MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 13265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021812	TAA	2	6	165338	165343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021812	AACA	2	8	165371	165378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021812	TTC	2	6	165392	165397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021812	A	7	7	165536	165542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021812	ATT	2	6	165595	165600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021812	GCA	2	6	165994	165999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021812	CAT	2	6	166007	166012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021812	TCC	2	6	167313	167318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_021812	TTA	2	6	167324	167329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021812	TAAT	2	8	167346	167353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021812	CTT	2	6	167407	167412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021812	TCG	2	6	167423	167428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_021812	ATAC	2	8	167437	167444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_021812	AT	3	6	167472	167477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021812	CAA	2	6	167481	167486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021812	ATT	2	6	167527	167532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021812	A	6	6	167562	167567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021812	ATC	2	6	167641	167646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021812	TAT	2	6	167651	167656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021812	AATG	2	8	167733	167740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021812	ATT	2	6	167749	167754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021812	TTAT	2	8	168742	168749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021812	GATT	2	8	168879	168886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021812	TGA	3	9	168894	168902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021812	AAC	2	6	168939	168944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021812	ATT	2	6	168983	168988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021812	GATT	2	8	168995	169002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021812	AAT	2	6	169013	169018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021812	T	6	6	169066	169071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021812	CGG	2	6	169127	169132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021812	TCATA	2	10	169176	169185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_021812	ACC	2	6	169199	169204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_021812	TAAA	2	8	169212	169219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021812	AGAA	2	8	169309	169316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021812	TG	3	6	169432	169437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021812	ACATAA	2	12	169451	169462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
537	NC_021812	C	6	6	169478	169483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
538	NC_021812	GAAT	2	8	170975	170982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021812	AG	3	6	171082	171087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021812	GTT	2	6	173747	173752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021812	ATT	2	6	173779	173784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021812	TTTTA	2	10	173813	173822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021812	TGA	2	6	173824	173829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021812	TTC	2	6	173943	173948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021812	AAGG	2	8	175388	175395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021812	GAA	2	6	176923	176928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021812	TGC	2	6	176929	176934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021812	TCGG	2	8	176953	176960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021812	CAA	2	6	177009	177014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021812	ATT	2	6	177019	177024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021812	TGC	2	6	177069	177074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021812	A	6	6	177077	177082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021812	TCCT	2	8	178906	178913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_021812	AAT	2	6	179559	179564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021812	TAT	2	6	180790	180795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021812	TG	3	6	180810	180815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021812	AGA	2	6	183230	183235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021812	CT	3	6	183243	183248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_021812	GTG	2	6	186831	186836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021812	A	6	6	186929	186934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021812	CAA	2	6	187014	187019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021812	GAA	2	6	187021	187026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021812	AAC	2	6	188605	188610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021812	T	7	7	190293	190299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021812	GCGCT	2	10	190305	190314	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
566	NC_021812	TAT	2	6	190368	190373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021812	CAT	2	6	190382	190387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_021812	GCG	2	6	191085	191090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021812	GTCA	2	8	192337	192344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_021812	G	6	6	192394	192399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021812	GCC	2	6	192982	192987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_021812	GCT	2	6	192993	192998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021812	AAGA	2	8	193006	193013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021812	GCC	2	6	195217	195222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_021812	CGT	2	6	195232	195237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021812	ATG	2	6	195244	195249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021812	AAT	2	6	195252	195257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021812	TTA	2	6	195267	195272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021812	AT	3	6	195333	195338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021812	CAT	2	6	195395	195400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021812	GGT	2	6	196482	196487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021812	ATT	2	6	196569	196574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021812	CCT	2	6	196618	196623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_021812	CAT	3	9	196681	196689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021812	ATTA	2	8	196705	196712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021812	TAT	2	6	196720	196725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021812	AAG	2	6	196773	196778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021812	TAT	2	6	196791	196796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021812	AAC	2	6	196803	196808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_021812	TGT	2	6	196900	196905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021812	GAG	2	6	196961	196966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021812	CCG	2	6	197374	197379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_021812	AAT	2	6	197401	197406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021812	