MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021814	TTA	2	6	205115	205120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021814	TTG	2	6	205175	205180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021814	CCG	2	6	205213	205218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_021814	CTG	2	6	205253	205258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021814	A	6	6	205287	205292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021814	A	7	7	205296	205302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021814	G	6	6	205338	205343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021814	CGC	2	6	207678	207683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_021814	CGT	2	6	207784	207789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021814	CCG	2	6	207847	207852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_021814	ATT	2	6	208157	208162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021814	TG	3	6	208573	208578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021814	TGA	2	6	208601	208606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021814	GGGCG	2	10	208646	208655	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
515	NC_021814	CGG	2	6	208667	208672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021814	TCA	2	6	208699	208704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021814	GC	3	6	208707	208712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_021814	CAG	2	6	208775	208780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021814	T	7	7	208864	208870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021814	ATA	2	6	208914	208919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021814	T	7	7	208929	208935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021814	A	6	6	209611	209616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021814	T	6	6	209637	209642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021814	ACG	2	6	209679	209684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021814	ATT	2	6	209703	209708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021814	TTCC	2	8	211132	211139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_021814	AT	3	6	212945	212950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021814	TA	3	6	212956	212961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021814	ATA	2	6	212974	212979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021814	AAT	2	6	213005	213010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021814	ATG	2	6	213046	213051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021814	T	6	6	213087	213092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021814	TGAG	2	8	213100	213107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021814	TAG	2	6	213112	213117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021814	ATT	2	6	213198	213203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021814	CAC	2	6	213210	213215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_021814	ATTT	2	8	213236	213243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021814	TGA	2	6	214407	214412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021814	TCA	2	6	214416	214421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021814	TTC	2	6	214434	214439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021814	GAA	2	6	214446	214451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021814	ACA	2	6	217218	217223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021814	GCG	2	6	217278	217283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021814	AGCGC	2	10	217378	217387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
545	NC_021814	TTG	2	6	218881	218886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021814	AAT	2	6	218920	218925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021814	CAG	2	6	219019	219024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021814	ACC	2	6	219028	219033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_021814	TCA	2	6	219042	219047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021814	ATT	2	6	219055	219060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021814	GCA	2	6	219070	219075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021814	CGT	2	6	220130	220135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021814	CAAT	2	8	221563	221570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_021814	GTT	2	6	223485	223490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021814	CGC	2	6	223544	223549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_021814	GCATC	2	10	223570	223579	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
557	NC_021814	TAA	2	6	223600	223605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021814	TGC	2	6	224558	224563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021814	GCGGT	2	10	224581	224590	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
560	NC_021814	TTC	2	6	226650	226655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021814	CGC	2	6	226692	226697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_021814	A	7	7	226711	226717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021814	T	7	7	226723	226729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021814	AAG	2	6	226735	226740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021814	TTA	2	6	226756	226761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021814	GCC	2	6	227224	227229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_021814	AGG	2	6	227251	227256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021814	TAT	2	6	228178	228183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021814	GCC	2	6	230533	230538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_021814	GAC	2	6	230564	230569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021814	GTT	2	6	230634	230639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021814	AG	3	6	230674	230679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021814	GTT	2	6	230748	230753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021814	T	6	6	231521	231526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021814	ATTA	2	8	235889	235896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021814	CTG	2	6	235902	235907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021814	GTG	2	6	235937	235942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021814	AATTT	2	10	235976	235985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021814	AAAG	2	8	235998	236005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021814	AGA	2	6	236019	236024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021814	T	7	7	236065	236071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021814	AT	3	6	236072	236077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021814	T	7	7	236094	236100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021814	TGT	2	6	236107	236112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021814	TAAT	2	8	236144	236151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021814	CAGGC	2	10	236197	236206	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
587	NC_021814	GTT	2	6	236215	236220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021814	ATT	2	6	236303	236308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021814	T	7	7	236307	236313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021814	AT	3	6	238565	238570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021814	TATTT	2	10	238612	238621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021814	ATT	2	6	238626	238631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021814	ATTA	2	8	238642	238649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021814	TA	3	6	238648	238653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021814	ATG	2	6	238673	238678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021814	AGG	2	6	238696	238701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021814	AT	3	6	238924	238929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021814	AAG	2	6	238940	238945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021814	TA	3	6	238946	238951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021814	GCGCT	2	10	238974	238983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
