	AAT	2	6	1284012	1284017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021814	ATA	2	6	1284037	1284042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021814	ATT	2	6	1284053	1284058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021814	TTA	2	6	1284124	1284129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021814	AATC	2	8	1285132	1285139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_021814	TGA	2	6	1285160	1285165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021814	ATT	2	6	1285239	1285244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021814	TTAAT	2	10	1285313	1285322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021814	AGT	2	6	1285355	1285360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021814	GGA	2	6	1285430	1285435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021814	GCTG	2	8	1285445	1285452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_021814	T	6	6	1285540	1285545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021814	A	6	6	1285559	1285564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021814	AGG	2	6	1285596	1285601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021814	AAT	2	6	1285651	1285656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021814	A	6	6	1285711	1285716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021814	TGA	2	6	1287105	1287110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021814	TGA	2	6	1287131	1287136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021814	GGC	2	6	1287137	1287142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021814	GAG	2	6	1287145	1287150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021814	GGGC	2	8	1287165	1287172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_021814	ACC	2	6	1287201	1287206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_021814	TAT	2	6	1291273	1291278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021814	A	6	6	1291327	1291332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021814	AAT	2	6	1291371	1291376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021814	TCG	2	6	1291396	1291401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021814	GT	3	6	1291441	1291446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021814	TTGTTA	2	12	1291492	1291503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021814	AAT	2	6	1291508	1291513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021814	CAG	2	6	1302549	1302554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021814	GGA	2	6	1302570	1302575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021814	ATT	2	6	1302595	1302600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021814	GGC	2	6	1302680	1302685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021814	CAG	2	6	1302713	1302718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021814	ATG	2	6	1302774	1302779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021814	TCA	2	6	1302787	1302792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021814	GAG	2	6	1302845	1302850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021814	TCC	2	6	1302854	1302859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_021814	AAT	2	6	1302894	1302899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021814	GAA	2	6	1304305	1304310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021814	GTC	2	6	1304332	1304337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021814	GCG	2	6	1304338	1304343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021814	GCTG	2	8	1308341	1308348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_021814	TCC	3	9	1308375	1308383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_021814	GCC	2	6	1308449	1308454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_021814	GCT	2	6	1308493	1308498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021814	C	6	6	1308535	1308540	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3552	NC_021814	GCCT	2	8	1311832	1311839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_021814	ATA	2	6	1313502	1313507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021814	CGG	2	6	1313508	1313513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021814	AATGC	2	10	1313517	1313526	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3556	NC_021814	AAT	2	6	1313601	1313606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021814	AT	3	6	1313614	1313619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021814	GTGGA	2	10	1313636	1313645	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021814	TAAA	2	8	1313647	1313654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021814	ATC	2	6	1313682	1313687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021814	CAA	2	6	1313763	1313768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021814	GC	3	6	1313788	1313793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_021814	AAT	2	6	1313902	1313907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021814	AAG	2	6	1313924	1313929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021814	TAT	2	6	1313971	1313976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021814	T	8	8	1314004	1314011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021814	ATG	2	6	1314016	1314021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021814	ATAA	2	8	1314114	1314121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021814	GGT	2	6	1321702	1321707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021814	AATAAC	2	12	1328321	1328332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3571	NC_021814	GAA	2	6	1328370	1328375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021814	AAC	2	6	1329803	1329808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021814	ATG	2	6	1331304	1331309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021814	GGT	2	6	1335339	1335344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021814	GTT	2	6	1336783	1336788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021814	CAT	2	6	1336835	1336840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_021814	GCA	2	6	1336849	1336854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_021814	GAA	2	6	1336917	1336922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021814	AAC	2	6	1337825	1337830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_021814	TGGT	2	8	1337840	1337847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021814	ATA	2	6	1337855	1337860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021814	TAA	2	6	1338008	1338013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021814	CTG	2	6	1338048	1338053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_021814	CAA	2	6	1338065	1338070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021814	TGA	2	6	1338099	1338104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021814	GT	3	6	1338120	1338125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021814	AATT	2	8	1338138	1338145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021814	ATGA	2	8	1340211	1340218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021814	TAA	2	6	1346794	1346799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021814	TGT	2	6	1346828	1346833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021814	TTG	2	6	1346896	1346901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021814	TCA	2	6	1346907	1346912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021814	ATA	2	6	1346925	1346930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021814	TTA	2	6	1347018	1347023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021814	TA	3	6	1347072	1347077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021814	ATG	2	6	1347106	1347111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021814	AT	3	6	1347113	1347118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021814	TAT	2	6	1347149	1347154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021814	T	7	7	1347154	1347160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021814	TTTAT	2	10	1347166	1347175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021814	T	6	6	1347177	1347182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021814	TCTT	2	8	1347205	1347212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_021814	TTA	2	6	1349164	1349169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021814	CTTTT	2	10	1349227	1349236	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3605	NC_021814	AT	4	8	1349256	1349263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021814	AAAT	2	8	1349264	1349271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021814	ACT	2	6	1349284	1349289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021814	T	6	6	1349296	1349301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021814	TAA	2	6	1349317	1349322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021814	TAT	2	6	1349378	1349383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021814	ATT	2	6	1349415	1349420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021814	ATT	2	6	1349431	1349436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021814	TC	3	6	1350152	1350157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_021814	CAA	2	6	1350158	1350163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_021814	TATTT	2	10	1354371	1354380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021814	AAT	3	9	1355861	1355869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021814	T	8	8	1357451	1357458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021814	TAA	2	6	1357502	1357507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021814	TA	3	6	1357562	1357567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021814	CAT	2	6	1357610	1357615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021814	TGA	2	6	1358831	1358836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021814	GAT	2	6	1358842	1358847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021814	AAT	2	6	1358864	1358869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021814	AT	3	6	1358898	1358903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021814	T	7	7	1358938	1358944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021814	CTT	2	6	1359943	1359948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021814	TGG	2	6	1359956	1359961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021814	A	6	6	1359990	1359995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021814	T	7	7	1360011	1360017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021814	AGCGC	2	10	1366235	1366244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3631	NC_021814	CG	3	6	1367197	1367202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3632	NC_021814	A	9	9	1367205	1367213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021814	GAT	2	6	1367224	1367229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3636	NC_021814	GAT	2	6	1367313	1367318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3756	NC_021814	TTC	2	6	1430433	1430438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3760	NC_021814	TGA	2	6	1430502	1430507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3762	NC_021814	TA	3	6	1430519	1430524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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