MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021812	CGCAGA	2	12	76238	76249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021812	CATTTC	2	12	85626	85637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021812	ACTATA	2	12	88843	88854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021812	ACATAA	2	12	169451	169462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021812	GGGGAA	2	12	216464	216475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021812	TTAATG	2	12	219376	219387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021812	TGAAAA	2	12	233852	233863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021812	CAAAAA	2	12	302419	302430	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021812	AAGACT	2	12	428992	429003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021812	GCGAGC	2	12	444216	444227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021812	GCGCTT	2	12	529002	529013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021812	AAAATC	2	12	530629	530640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021812	TAAACC	2	12	552020	552031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021812	GTTTTT	2	12	565859	565870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021812	AAATAA	2	12	645411	645422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021812	ATAATT	2	12	648983	648994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021812	TACTCA	2	12	713684	713695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021812	TAAACG	2	12	716106	716117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021812	GCCGAT	2	12	736696	736707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021812	CGAGAT	2	12	747180	747191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021812	AAAATA	2	12	749644	749655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021812	CAGAAA	2	12	775445	775456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021812	ATCTTT	2	12	799246	799257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021812	AACTTC	2	12	806014	806025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021812	ATACGG	2	12	806294	806305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021812	CGCGGG	2	12	807051	807062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021812	CTGTTC	2	12	808299	808310	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021812	AACGCC	2	12	809194	809205	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021812	GCAAAA	2	12	836236	836247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021812	CGTCAT	2	12	878226	878237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021812	ACGATG	2	12	899856	899867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021812	GGCATA	2	12	905072	905083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021812	ATAAAA	2	12	921380	921391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021812	TTTTCA	2	12	945159	945170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021812	GTTAAT	2	12	1035885	1035896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021812	TTTTTG	2	12	1035937	1035948	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021812	TATTTT	2	12	1036129	1036140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021812	TTCCCT	2	12	1036217	1036228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021812	TAAAAA	2	12	1095568	1095579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021812	ATTTGC	2	12	1201104	1201115	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021812	ACGTTA	2	12	1220932	1220943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021812	ATTGCA	2	12	1253699	1253710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021812	TGGCGC	2	12	1299127	1299138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021812	CGCCTG	2	12	1304856	1304867	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021812	ATAGCA	2	12	1317112	1317123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021812	TTAAAT	2	12	1346698	1346709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021812	TATCAC	2	12	1367358	1367369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021812	AATGAG	2	12	1466937	1466948	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021812	TAACGC	2	12	1513727	1513738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021812	TGAGAA	2	12	1525372	1525383	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021812	TTCATC	2	12	1533359	1533370	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021812	ATTTAA	2	12	1534952	1534963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021812	ATATTG	2	12	1654618	1654629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021812	ATTTTA	2	12	1674367	1674378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021812	AACTGT	2	12	1721792	1721803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021812	TTATCC	2	12	1762714	1762725	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021812	CCTCTT	2	12	1768355	1768366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021812	AGCATT	2	12	1775545	1775556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021812	ACCACA	2	12	1821821	1821832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021812	TTAAGA	2	12	1867733	1867744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021812	GACAAT	2	12	1873354	1873365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021812	ATGGTG	2	12	1890718	1890729	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021812	TAAAAA	2	12	1896570	1896581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021812	GCGCTT	2	12	1911240	1911251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021812	TGGCGC	2	12	1914127	1914138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021812	ATTAAA	2	12	1918750	1918761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021812	ATCATT	2	12	1939408	1939419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021812	CTTTAT	2	12	1974775	1974786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021812	ATATCA	2	12	1984999	1985010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021812	GGAAAA	2	12	2049165	2049176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021812	AGCGCC	2	12	2089493	2089504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021812	ATCTCT	2	12	2111327	2111338	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021812	TAAAAA	2	12	2128570	2128581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021812	CAGAAT	2	12	2129558	2129569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021812	ATGGGG	2	12	2151168	2151179	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021812	TCATAA	2	