CAG	2	6	197416	197421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021812	TA	3	6	197538	197543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021812	ACA	2	6	197590	197595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021812	TAC	2	6	197600	197605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021812	ACTC	2	8	197678	197685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_021812	GCC	2	6	197690	197695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_021812	ATT	2	6	197710	197715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021812	GGC	2	6	197730	197735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021812	G	6	6	197793	197798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021812	ATG	2	6	197800	197805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021812	TTG	2	6	198676	198681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021812	AAC	2	6	198745	198750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021812	AGC	2	6	198778	198783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021812	GC	3	6	200289	200294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_021812	GCG	2	6	200312	200317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021812	A	6	6	201815	201820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021812	CGG	2	6	201832	201837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021812	GCA	2	6	201864	201869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021812	TCA	2	6	201999	202004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021812	AAT	2	6	202043	202048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021812	TG	3	6	202121	202126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021812	GC	3	6	202147	202152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_021812	T	6	6	202154	202159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021812	GTT	2	6	208850	208855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021812	CTT	2	6	208866	208871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021812	GCAA	2	8	208899	208906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_021812	CGG	2	6	208908	208913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021812	GGC	3	9	208988	208996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021812	GGC	2	6	210323	210328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021812	GAAA	2	8	210373	210380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021812	TAT	2	6	210449	210454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021812	GAG	2	6	210475	210480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021812	A	6	6	211527	211532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021812	GGC	2	6	211534	211539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021812	TCA	2	6	211592	211597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021812	TTG	2	6	211707	211712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021812	TATT	2	8	211751	211758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021812	T	6	6	211782	211787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021812	CTT	2	6	211805	211810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021812	TGT	2	6	211827	211832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021812	GAAG	2	8	211846	211853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021812	TTAAG	2	10	214799	214808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021812	ATAA	2	8	214868	214875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021812	ATT	3	9	214878	214886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021812	TAA	2	6	214896	214901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021812	AGT	2	6	214929	214934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021812	AGC	2	6	214939	214944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_021812	GTC	2	6	214968	214973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_021812	CCG	2	6	216102	216107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_021812	TGA	2	6	216114	216119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_021812	ATT	2	6	216160	216165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_021812	GGC	2	6	216424	216429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_021812	CCG	2	6	218092	218097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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649	NC_021812	GCG	2	6	218191	218196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_021812	AGC	2	6	218335	218340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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655	NC_021812	TTGA	2	8	218409	218416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
656	NC_021812	GA	3	6	218431	218436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_021812	T	6	6	220244	220249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_021812	GAA	2	6	221191	221196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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670	NC_021812	GCGCG	2	10	229541	229550	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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674	NC_021812	AGCC	2	8	232312	232319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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682	NC_021812	GTA	2	6	233697	233702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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769	NC_021812	TTAA	2	8	258844	258851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_021812	CCG	2	6	260176	260181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
779	NC_021812	AAT	2	6	260227	260232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
780	NC_021812	T	6	6	260262	260267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
781	NC_021812	CAGCG	3	15	260277	260291	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
782	NC_021812	CGT	2	6	260305	260310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_021812	TTA	2	6	260326	260331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
785	NC_021812	GCC	2	6	260597	260602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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787	NC_021812	CG	3	6	261099	261104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
788	NC_021812	TCA	2	6	261113	261118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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792	NC_021812	CTG	2	6	261252	261257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_021812	AT	3	6	261318	261323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
794	NC_021812	TTG	2	6	261428	261433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
795	NC_021812	ATA	2	6	261434	261439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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797	NC_021812	AAT	2	6	261493	261498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_021812	AAT	2	6	262526	262531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
803	NC_021812	AGC	2	6	262546	262551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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807	NC_021812	TCA	2	6	263232	263237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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810	NC_021812	TTTTA	2	10	264376	264385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
811	NC_021812	TA	3	6	265504	265509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
812	NC_021812	TGT	2	6	265565	265570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
813	NC_021812	CTTTT	2	10	265646	265655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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