MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021814	CCA	2	6	522889	522894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_021814	A	6	6	522907	522912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021814	ACC	2	6	522955	522960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_021814	TGG	2	6	523003	523008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021814	ACA	2	6	523022	523027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021814	ATT	2	6	523029	523034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021814	TAC	2	6	523059	523064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021814	TTTTAA	2	12	523065	523076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021814	CATT	2	8	523937	523944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_021814	GTC	2	6	523982	523987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_021814	AGG	2	6	524065	524070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021814	A	7	7	524165	524171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021814	GCA	2	6	524172	524177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_021814	TGC	2	6	524184	524189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021814	TAA	2	6	524260	524265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021814	ATG	2	6	524313	524318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021814	AGA	2	6	524802	524807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021814	A	8	8	524892	524899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021814	ATAA	2	8	524908	524915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021814	TCCA	2	8	524923	524930	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_021814	TGC	3	9	524951	524959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021814	GCGG	2	8	525045	525052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_021814	TTAA	2	8	530780	530787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021814	CAT	2	6	535505	535510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021814	T	6	6	537678	537683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021814	ACC	2	6	537696	537701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_021814	TAA	2	6	537711	537716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021814	AGTA	2	8	537772	537779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021814	CAT	2	6	541340	541345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021814	AGA	2	6	542422	542427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021814	TC	3	6	544770	544775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_021814	ACA	2	6	544781	544786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_021814	ATC	2	6	544813	544818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021814	GTA	2	6	544825	544830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021814	CT	3	6	547646	547651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_021814	ATA	2	6	549321	549326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021814	TAA	2	6	549355	549360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021814	CTG	2	6	549403	549408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021814	TAT	2	6	549436	549441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021814	ATT	2	6	549493	549498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021814	TAA	2	6	549536	549541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021814	TAAC	2	8	549550	549557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_021814	AG	4	8	549596	549603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021814	T	7	7	549685	549691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021814	TGC	2	6	549702	549707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021814	TTA	2	6	549708	549713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021814	T	7	7	549872	549878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021814	AAT	2	6	549883	549888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021814	TCTTT	2	10	549896	549905	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_021814	AGG	2	6	549935	549940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021814	ATC	2	6	549953	549958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021814	GGCT	2	8	549963	549970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_021814	AGG	2	6	549991	549996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021814	AG	3	6	549998	550003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021814	GAT	2	6	550083	550088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021814	TCA	2	6	550200	550205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021814	TA	3	6	550235	550240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021814	ATT	2	6	550358	550363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021814	TAA	2	6	550371	550376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021814	A	6	6	550402	550407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021814	TGA	2	6	551305	551310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021814	TTAC	2	8	551314	551321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_021814	TAT	2	6	551339	551344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021814	TTG	2	6	551349	551354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021814	A	6	6	551390	551395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021814	GT	3	6	551423	551428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021814	AGT	2	6	551484	551489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021814	GAT	2	6	551505	551510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021814	TCA	2	6	551583	551588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_021814	CTG	2	6	551615	551620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021814	GACA	2	8	551632	551639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_021814	TA	3	6	555873	555878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021814	AAT	2	6	555885	555890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021814	GT	3	6	555911	555916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021814	ATT	2	6	555938	555943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021814	CG	3	6	556053	556058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_021814	ATT	2	6	556069	556074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021814	TAA	3	9	556080	556088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021814	A	7	7	556087	556093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021814	ATC	2	6	556104	556109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_021814	ATT	2	6	556123	556128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021814	CA	3	6	556166	556171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_021814	ATT	2	6	557077	557082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021814	T	7	7	557122	557128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021814	ACAT	2	8	557207	557214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_021814	CCA	2	6	557217	557222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_021814	AGTAA	2	10	557257	557266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021814	TAA	2	6	557332	557337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021814	TTA	2	6	557349	557354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021814	GTA	2	6	557360	557365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021814	AGT	2	6	557388	557393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021814	GAA	2	6	557401	557406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021814	A	6	6	557437	557442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021814	ATAA	2	8	557445	557452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021814	T	6	6	558213	558218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021814	TAT	2	6	558246	558251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021814	A	6	6	558252	558257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021814	T	6	6	558260	558265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021814	AGT	2	6	558267	558272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021814	TA	4	8	558279	558286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021814	ATC	2	6	558287	558292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_021814	GGT	2	6	558297	558302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021814	AT	3	6	558344	558349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021814	GAT	2	6	558368	558373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021814	TGCC	2	8	559292	559299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_021814	ACT	2	6	559326	559331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_021814	TAT	2	6	559335	559340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021814	A	6	6	559367	559372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021814	CAA	2	6	562819	562824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021814	TTAA	2	8	562830	562837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021814	TA	3	6	562863	562868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021814	AAT	2	6	562891	562896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021814	AAAT	2	8	562955	562962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021814	GC	3	6	563355	563360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_021814	ATC	2	6	563361	563366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021814	CA	3	6	565578	565583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_021814	CGA	2	6	569454	569459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_021814	GTC	2	6	569474	569479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021814	AG	3	6	573562	573567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021814	TGGC	2	8	578330	578337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_021814	ACC	2	6	578355	578360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_021814	ATA	2	6	578425	578430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021814	TA	3	6	578471	578476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021814	CAT	2	6	578483	578488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_021814	GGC	2	6	579100	579105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021814	GAT	2	6	579181	579186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021814	GGC	2	6	581452	581457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021814	GCG	2	6	581514	581519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_021814	ACC	2	6	584109	584114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_021814	ATTC	2	8	584118	584125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_021814	GTT	2	6	584140	584145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021814	TTTGT	2	10	584203	584212	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021814	ATG	2	6	584241	584246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021814	CGC	2	6	587657	587662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1636	NC_021814	TGT	2	6	588109	588114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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