MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 13265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021812	GAA	2	6	814731	814736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021812	TCC	2	6	815793	815798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_021812	TCA	2	6	817090	817095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_021812	A	6	6	819842	819847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021812	TTG	2	6	819855	819860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_021812	T	6	6	822226	822231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021812	GCA	2	6	822250	822255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_021812	A	6	6	822255	822260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_021812	A	6	6	822319	822324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021812	T	6	6	822340	822345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_021812	TCC	2	6	822658	822663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_021812	GATT	2	8	822697	822704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_021812	GGC	2	6	822708	822713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_021812	GCC	2	6	822718	822723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_021812	GTT	2	6	824537	824542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_021812	TAC	2	6	824577	824582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_021812	CGC	2	6	825317	825322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_021812	AAT	2	6	825396	825401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_021812	TAT	2	6	826235	826240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021812	A	6	6	826241	826246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_021812	ATC	2	6	826267	826272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_021812	A	6	6	827656	827661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021812	A	6	6	827698	827703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021812	CAC	2	6	828808	828813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_021812	CCTG	2	8	828826	828833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_021812	CGC	2	6	828891	828896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_021812	GAG	2	6	828914	828919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_021812	CA	3	6	828936	828941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_021812	CCG	2	6	829734	829739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_021812	GC	3	6	829784	829789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_021812	TATT	2	8	831651	831658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021812	A	6	6	831673	831678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021812	TAA	2	6	831681	831686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_021812	GTT	2	6	831702	831707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021812	ATTAA	2	10	831711	831720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_021812	TTG	2	6	831744	831749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021812	ATTA	2	8	831760	831767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_021812	GCA	2	6	831773	831778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_021812	GGA	2	6	831779	831784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_021812	A	6	6	831791	831796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_021812	ATTT	2	8	831822	831829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_021812	TTA	2	6	831830	831835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_021812	TCG	2	6	831950	831955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_021812	TAA	2	6	831962	831967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021812	AG	4	8	831968	831975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_021812	TAAA	2	8	832863	832870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_021812	A	6	6	832868	832873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_021812	AAG	2	6	832881	832886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_021812	A	6	6	835216	835221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_021812	ATT	2	6	836226	836231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_021812	GCAAAA	2	12	836236	836247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2552	NC_021812	T	6	6	836266	836271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_021812	GGCA	2	8	836373	836380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2554	NC_021812	ATT	2	6	836416	836421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_021812	CA	3	6	836433	836438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_021812	A	6	6	836459	836464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_021812	T	6	6	836696	836701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_021812	ACCCC	2	10	837670	837679	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2559	NC_021812	CTG	3	9	837743	837751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_021812	TGC	2	6	837773	837778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_021812	AG	3	6	839369	839374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021812	ATTTT	2	10	839410	839419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021812	ATT	2	6	839449	839454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021812	CAT	2	6	840701	840706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_021812	GATTT	2	10	840769	840778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021812	AT	3	6	840796	840801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_021812	TCT	2	6	840901	840906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_021812	CCCCG	2	10	840928	840937	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2569	NC_021812	TGG	2	6	840957	840962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_021812	CTG	2	6	844964	844969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_021812	A	7	7	844978	844984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_021812	TA	3	6	845008	845013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_021812	AT	4	8	845038	845045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_021812	ATT	2	6	845117	845122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_021812	A	7	7	845143	845149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_021812	TGA	2	6	846548	846553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2582	NC_021812	TCA	3	9	846676	846684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_021812	CAT	2	6	846703	846708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_021812	AGA	2	6	848784	848789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_021812	TTG	2	6	848802	848807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2588	NC_021812	CCTG	2	8	853590	853597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_021812	GC	3	6	853665	853670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_021812	CATG	2	8	853783	853790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_021812	GCA	2	6	853796	853801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_021812	CATA	2	8	853802	853809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2593	NC_021812	T	6	6	853816	853821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_021812	TTAA	2	8	853951	853958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_021812	TGA	2	6	853965	853970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2600	NC_021812	CAA	2	6	854085	854090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_021812	A	6	6	855097	855102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_021812	CGT	2	6	855130	855135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_021812	CCTG	2	8	855147	855154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_021812	TAT	2	6	858677	858682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021812	T	6	6	859438	859443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_021812	TGC	2	6	859460	859465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_021812	GTA	2	6	859571	859576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_021812	GT	3	6	859608	859613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_021812	AAG	2	6	859676	859681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_021812	GGC	2	6	859975	859980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_021812	T	6	6	860007	860012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021812	TGA	2	6	860026	860031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_021812	GAG	2	6	861052	861057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_021812	TAG	2	6	862723	862728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_021812	C	7	7	862739	862745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2616	NC_021812	GCA	2	6	862756	862761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2618	NC_021812	C	7	7	862843	862849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2619	NC_021812	G	6	6	862922	862927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_021812	TGA	2	6	863378	863383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_021812	GTTT	2	8	863387	863394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_021812	TC	3	6	863489	863494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_021812	GTA	2	6	863496	863501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_021812	A	6	6	863501	863506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_021812	TCTG	2	8	863519	863526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2626	NC_021812	TGC	2	6	863528	863533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_021812	AAC	2	6	863885	863890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_021812	TAA	2	6	863938	863943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_021812	TA	3	6	863964	863969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_021812	ATT	2	6	863970	863975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_021812	T	7	7	864215	864221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_021812	T	7	7	864272	864278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_021812	GAT	2	6	864302	864307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_021812	TAT	2	6	864365	864370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_021812	TAAA	2	8	864377	864384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_021812	TCC	2	6	864387	864392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2638	NC_021812	TTG	2	6	864967	864972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2916	NC_021812	A	9	9	981247	981255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2943	NC_021812	CA	3	6	999880	999885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2952	NC_021812	T	7	7	1003422	1003428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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