MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 12852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021810	T	12	12	338109	338120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021810	A	6	6	339222	339227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021810	CCCT	2	8	340800	340807	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1004	NC_021810	ACG	2	6	340832	340837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021810	TG	3	6	340897	340902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021810	TGCT	2	8	340907	340914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_021810	ATG	2	6	341791	341796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021810	CG	3	6	341839	341844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_021810	CAT	2	6	341887	341892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021810	CATT	2	8	341907	341914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_021810	GCC	2	6	341977	341982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_021810	GTC	2	6	342023	342028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021810	CAG	2	6	342032	342037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021810	TCAC	2	8	342125	342132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_021810	TAA	2	6	342164	342169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021810	TTA	2	6	342191	342196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021810	ACTC	2	8	342636	342643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_021810	TCTTT	2	10	343663	343672	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_021810	TGG	2	6	343701	343706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021810	T	6	6	343750	343755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021810	A	6	6	343757	343762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021810	TC	3	6	343810	343815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_021810	ATG	2	6	343827	343832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021810	AGC	3	9	343862	343870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021810	A	6	6	344308	344313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021810	GA	4	8	344349	344356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021810	TCC	2	6	345354	345359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_021810	TTA	2	6	345368	345373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021810	ATT	2	6	345453	345458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021810	GGC	2	6	345835	345840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021810	GCG	2	6	345841	345846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021810	CG	3	6	345862	345867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_021810	AG	3	6	346857	346862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021810	TAA	2	6	346865	346870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021810	GGC	2	6	347776	347781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021810	AGCGC	2	10	347821	347830	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1037	NC_021810	AAC	3	9	349183	349191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021810	GTAG	2	8	350558	350565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021810	T	8	8	350569	350576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021810	GCA	2	6	350589	350594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021810	TAA	2	6	350633	350638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021810	TGT	2	6	350734	350739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021810	CAA	2	6	350765	350770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021810	A	6	6	350769	350774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021810	TCT	2	6	350810	350815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021810	TC	3	6	354593	354598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_021810	ATCCT	2	10	357224	357233	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1048	NC_021810	TAAA	3	12	359384	359395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021810	TAT	2	6	359399	359404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021810	TCAA	2	8	359446	359453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_021810	A	6	6	359452	359457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021810	AT	3	6	359474	359479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021810	TCAA	2	8	359538	359545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_021810	T	7	7	359652	359658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021810	TTTG	2	8	359665	359672	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021810	TAA	2	6	359685	359690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021810	ACA	2	6	359730	359735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021810	AAT	2	6	359736	359741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021810	GAAA	2	8	359782	359789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021810	TCA	2	6	359845	359850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021810	AAT	2	6	359859	359864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021810	CAC	2	6	359872	359877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_021810	AATT	2	8	359885	359892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021810	TCT	2	6	359913	359918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021810	CTTT	2	8	360012	360019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_021810	CGT	2	6	360029	360034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021810	TCAT	2	8	360041	360048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_021810	GCC	2	6	360052	360057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_021810	CTTT	2	8	360244	360251	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_021810	CGT	2	6	360261	360266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021810	TCAT	2	8	360273	360280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_021810	GCC	2	6	360284	360289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021810	CCG	2	6	360306	360311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_021810	TCAT	2	8	360369	360376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_021810	AGC	2	6	360404	360409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_021810	CGG	2	6	360559	360564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021810	CT	3	6	360569	360574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_021810	C	7	7	360595	360601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1080	NC_021810	TCC	2	6	360641	360646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_021810	GAC	3	9	360669	360677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021810	GCG	2	6	360681	360686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021810	GC	3	6	360705	360710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_021810	CG	3	6	360724	360729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_021810	TC	3	6	362875	362880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_021810	GCC	2	6	363708	363713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_021810	TAT	3	9	363838	363846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021810	ATT	2	6	363946	363951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021810	CA	3	6	363997	364002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_021810	A	6	6	364026	364031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021810	TAACCA	2	12	364136	364147	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021810	ATC	2	6	364168	364173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021810	CAGT	2	8	365769	365776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_021810	T	6	6	365843	365848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021810	T	7	7	365890	365896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021810	A	7	7	365959	365965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021810	AAAC	2	8	365997	366004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_021810	GGA	2	6	366015	