601	NC_021814	CCA	2	6	239582	239587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_021814	ATA	2	6	239631	239636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021814	CCA	2	6	239648	239653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_021814	CGTG	2	8	239697	239704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_021814	AG	3	6	239718	239723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021814	GCT	2	6	239732	239737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021814	GCC	2	6	239766	239771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_021814	GCG	2	6	239817	239822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021814	A	6	6	239844	239849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021814	AGC	3	9	239877	239885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021814	GAT	2	6	239888	239893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021814	TGC	2	6	239917	239922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021814	TTC	2	6	239970	239975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021814	CAT	2	6	239987	239992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021814	CAG	2	6	239993	239998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021814	CGC	2	6	240064	240069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_021814	TAA	2	6	240074	240079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021814	AG	3	6	240083	240088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021814	CGT	2	6	240104	240109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021814	CGAG	2	8	240121	240128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_021814	CGC	2	6	240184	240189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_021814	GC	3	6	240221	240226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_021814	CAG	2	6	240281	240286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021814	AGGCA	2	10	240309	240318	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
625	NC_021814	GCG	2	6	240324	240329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021814	CGC	2	6	240368	240373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_021814	CAG	2	6	240386	240391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021814	CGT	2	6	240430	240435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021814	TGC	2	6	240475	240480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021814	GC	3	6	240512	240517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_021814	CGC	3	9	240544	240552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021814	GC	3	6	240554	240559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021814	GA	3	6	240580	240585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021814	CGTT	2	8	240626	240633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
635	NC_021814	CGA	3	9	240712	240720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021814	GCTC	2	8	240745	240752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_021814	CGC	2	6	240769	240774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_021814	GCA	2	6	240792	240797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021814	AAT	2	6	240824	240829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021814	ACCG	2	8	240830	240837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
641	NC_021814	GCA	2	6	240847	240852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_021814	TCG	2	6	240874	240879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_021814	AAT	2	6	240887	240892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_021814	GC	3	6	240910	240915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_021814	CGG	2	6	240949	240954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_021814	GAAT	2	8	240970	240977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
647	NC_021814	T	8	8	241001	241008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_021814	CA	3	6	241019	241024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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650	NC_021814	AAT	2	6	241070	241075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_021814	AAT	2	6	241091	241096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_021814	TG	4	8	241105	241112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
653	NC_021814	A	6	6	241165	241170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_021814	CGA	2	6	241174	241179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_021814	TCG	2	6	241182	241187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_021814	A	6	6	242137	242142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_021814	GGC	2	6	243342	243347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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660	NC_021814	CAA	2	6	245205	245210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_021814	AT	3	6	245240	245245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_021814	T	6	6	246565	246570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_021814	CTG	2	6	247874	247879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_021814	T	6	6	247917	247922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_021814	TAC	2	6	248912	248917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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667	NC_021814	CGC	2	6	250475	250480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_021814	GCG	2	6	250483	250488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_021814	TAC	2	6	250524	250529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_021814	TGG	2	6	250588	250593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
672	NC_021814	GCC	2	6	251172	251177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
673	NC_021814	CGG	2	6	251183	251188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_021814	CTT	2	6	251231	251236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
675	NC_021814	TAC	2	6	251280	251285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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678	NC_021814	CGG	2	6	251364	251369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
679	NC_021814	A	7	7	251377	251383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
680	NC_021814	TA	3	6	251396	251401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_021814	TA	3	6	253171	253176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
684	NC_021814	TAT	2	6	253180	253185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_021814	A	7	7	253589	253595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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694	NC_021814	ATT	2	6	260287	260292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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707	NC_021814	ATA	2	6	265369	265374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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711	NC_021814	TAT	2	6	265525	265530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
712	NC_021814	ATA	2	6	265545	265550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
713	NC_021814	AGCGA	2	10	265562	265571	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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747	NC_021814	T	6	6	275448	275453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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751	NC_021814	T	7	7	275593	275599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_021814	A	7	7	276903	276909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_021814	TAA	2	6	280511	280516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_021814	ATCAG	2	10	282588	282597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
772	NC_021814	AG	3	6	282596	282601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
773	NC_021814	AT	3	6	282618	282623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_021814	TAA	2	6	283455	283460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_021814	T	6	6	283480	283485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
776	NC_021814	AAAT	2	8	283498	283505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_021814	A	6	6	283536	283541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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