MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 13265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021812	A	6	6	1022166	1022171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021812	ATG	2	6	1022228	1022233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021812	TGA	2	6	1022244	1022249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021812	TC	3	6	1023926	1023931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_021812	AAC	2	6	1025023	1025028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021812	TAA	2	6	1025041	1025046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021812	AAT	2	6	1025112	1025117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021812	GGC	2	6	1025138	1025143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_021812	AGCGC	2	10	1025193	1025202	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_021812	GCC	2	6	1025265	1025270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_021812	TGG	2	6	1025288	1025293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021812	TCGCT	2	10	1025309	1025318	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3013	NC_021812	A	6	6	1025411	1025416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021812	T	6	6	1025432	1025437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021812	TGG	2	6	1025442	1025447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021812	CGC	2	6	1025488	1025493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_021812	A	6	6	1025566	1025571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021812	T	6	6	1025587	1025592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021812	TGG	2	6	1025597	1025602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021812	CGC	2	6	1025643	1025648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_021812	A	6	6	1025721	1025726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021812	T	6	6	1025742	1025747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021812	TGG	2	6	1025752	1025757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021812	TGG	2	6	1025862	1025867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021812	TCGCC	2	10	1025889	1025898	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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3027	NC_021812	TGG	2	6	1025962	1025967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3029	NC_021812	GTG	2	6	1026165	1026170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021812	TGA	2	6	1026173	1026178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3032	NC_021812	CCT	2	6	1026199	1026204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_021812	TAC	2	6	1026244	1026249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021812	GTG	2	6	1026278	1026283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021812	TCGCC	2	10	1026301	1026310	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3036	NC_021812	TGG	2	6	1026373	1026378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021812	GTT	2	6	1026468	1026473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021812	CGG	2	6	1026490	1026495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021812	AT	3	6	1026497	1026502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021812	CAA	2	6	1026524	1026529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3042	NC_021812	A	6	6	1026581	1026586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021812	AATT	2	8	1027958	1027965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021812	ACC	2	6	1029333	1029338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_021812	AAC	2	6	1029348	1029353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_021812	A	6	6	1030576	1030581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021812	TTG	2	6	1032168	1032173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_021812	CAA	2	6	1032252	1032257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021812	CTA	2	6	1032279	1032284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021812	G	6	6	1032311	1032316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021812	AT	3	6	1032336	1032341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021812	AGG	2	6	1032369	1032374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021812	GAC	2	6	1033946	1033951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_021812	ATTT	2	8	1035605	1035612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021812	GGAA	2	8	1035640	1035647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021812	T	6	6	1035761	1035766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021812	GTTAAT	2	12	1035885	1035896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3060	NC_021812	TTTTTG	2	12	1035937	1035948	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021812	T	6	6	1036013	1036018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021812	A	6	6	1036036	1036041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021812	ATT	2	6	1036061	1036066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021812	T	6	6	1036084	1036089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021812	TTA	2	6	1036107	1036112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021812	TATTTT	2	12	1036129	1036140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021812	CAT	2	6	1036186	1036191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_021812	TTCCCT	2	12	1036217	1036228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_021812	ATC	2	6	1036245	1036250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_021812	TAA	2	6	1036278	1036283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_021812	ATT	2	6	1036363	1036368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021812	TAA	2	6	1036429	1036434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021812	ACGA	2	8	1036480	1036487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_021812	TAA	2	6	1036506	1036511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021812	TTA	2	6	1036555	1036560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_021812	GAG	2	6	1036667	1036672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021812	TGC	2	6	1036758	1036763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_021812	T	7	7	1036770	1036776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021812	TGC	2	6	1036846	1036851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_021812	TTA	2	6	1036901	1036906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021812	ATT	2	6	1036910	1036915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021812	CCA	2	6	1036924	1036929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_021812	T	7	7	1036932	1036938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021812	CAT	2	6	1036946	1036951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_021812	AAT	2	6	1036980	1036985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021812	A	6	6	1037036	1037041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021812	GC	3	6	1039202	1039207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_021812	