MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 12852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021810	AGT	2	6	509749	509754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021810	AGC	2	6	509815	509820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021810	GCT	2	6	509823	509828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021810	GCC	2	6	509863	509868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_021810	CA	3	6	510017	510022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_021810	T	6	6	510299	510304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021810	ATG	2	6	510366	510371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021810	GCA	2	6	513117	513122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_021810	TCCC	2	8	514707	514714	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1510	NC_021810	TAA	2	6	514794	514799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021810	TTTTA	2	10	516343	516352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021810	TTTA	2	8	519083	519090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021810	ATTT	2	8	519101	519108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021810	ATT	2	6	520701	520706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021810	AGG	2	6	520724	520729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021810	A	7	7	520734	520740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021810	CCG	2	6	520742	520747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_021810	T	7	7	520755	520761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021810	TAC	2	6	520766	520771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021810	CT	3	6	522195	522200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_021810	TTTC	2	8	522835	522842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_021810	CTA	2	6	523640	523645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021810	GTAC	2	8	523654	523661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_021810	TGGC	2	8	523721	523728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_021810	A	6	6	523771	523776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021810	TAC	2	6	528600	528605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021810	ACT	3	9	529330	529338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021810	A	7	7	529361	529367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021810	A	6	6	529418	529423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021810	TCC	2	6	531396	531401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_021810	CTC	2	6	532530	532535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_021810	ATT	2	6	534444	534449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021810	CTC	2	6	534469	534474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_021810	TCTTT	2	10	534709	534718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_021810	CGT	2	6	534746	534751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021810	CT	3	6	535770	535775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_021810	A	8	8	535804	535811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021810	GA	3	6	537420	537425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021810	AGTTA	2	10	539601	539610	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021810	GTT	2	6	540149	540154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021810	AGTTT	2	10	540181	540190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021810	CTTA	2	8	540214	540221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_021810	TAA	2	6	540647	540652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021810	CA	3	6	540661	540666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_021810	A	8	8	542494	542501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021810	ATT	2	6	542546	542551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021810	GAT	2	6	542558	542563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021810	CAAAT	2	10	542691	542700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_021810	AT	3	6	542712	542717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021810	A	7	7	542729	542735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021810	CCG	2	6	542736	542741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_021810	GCG	2	6	542751	542756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021810	AAG	2	6	543632	543637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021810	TAT	2	6	543683	543688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021810	CTT	2	6	543691	543696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021810	CCG	2	6	543774	543779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_021810	ACA	2	6	543786	543791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_021810	A	8	8	544029	544036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021810	T	6	6	544052	544057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021810	GAT	2	6	544064	544069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021810	ATA	2	6	544084	544089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021810	GGC	2	6	544115	544120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021810	GAC	2	6	544201	544206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021810	GAA	2	6	544821	544826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021810	A	7	7	544876	544882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021810	GTT	2	6	547478	547483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021810	TTC	2	6	547502	547507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_021810	CCG	2	6	547560	547565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_021810	GA	3	6	547578	547583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021810	GGC	2	6	547604	547609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021810	GTT	3	9	547629	547637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021810	GCG	2	6	547661	547666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_021810	GC	3	6	549726	549731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_021810	CAA	2	6	549753	549758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_021810	GC	4	8	550426	550433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_021810	CT	3	6	550447	550452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_021810	GAC	2	6	550483	550488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_021810	ATT	2	6	551834	551839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021810	CGC	2	6	552808	552813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_021810	ACA	2	6	553281	553286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_021810	TTTG	2	8	554210	554217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021810	ACC	2	6	557577	557582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_021810	A	6	6	557629	557634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021810	GGC	2	6	558220	558225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021810	AGC	2	6	559051	559056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_021810	GGC	2	6	559092	559097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_021810	AG	3	6	559705	559710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021810	GCCAG	2	10	559753	559762	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1589	NC_021810	ACG	2	6	559804	559809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_021810	ATG	2	6	559830	559835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021810	A	6	6	559852	559857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021810	TAA	2	6	559879	559884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021810	C	6	6	561191	561196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1594	NC_021810	TA	3	6	561325	561330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021810	ATA	2	6	561386	561391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021810	T	6	6	564307	564312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021810	T	8	8	564316	564323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021810	CGG	2	6	564363	564368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_021810	CAA	2	6	564377	564382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_021810	GCTG	2	8	564410	564417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_021810	CAA	2	6	564498	564503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_021810	ACT	2	6	566777	566782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021810	ATT	2	6	566794	566799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021810	TAA	2	6	566857	566862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021810	ATTC	2	8	566903	566910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_021810	ATA	2	6	566913	566918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021810	TGACC	2	10	566943	566952	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1608	NC_021810	ATAAA	2	10	566966	566975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021810	TCT	2	6	566993	566998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021810	TCA	2	6	567006	567011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021810	CT	3	6	567024	567029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_021810	ATTA	2	8	567056	567063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021810	TA	3	6	572913	572918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021810	TTA	3	9	572936	572944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021810	TAA	2	6	573010	573015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021810	TATT	2	8	573048	573055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021810	CCA	2	6	573056	573061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_021810	CAA	2	6	573078	573083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021810	A	7	7	573286	573292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021810	T	7	7	573308	573314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021810	GCAA	2	8	573395	573402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_021810	ACTA	2	8	576693	576700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_021810	TTG	2	6	578238	578243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021810	TAC	2	6	579919	579924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_021810	GCA	2	6	579969	579974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021810	TTG	2	6	580074	580079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021810	AAC	2	6	580115	580120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021810	ATC	2	6	580210	580215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_021810	AGGCA	2	10	580233	580242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1630	NC_021810	T	6	6	580360	580365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021810	TAC	2	6	583759	583764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_021810	CG	3	6	583765	583770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_021810	A	6	6	586370	586375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021810	T	6	6	586390	586395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021810	CGC	2	6	586453	586458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_021810	TTTA	2	8	587100	587107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_021810	AATT	2	8	587128	587135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_021810	CGA	2	6	717146	717151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_021810	TTA	2	6	717342	717347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_021810	AAT	2	6	717403	717408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_021810	ATG	2	6	718370	718375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1923	NC_021810	CGG	2	6	719507	719512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1957	NC_021810	GCC	2	6	747014	747019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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