MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021814	GCA	2	6	368868	368873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021814	GGCCA	2	10	368875	368884	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_021814	AGAA	2	8	368915	368922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021814	CAT	3	9	369012	369020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021814	GCT	2	6	369068	369073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021814	TCT	2	6	370024	370029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021814	TAT	2	6	370114	370119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021814	ATC	2	6	370949	370954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021814	GTT	2	6	371098	371103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021814	T	6	6	371102	371107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021814	GGCT	2	8	371139	371146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_021814	GTC	2	6	371214	371219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021814	ATT	2	6	371568	371573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021814	T	6	6	371572	371577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021814	AGG	2	6	371645	371650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021814	TGG	2	6	372360	372365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021814	TGG	2	6	372385	372390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021814	T	7	7	372393	372399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021814	ATA	2	6	372445	372450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021814	CTT	2	6	372508	372513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021814	T	7	7	372512	372518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021814	CTT	2	6	372635	372640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021814	TA	3	6	372647	372652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021814	TCCA	2	8	372699	372706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_021814	TTG	2	6	372763	372768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021814	ACTC	2	8	372805	372812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_021814	GCC	2	6	372817	372822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_021814	ATT	2	6	372837	372842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021814	TA	3	6	372848	372853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021814	TTTA	2	8	372892	372899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021814	TTA	3	9	372897	372905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021814	AT	3	6	372925	372930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021814	ATTT	2	8	373002	373009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021814	GA	3	6	373076	373081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021814	A	6	6	373639	373644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_021814	GCA	2	6	374335	374340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_021814	TCATT	2	10	374474	374483	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_021814	TAT	2	6	374484	374489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021814	T	6	6	374489	374494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021814	TTCC	2	8	374496	374503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_021814	ATG	2	6	374508	374513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021814	TTA	2	6	374526	374531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021814	T	6	6	374578	374583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021814	TA	3	6	374606	374611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021814	TAT	2	6	374619	374624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021814	ACAT	2	8	374659	374666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_021814	ATA	2	6	374672	374677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021814	TCTG	2	8	374710	374717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_021814	TGA	2	6	374761	374766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021814	ATC	2	6	374789	374794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021814	TAT	2	6	374919	374924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021814	GTT	2	6	374967	374972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021814	AAT	2	6	374987	374992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021814	CTGT	2	8	375686	375693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_021814	GAC	2	6	375700	375705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021814	GTCTG	2	10	379566	379575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1061	NC_021814	TCC	2	6	379578	379583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_021814	AAT	2	6	379595	379600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021814	CAT	2	6	379604	379609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021814	GAA	2	6	379674	379679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021814	GTA	2	6	379735	379740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021814	TGCC	2	8	379811	379818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_021814	CAGAC	2	10	382401	382410	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_021814	CAGG	2	8	382433	382440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_021814	G	7	7	382781	382787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021814	ATA	2	6	382791	382796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021814	ACTG	2	8	382808	382815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_021814	AC	3	6	382843	382848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_021814	TAA	3	9	382851	382859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021814	GTT	2	6	382873	382878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021814	CGGTGG	2	12	384228	384239	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1077	NC_021814	GTT	2	6	385258	385263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021814	C	7	7	385285	385291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1084	NC_021814	A	6	6	387025	387030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021814	A	6	6	387500	387505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021814	CATC	2	8	387573	387580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_021814	T	7	7	388510	388516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021814	GCCA	2	8	389769	389776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_021814	AATTC	2	10	389909	389918	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_021814	GC	3	6	389983	389988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1092	NC_021814	AACC	2	8	390057	390064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1097	NC_021814	CGAT	2	8	390166	390173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_021814	A	6	6	391893	391898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021814	T	7	7	391926	391932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021814	AT	3	6	391977	391982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021814	ATA	2	6	391989	391994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021814	TGG	2	6	392027	392032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021814	A	7	7	392036	392042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021814	TGT	2	6	392183	392188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021814	C	6	6	393620	393625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1106	NC_021814	ATG	2	6	393656	393661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021814	T	6	6	395405	395410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021814	TTCT	2	8	395412	395419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_021814	ATA	2	6	398798	398803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021814	CCG	2	6	398873	398878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_021814	CTG	2	6	398972	398977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021814	GTG	2	6	399004	399009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021814	TTG	2	6	399044	399049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021814	T	9	9	399089	399097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021814	CG	3	6	399189	399194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_021814	ATTG	2	8	399221	399228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021814	ATT	2	6	399234	399239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021814	T	8	8	399291	399298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021814	GCG	2	6	402757	402762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021814	TAT	2	6	403885	403890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021814	GCG	2	6	403967	403972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021814	ATA	2	6	404308	404313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021814	ATA	2	6	404334	404339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021814	TAA	2	6	404346	404351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021814	AGC	2	6	404373	404378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021814	GAA	2	6	404396	404401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021814	CGG	2	6	404428	404433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021814	A	7	7	405179	405185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021814	GCG	2	6	405264	405269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021814	A	6	6	406057	406062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021814	T	6	6	406141	406146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021814	GTT	2	6	406149	406154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_021814	CGA	2	6	406296	406301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021814	TCA	2	6	406376	406381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_021814	TCA	2	6	406582	406587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1269	NC_021814	AT	3	6	467602	467607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_021814	ATGT	2	8	467615	467622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_021814	TGC	2	6	484701	484706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_021814	TGG	2	6	484721	484726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_021814	GTG	2	6	484777	484782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_021814	GATT	2	8	484866	484873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021814	ATG	2	6	484877	484882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1418	NC_021814	GTA	2	6	490743	490748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_021814	AT	3	6	490769	490774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_021814	GT	3	6	490782	490787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_021814	AAT	2	6	490828	490833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_021814	GAAG	2	8	491142	491149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_021814	AACGT	2	10	491753	491762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1433	NC_021814	ATT	2	6	492281	492286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_021814	ACC	2	6	496829	496834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1446	NC_021814	GTT	2	6	501462	501467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_021814	CTTT	2	8	507361	507368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1453	NC_021814	A	6	6	507435	507440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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