366020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021810	ATT	2	6	366933	366938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021810	ATA	2	6	368759	368764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021810	ATCA	2	8	372507	372514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_021810	GTC	2	6	373436	373441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021810	A	7	7	373473	373479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021810	ATC	2	6	377141	377146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021810	CAT	2	6	377869	377874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021810	CCA	2	6	377900	377905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_021810	GGA	2	6	377910	377915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021810	GGC	2	6	380283	380288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021810	CAA	2	6	380295	380300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021810	ATT	2	6	380322	380327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021810	GCA	2	6	380372	380377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021810	GAG	2	6	381438	381443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021810	GGC	2	6	382331	382336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021810	AGCGC	2	10	382384	382393	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1115	NC_021810	AAC	2	6	382440	382445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021810	CT	4	8	384849	384856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_021810	TC	3	6	384879	384884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_021810	A	7	7	384925	384931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021810	TTTAC	2	10	384962	384971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_021810	GTA	2	6	386888	386893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021810	GGC	2	6	386913	386918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021810	TCA	2	6	386932	386937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021810	AAC	3	9	386999	387007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021810	TGAA	2	8	387974	387981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021810	CAA	2	6	388002	388007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021810	CCAG	2	8	388013	388020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_021810	ATA	2	6	390197	390202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021810	ATA	2	6	390224	390229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021810	CGT	2	6	390235	390240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021810	TCT	2	6	390251	390256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021810	AACCCT	2	12	390279	390290	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_021810	CG	3	6	390316	390321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_021810	TCAT	2	8	390340	390347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_021810	CAA	2	6	390350	390355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021810	TGC	2	6	390376	390381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021810	CTG	2	6	390385	390390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021810	A	6	6	390392	390397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_021810	CTG	2	6	397440	397445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_021810	AAAT	2	8	451169	451176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_021810	TCGG	2	8	451395	451402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1271	NC_021810	ATA	2	6	451418	451423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_021810	GCGCT	2	10	451439	451448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1405	NC_021810	TATT	2	8	503905	503912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_021810	ATT	2	6	504017	504022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_021810	GGCG	2	8	504393	504400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_021810	TGC	2	6	504425	504430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_021810	CGG	2	6	504451	504456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_021810	TCC	2	6	504462	504467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1415	NC_021810	ACAAAA	2	12	504497	504508	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1416	NC_021810	ACC	2	6	504640	504645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1417	NC_021810	GCC	2	6	504654	504659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1418	NC_021810	GTG	2	6	504701	504706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_021810	ACC	2	6	504885	504890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1420	NC_021810	GCC	2	6	504899	504904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1421	NC_021810	TGC	2	6	504944	504949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_021810	AGTC	2	8	504967	504974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1423	NC_021810	TCCT	2	8	504991	504998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1424	NC_021810	GCC	2	6	505010	505015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1425	NC_021810	CTG	2	6	505059	505064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_021810	TCT	2	6	505072	505077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1427	NC_021810	AC	3	6	505160	505165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1428	NC_021810	CGT	3	9	505178	505186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_021810	AGC	2	6	505359	505364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_021810	C	6	6	505364	505369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1431	NC_021810	ACG	2	6	505413	505418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_021810	TGA	2	6	505493	505498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_021810	CCG	2	6	505521	505526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1434	NC_021810	ACC	2	6	505608	505613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1435	NC_021810	CCT	2	6	505690	505695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1436	NC_021810	CTC	2	6	505727	505732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1437	NC_021810	AGG	2	6	505744	505749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_021810	CCA	2	6	505771	505776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_021810	GGT	2	6	505831	505836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_021810	CAT	2	6	506026	506031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_021810	GCC	2	6	506101	506106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_021810	TAA	2	6	506226	506231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_021810	CAGC	2	8	506239	506246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1444	NC_021810	GACT	2	8	506257	506264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_021810	TC	3	6	506355	506360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1446	NC_021810	ACC	2	6	506385	506390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1447	NC_021810	TTG	2	6	506457	506462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_021810	TCA	2	6	506484	506489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_021810	C	6	6	506585	506590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1451	NC_021810	AC	3	6	506790	506795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1452	NC_021810	CAA	2	6	506826	506831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_021810	CA	3	6	506832	506837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1454	NC_021810	CTTT	2	8	506919	506926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1455	NC_021810	ATG	2	6	506929	506934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_021810	GTT	2	6	507025	507030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_021810	ACG	2	6	507040	507045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1460	NC_021810	TCGGT	2	10	507271	507280	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1462	NC_021810	GTCA	2	8	507566	507573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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