MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021814	ACA	2	6	1627038	1627043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_021814	ATT	2	6	1627054	1627059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021814	TCA	2	6	1627097	1627102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_021814	TTAAA	2	10	1627111	1627120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_021814	TAT	2	6	1627156	1627161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021814	TCC	2	6	1627670	1627675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_021814	A	6	6	1627684	1627689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021814	ACA	2	6	1627715	1627720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_021814	CGG	2	6	1629435	1629440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_021814	CCT	2	6	1630416	1630421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_021814	TTA	2	6	1630422	1630427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021814	T	6	6	1630456	1630461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021814	ATT	2	6	1630528	1630533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021814	A	7	7	1630544	1630550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021814	TG	3	6	1630556	1630561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_021814	AAGG	2	8	1630636	1630643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021814	GCA	2	6	1630712	1630717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_021814	TGT	2	6	1630839	1630844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021814	GCC	2	6	1634069	1634074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_021814	CGA	2	6	1634137	1634142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_021814	AGGG	2	8	1634184	1634191	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_021814	ATA	2	6	1635568	1635573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021814	CG	3	6	1635730	1635735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_021814	TA	3	6	1635746	1635751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_021814	ACA	2	6	1637789	1637794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_021814	CCG	2	6	1637806	1637811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_021814	AAT	2	6	1637822	1637827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021814	GCC	2	6	1638442	1638447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_021814	GC	3	6	1640451	1640456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_021814	ACT	2	6	1641186	1641191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_021814	C	6	6	1641196	1641201	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4532	NC_021814	ATA	2	6	1641895	1641900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021814	AAAT	2	8	1641902	1641909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021814	TAAT	2	8	1641940	1641947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021814	TTA	2	6	1641987	1641992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021814	GA	3	6	1643741	1643746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021814	T	8	8	1643764	1643771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021814	AAAT	2	8	1644954	1644961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021814	AAT	2	6	1644974	1644979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021814	A	7	7	1644982	1644988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021814	A	6	6	1644990	1644995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021814	TTC	2	6	1645002	1645007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_021814	T	6	6	1645012	1645017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021814	ATC	2	6	1646884	1646889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_021814	TAT	2	6	1646938	1646943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021814	GCGCC	2	10	1647288	1647297	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4547	NC_021814	GCC	2	6	1647996	1648001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_021814	GCG	2	6	1648006	1648011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_021814	GGC	2	6	1648573	1648578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_021814	CTTCT	2	10	1648630	1648639	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4551	NC_021814	GGC	2	6	1648677	1648682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_021814	GAG	2	6	1648722	1648727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_021814	TAA	2	6	1648850	1648855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021814	AACC	2	8	1649029	1649036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_021814	T	6	6	1649064	1649069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021814	TCT	2	6	1649073	1649078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_021814	T	6	6	1649121	1649126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021814	TAG	2	6	1649138	1649143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021814	GAC	2	6	1649153	1649158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_021814	AGG	2	6	1649194	1649199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021814	CGC	2	6	1649421	1649426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_021814	GTG	2	6	1649430	1649435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021814	AAC	2	6	1649856	1649861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_021814	A	8	8	1649871	1649878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021814	GT	3	6	1649894	1649899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021814	CAATT	2	10	1650473	1650482	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4567	NC_021814	GAAAT	2	10	1650499	1650508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021814	AG	3	6	1652169	1652174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_021814	AGCG	2	8	1652176	1652183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_021814	CGA	2	6	1652184	1652189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_021814	GCAA	2	8	1652192	1652199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_021814	TTC	2	6	1652252	1652257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_021814	ATG	2	6	1652293	1652298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_021814	GCA	2	6	1653091	1653096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_021814	TTG	2	6	1654649	1654654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_021814	CT	3	6	1654661	1654666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_021814	CCT	2	6	1654677	1654682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_021814	A	6	6	1654705	1654710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021814	TCC	2	6	1654743	1654748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_021814	A	6	6	1654761	1654766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_021814	CAT	2	6	1654778	1654783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_021814	A	6	6	1654872	1654877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021814	AAT	2	6	1654889	1654894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021814	AGA	2	6	1654924	1654929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_021814	TAT	2	6	1659168	1659173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_021814	TTAACA	2	12	1659174	1659185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4587	NC_021814	TAA	2	6	1659186	1659191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_021814	AT	3	6	1660193	1660198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021814	AGAA	2	8	1661727	1661734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_021814	ATAA	2	8	1661745	1661752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_021814	CTA	2	6	1662147	1662152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_021814	AGCCAA	2	12	1663897	1663908	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_021814	AACA	2	8	1663977	1663984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_021814	GC	4	8	1664012	1664019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_021814	A	6	6	1664042	1664047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_021814	T	6	6	1665449	1665454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_021814	GGCA	2	8	1665479	1665486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_021814	AT	3	6	1665545	1665550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021814	AATT	2	8	1665563	1665570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021814	GTC	2	6	1665668	1665673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_021814	CGG	2	6	1665678	1665683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_021814	CGCTCC	2	12	1665848	1665859	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_021814	AG	3	6	1668573	1668578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021814	T	6	6	1674126	1674131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021814	CAC	2	6	1674142	1674147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_021814	CG	3	6	1674219	1674224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_021814	AAT	2	6	1674273	1674278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_021814	A	6	6	1674282	1674287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_021814	GT	3	6	1674321	1674326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_021814	G	6	6	1674494	1674499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_021814	AAG	2	6	1674521	1674526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021814	TGA	2	6	1674536	1674541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021814	TA	3	6	1674546	1674551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_021814	A	6	6	1674581	1674586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021814	AAGAA	2	10	1675880	1675889	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021814	TAT	2	6	1675939	1675944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021814	A	6	6	1675950	1675955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_021814	CTTT	2	8	1675982	1675989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_021814	ACA	2	6	1676022	1676027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_021814	TAA	2	6	1677150	1677155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021814	TAT	2	6	1677203	1677208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021814	T	6	6	1677830	1677835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021814	CTGT	2	8	1677870	1677877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_021814	TAAAT	2	10	1677913	1677922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021814	ATT	2	6	1677937	1677942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021814	GT	3	6	1677961	1677966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_021814	AAC	2	6	1678076	1678081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021814	AAT	2	6	1680113	1680118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_021814	CAT	2	6	1680135	1680140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_021814	AGG	2	6	1680163	1680168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_021814	A	7	7	1680198	1680204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_021814	CGC	2	6	1680207	1680212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_021814	TGG	2	6	1681211	1681216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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