12	2159642	2159653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021812	TGCTGA	2	12	2169372	2169383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021812	AACGCG	2	12	2212180	2212191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021812	CTTACA	2	12	2220845	2220856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021812	AAAGAC	2	12	2220948	2220959	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021812	AAGCGC	2	12	2256720	2256731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021812	TGGTTA	2	12	2283348	2283359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021812	TCAAAA	2	12	2324496	2324507	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021812	CAGAAG	2	12	2324652	2324663	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021812	ACAAAA	2	12	2368559	2368570	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021812	TAACGC	2	12	2391721	2391732	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021812	AGTAAA	2	12	2410560	2410571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021812	TTATAT	2	12	2455409	2455420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021812	ATTGAT	2	12	2467481	2467492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021812	AAAAGA	2	12	2606394	2606405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021812	TCATGT	2	12	2742416	2742427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021812	TAATGC	2	12	2754168	2754179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021812	GAACAC	2	12	2757021	2757032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021812	GTTGAT	2	12	2816331	2816342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021812	CGATCG	2	12	2859671	2859682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021812	CAGCGT	2	12	2896770	2896781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021812	CAATGA	2	12	2956643	2956654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021812	GAATGA	2	12	3024215	3024226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021812	GTGCTC	2	12	3024380	3024391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021812	GGGAAA	2	12	3047614	3047625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021812	TTTTGT	2	12	3172129	3172140	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021812	AATAAC	2	12	3224041	3224052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021812	AGGGTT	2	12	3286347	3286358	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021812	TGGTTA	2	12	3312490	3312501	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021812	ATCATT	2	12	3350794	3350805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021812	TACAAC	2	12	3356461	3356472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021812	AATGAA	2	12	3477487	3477498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021812	ACTGAA	2	12	3477518	3477529	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021812	TTTTCA	2	12	3536336	3536347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021812	CGGTGG	2	12	3553873	3553884	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021812	GATCGC	2	12	3598120	3598131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021812	CGACGC	2	12	3624182	3624193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021812	GAACAG	2	12	3651947	3651958	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021812	CATAAT	2	12	3652560	3652571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021812	ACCGAG	4	24	3669034	3669057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021812	TTTTAA	2	12	3701063	3701074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021812	TTATTG	2	12	3804182	3804193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021812	TAAGAT	2	12	3817718	3817729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021812	ATTTTT	2	12	3841923	3841934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021812	TTTAAT	2	12	3858872	3858883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021812	GCCTTT	2	12	3861332	3861343	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021812	TTTTGT	2	12	3917088	3917099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021812	CTGTAG	2	12	4006591	4006602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021812	CGCAGC	2	12	4030875	4030886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021812	GTTGAG	2	12	4043446	4043457	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021812	GTGAAT	2	12	4067954	4067965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021812	CAGCGC	2	12	4073732	4073743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021812	ATGAAA	2	12	4138732	4138743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021812	ACTTAC	2	12	4148751	4148762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021812	AAAATA	2	12	4158712	4158723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021812	TTAATG	2	12	4237211	4237222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021812	TGAAGG	2	12	4306843	4306854	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021812	ATTTGT	2	12	4314125	4314136	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021812	GAAAAT	2	12	4342257	4342268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021812	AACTGG	2	12	4342619	4342630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_021812	AATGCG	2	12	4385101	4385112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021812	GATAAA	2	12	4410602	4410613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021812	CATAAA	2	12	4440607	4440618	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_021812	TTGTTA	2	12	4448812	4448823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021812	AATAAC	2	12	4485641	4485652	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_021812	TATATG	2	12	4529825	4529836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021812	CTGATT	2	12	4530007	4530018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_021812	CGAATC	2	12	4540046	4540057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021812	GCTTTA	2	12	4650518	4650529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_021812	TACCTG	2	12	4668826	4668837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021812	TGAAGA	2	12	4713392	4713403	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021812	ACGTTG	2	12	4736802	4736813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_021812	TTAACA	2	12	4772909	4772920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_021812	AGCCAA	2	12	4777632	4777643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021812	CGCTCC	2	12	4779583	4779594	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.