MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021814	A	6	6	1802383	1802388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021814	TGAA	2	8	1803726	1803733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021814	AGA	2	6	1803788	1803793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021814	AAT	2	6	1804654	1804659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021814	TGA	2	6	1804673	1804678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021814	ATTT	2	8	1804706	1804713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021814	GTT	2	6	1804714	1804719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021814	TC	3	6	1805286	1805291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_021814	AG	3	6	1805412	1805417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021814	GGA	2	6	1805527	1805532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021814	CG	3	6	1806141	1806146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_021814	TAA	2	6	1806228	1806233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021814	ATGG	2	8	1806337	1806344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021814	GAT	2	6	1806371	1806376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021814	T	6	6	1807704	1807709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021814	GA	3	6	1807748	1807753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021814	A	6	6	1808826	1808831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021814	TC	4	8	1808884	1808891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_021814	T	6	6	1808947	1808952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021814	ACG	2	6	1808981	1808986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_021814	T	8	8	1809006	1809013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021814	TTA	2	6	1809090	1809095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021814	CGC	2	6	1809184	1809189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_021814	GAA	2	6	1809195	1809200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021814	CTG	2	6	1809248	1809253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021814	TGGC	2	8	1811790	1811797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_021814	CAGC	2	8	1811828	1811835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_021814	GAT	3	9	1812332	1812340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021814	CT	3	6	1812356	1812361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_021814	CCT	2	6	1812818	1812823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_021814	TGC	2	6	1812894	1812899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_021814	CTAC	2	8	1812920	1812927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_021814	AAT	2	6	1812965	1812970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021814	T	7	7	1813260	1813266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021814	A	6	6	1816840	1816845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021814	TTTTA	2	10	1816886	1816895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021814	GAG	2	6	1816940	1816945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021814	A	6	6	1816973	1816978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021814	GC	3	6	1817010	1817015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_021814	CTG	2	6	1817039	1817044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021814	TAT	2	6	1817047	1817052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021814	GA	3	6	1817088	1817093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021814	GCG	2	6	1817364	1817369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021814	CA	3	6	1818942	1818947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_021814	A	6	6	1818970	1818975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021814	AAT	2	6	1818981	1818986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021814	CATA	2	8	1818994	1819001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_021814	AAT	2	6	1819007	1819012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021814	T	7	7	1822328	1822334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021814	CTG	2	6	1822475	1822480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021814	CGT	2	6	1822497	1822502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021814	TTG	2	6	1823550	1823555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021814	AT	3	6	1823592	1823597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021814	ATT	2	6	1823615	1823620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021814	AAC	2	6	1823622	1823627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021814	A	7	7	1823630	1823636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021814	CGA	2	6	1827620	1827625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_021814	AGG	2	6	1827664	1827669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021814	ACC	2	6	1828511	1828516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_021814	TGA	2	6	1828529	1828534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021814	ATT	2	6	1828535	1828540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021814	TGT	2	6	1828556	1828561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021814	TTCA	2	8	1828574	1828581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_021814	AGG	2	6	1829248	1829253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021814	TAT	2	6	1829276	1829281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021814	AAATA	2	10	1829297	1829306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021814	GAA	2	6	1829920	1829925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021814	AGT	2	6	1829930	1829935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021814	TTTG	2	8	1829965	1829972	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021814	CCA	2	6	1829986	1829991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_021814	TAAGC	2	10	1829998	1830007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5072	NC_021814	TTG	2	6	1830037	1830042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021814	TC	3	6	1830058	1830063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_021814	AAT	2	6	1830068	1830073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021814	AAC	2	6	1830090	1830095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021814	GTGA	2	8	1830125	1830132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021814	CGA	2	6	1830144	1830149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021814	ATA	3	9	1830198	1830206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021814	ATT	2	6	1830232	1830237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021814	TAAT	2	8	1830247	1830254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021814	ATA	2	6	1830286	1830291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021814	GAA	2	6	1830311	1830316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021814	ATT	2	6	1830343	1830348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021814	TTTA	2	8	1830392	1830399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021814	ACCT	2	8	1830405	1830412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_021814	ATA	2	6	1832067	1832072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021814	AAT	2	6	1832116	1832121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021814	TAAA	2	8	1832146	1832153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021814	GTG	2	6	1832173	1832178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021814	CTAT	2	8	1835055	1835062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_021814	GTA	2	6	1835068	1835073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021814	TAT	2	6	1835084	1835089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021814	AGG	2	6	1835176	1835181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021814	ATC	2	6	1835192	1835197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021814	CATA	2	8	1835324	1835331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_021814	ATC	2	6	1835387	1835392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021814	T	6	6	1835446	1835451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021814	CTAT	2	8	1835472	1835479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_021814	ATT	2	6	1835496	1835501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021814	ACA	2	6	1835519	1835524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_021814	TGT	2	6	1835543	1835548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021814	GAT	2	6	1835581	1835586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021814	AT	3	6	1835610	1835615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021814	GTT	2	6	1835619	1835624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021814	TAA	2	6	1835662	1835667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021814	TAA	2	6	1835681	1835686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021814	AACA	2	8	1835714	1835721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_021814	TTC	2	6	1835735	1835740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_021814	GGT	2	6	1835766	1835771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021814	A	7	7	1835879	1835885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021814	ATT	2	6	1835938	1835943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021814	GCA	2	6	1836337	1836342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_021814	CAT	2	6	1836350	1836355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_021814	AAT	2	6	1836436	1836441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021814	ATG	2	6	1836479	1836484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021814	TGGA	2	8	1836497	1836504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021814	AT	3	6	1836532	1836537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021814	GTG	2	6	1836577	1836582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021814	GCC	2	6	1836620	1836625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_021814	TTC	2	6	1836697	1836702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_021814	CTTT	2	8	1836751	1836758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_021814	T	6	6	1836756	1836761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021814	ATT	2	6	1836820	1836825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021814	ATT	2	6	1836839	1836844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021814	T	6	6	1836843	1836848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021814	ATC	2	6	1836853	1836858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_021814	TTG	2	6	1836862	1836867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021814	ATT	2	6	1836878	1836883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021814	TGTC	2	8	1836971	1836978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_021814	AAG	2	6	1837070	1837075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021814	GAT	2	6	1837082	1837087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021814	AGG	2	6	1837143	1837148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021814	ATG	2	6	1837156	1837161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021814	T	6	6	1837164	1837169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_021814	A	6	6	1837207	1837212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_021814	ATC	2	6	1837339	1837344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_021814	TAA	2	6	1837383	1837388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_021814	TGG	2	6	1837475	1837480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5142	NC_021814	GAT	2	6	1837613	1837618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5150	NC_021814	CAA	2	6	1837823	1837828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5153	NC_021814	ATC	2	6	1837983	1837988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_021814	AAT	2	6	1839355	1839360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_021814	TGT	2	6	1882150	1882155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_021814	GAAG	2	8	1882169	1882176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_021814	TTAAG	2	10	1885122	1885131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_021814	ATT	3	9	1885201	1885209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_021814	AGT	2	6	1885252	1885257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5390	NC_021814	TTG	2	6	1930039	1930044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_021814	GC	3	6	1930077	1930082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5394	NC_021814	ATT	2	6	1931065	1931070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_021814	AT	4	8	1931081	1931088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_021814	AAT	2	6	1931130	1931135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_021814	AGC	2	6	1931150	1931155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5399	NC_021814	TTA	2	6	1931805	1931810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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