MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021814	TGA	2	6	1091765	1091770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021814	CGA	2	6	1091879	1091884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021814	AAT	2	6	1091945	1091950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021814	CAG	2	6	1092037	1092042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_021814	AAC	2	6	1092071	1092076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021814	ATT	2	6	1092202	1092207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021814	GCA	2	6	1092218	1092223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021814	TGG	2	6	1092280	1092285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021814	TA	3	6	1092336	1092341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021814	ATT	2	6	1092504	1092509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021814	ATA	2	6	1092529	1092534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021814	CTGTA	2	10	1094400	1094409	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_021814	GCCT	2	8	1095446	1095453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_021814	T	6	6	1095453	1095458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021814	A	6	6	1095480	1095485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021814	C	6	6	1097295	1097300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3017	NC_021814	CCCT	2	8	1097318	1097325	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3018	NC_021814	T	6	6	1097340	1097345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021814	AGGG	2	8	1097380	1097387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021814	AAT	2	6	1098715	1098720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021814	TGAT	2	8	1098753	1098760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021814	AC	3	6	1101207	1101212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_021814	T	6	6	1112161	1112166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021814	ATTAA	2	10	1112198	1112207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021814	TGCTT	2	10	1112255	1112264	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_021814	ATGC	2	8	1112288	1112295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_021814	GTC	2	6	1113041	1113046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_021814	ACC	2	6	1113489	1113494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_021814	T	6	6	1113564	1113569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021814	TTG	2	6	1113577	1113582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021814	ATG	2	6	1113610	1113615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021814	TCG	2	6	1114312	1114317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_021814	TCC	2	6	1114326	1114331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_021814	TTC	2	6	1114343	1114348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_021814	TCA	2	6	1114385	1114390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_021814	ATC	2	6	1115677	1115682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021814	T	6	6	1115686	1115691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021814	T	6	6	1115800	1115805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021814	GGCCT	2	10	1120228	1120237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3040	NC_021814	TA	3	6	1120247	1120252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021814	TTC	2	6	1120261	1120266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021814	CAT	2	6	1120273	1120278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_021814	ATG	2	6	1121380	1121385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021814	ATT	2	6	1121395	1121400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021814	ATT	3	9	1121410	1121418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021814	AT	3	6	1121427	1121432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021814	TTA	2	6	1121458	1121463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021814	ATT	3	9	1121479	1121487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021814	CGT	2	6	1121566	1121571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021814	AAT	2	6	1121657	1121662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021814	T	6	6	1125854	1125859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021814	AGC	2	6	1126037	1126042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_021814	GTT	2	6	1126046	1126051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021814	GAAC	2	8	1126053	1126060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_021814	TAAA	2	8	1126076	1126083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021814	GTT	2	6	1128650	1128655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021814	TGAGC	2	10	1129650	1129659	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_021814	TGCG	2	8	1129666	1129673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_021814	GGC	2	6	1132306	1132311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_021814	GAAA	2	8	1134699	1134706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021814	C	6	6	1134712	1134717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3062	NC_021814	TA	4	8	1134763	1134770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021814	TAG	2	6	1134811	1134816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021814	CAA	2	6	1134916	1134921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021814	A	9	9	1134927	1134935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021814	TTC	2	6	1134959	1134964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_021814	GAT	2	6	1134987	1134992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021814	TCT	2	6	1136535	1136540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_021814	TAAT	2	8	1136568	1136575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021814	AT	3	6	1136598	1136603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021814	TTG	2	6	1136631	1136636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021814	TGCT	2	8	1136659	1136666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_021814	AT	3	6	1136668	1136673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021814	ATTGT	2	10	1136698	1136707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021814	T	6	6	1136707	1136712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021814	AAT	2	6	1139361	1139366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021814	AG	3	6	1139602	1139607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021814	GGC	2	6	1145336	1145341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_021814	TGAAGG	2	12	1148791	1148802	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021814	AATG	2	8	1148817	1148824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021814	CGG	2	6	1148873	1148878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_021814	ACT	2	6	1148924	1148929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_021814	ATT	2	6	1148959	1148964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021814	GT	3	6	1149047	1149052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021814	A	8	8	1149065	1149072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021814	TAA	2	6	1149132	1149137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021814	ATG	2	6	1149147	1149152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021814	TCA	2	6	1149214	1149219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_021814	AT	3	6	1149251	1149256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021814	A	6	6	1149296	1149301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021814	ATT	2	6	1149382	1149387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021814	A	6	6	1149453	1149458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021814	TAA	2	6	1149484	1149489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021814	T	6	6	1150663	1150668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021814	ACG	2	6	1150693	1150698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_021814	AC	3	6	1151832	1151837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_021814	AAGC	2	8	1151845	1151852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_021814	ATT	3	9	1153598	1153606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021814	AGTT	2	8	1153620	1153627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021814	TTA	2	6	1153641	1153646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021814	CCA	2	6	1155389	1155394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_021814	T	6	6	1155407	1155412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021814	CTG	2	6	1156036	1156041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_021814	ACA	2	6	1156058	1156063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_021814	ATT	2	6	1156115	1156120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021814	TA	3	6	1156139	1156144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021814	TA	3	6	1156203	1156208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021814	TA	3	6	1156215	1156220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021814	ACT	2	6	1156351	1156356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021814	CAA	2	6	1161267	1161272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_021814	TGA	2	6	1162396	1162401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021814	AGG	2	6	1163714	1163719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021814	GAC	2	6	1163726	1163731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021814	GGCGC	2	10	1168695	1168704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3115	NC_021814	TTA	2	6	1169386	1169391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021814	ATT	2	6	1169397	1169402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021814	AGT	2	6	1169478	1169483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021814	AAC	2	6	1169530	1169535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_021814	GA	3	6	1169543	1169548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_021814	T	6	6	1169589	1169594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021814	TGC	2	6	1169630	1169635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_021814	TTA	2	6	1169683	1169688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021814	ATT	2	6	1169714	1169719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021814	ATT	2	6	1169725	1169730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021814	ATTT	2	8	1169739	1169746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021814	TTA	2	6	1169753	1169758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021814	TTAAA	2	10	1169806	1169815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021814	AAC	2	6	1169938	1169943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_021814	TGG	3	9	1170088	1170096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021814	GCTG	2	8	1170685	1170692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_021814	TAAT	2	8	1170699	1170706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021814	TTACC	2	10	1170808	1170817	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3133	NC_021814	TAT	2	6	1170827	1170832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3260	NC_021814	TTG	2	6	1202590	1202595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_021814	GCGA	2	8	1202604	1202611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3263	NC_021814	AAT	2	6	1202722	1202727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3286	NC_021814	CGAT	2	8	1206247	1206254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3389	NC_021814	TGT	2	6	1246419	1246424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_021814	TGA	2	6	1246426	1246431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_021814	A	6	6	1246451	1246456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3392	NC_021814	CT	3	6	1246476	1246481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3393	NC_021814	T	7	7	1246489	1246495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_021814	TAGA	2	8	1283761	1283768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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