CGG	2	6	1039233	1039238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3092	NC_021812	TTG	2	6	1043521	1043526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021812	TAA	2	6	1043575	1043580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021812	ATT	2	6	1043695	1043700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021812	GCGCT	2	10	1043752	1043761	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3096	NC_021812	TTA	2	6	1047087	1047092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021812	GAC	2	6	1047141	1047146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021812	TCCT	2	8	1047153	1047160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_021812	TGCG	2	8	1047167	1047174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_021812	GGC	2	6	1047289	1047294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021812	AAC	2	6	1047379	1047384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021812	T	7	7	1047386	1047392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021812	ATC	2	6	1047401	1047406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_021812	TAA	2	6	1047497	1047502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021812	TTA	2	6	1047547	1047552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021812	TGC	2	6	1047596	1047601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_021812	GCG	2	6	1047676	1047681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_021812	TTGA	2	8	1047706	1047713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021812	ACG	2	6	1047741	1047746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021812	T	6	6	1049151	1049156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021812	ATT	2	6	1049166	1049171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021812	CT	3	6	1049189	1049194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_021812	ATTA	2	8	1049198	1049205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021812	ATA	2	6	1051133	1051138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021812	GGT	2	6	1051239	1051244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021812	ATA	2	6	1051253	1051258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021812	GCA	2	6	1051267	1051272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_021812	AAT	2	6	1051349	1051354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021812	TCC	2	6	1053265	1053270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_021812	T	6	6	1053314	1053319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021812	TA	4	8	1054194	1054201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021812	TTA	2	6	1054254	1054259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021812	A	6	6	1054322	1054327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021812	TCA	2	6	1054340	1054345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_021812	CAT	2	6	1054356	1054361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_021812	TAT	2	6	1056161	1056166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021812	TAT	2	6	1056179	1056184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021812	GAA	2	6	1057743	1057748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021812	TTAT	2	8	1057778	1057785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021812	ATA	2	6	1061069	1061074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021812	GAT	2	6	1061235	1061240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021812	ATTT	2	8	1061247	1061254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021812	CG	3	6	1061300	1061305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_021812	ATG	2	6	1061308	1061313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021812	GTA	2	6	1062410	1062415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_021812	TGATA	2	10	1062586	1062595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_021812	ATT	2	6	1062613	1062618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_021812	T	7	7	1062626	1062632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_021812	GCAG	2	8	1062656	1062663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3140	NC_021812	T	7	7	1062717	1062723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_021812	TAA	2	6	1062745	1062750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_021812	TG	3	6	1062777	1062782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_021812	GAT	2	6	1062802	1062807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_021812	A	6	6	1063489	1063494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_021812	AATC	2	8	1063573	1063580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3149	NC_021812	ATCA	2	8	1063652	1063659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3150	NC_021812	TAA	2	6	1063668	1063673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_021812	ATA	2	6	1063815	1063820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_021812	TAT	2	6	1063821	1063826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_021812	TA	3	6	1063836	1063841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_021812	AGAAC	2	10	1063874	1063883	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3163	NC_021812	TAA	2	6	1067252	1067257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3166	NC_021812	C	6	6	1070591	1070596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3174	NC_021812	ATTT	2	8	1078749	1078756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3176	NC_021812	ATATT	2	10	1078787	1078796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3232	NC_021812	AATT	2	8	1099917	1099924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_021812	T	6	6	1099947	1099952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_021812	TTC	2	6	1106605	1106610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3255	NC_021812	ATC	2	6	1106720	1106725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_021812	ATG	2	6	1106765	1106770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_021812	CGT	2	6	1106790	1106795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3259	NC_021812	AAT	2	6	1106840	1106845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_021812	TTG	2	6	1106846	1106851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_021812	AAG	2	6	1106953	1106958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_021812	TCAT	2	8	1108998	1109005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3265	NC_021812	GTCA	2	8	1109057	1109064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3267	NC_021812	AAT	2	6	1110705	1110710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_021812	GGC	2	6	1112298	1112303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3286	NC_021812	GC	3	6	1118465	1118470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3287	NC_021812	CGCTT	2	10	1118486	1118495	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3395	NC_021812	T	6	6	1172008	1172013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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