MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 12852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021810	GCC	2	6	154078	154083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_021810	AAAT	2	8	154849	154856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021810	AAATT	2	10	154862	154871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021810	GAAT	2	8	155357	155364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021810	TAAA	2	8	155375	155382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021810	CGG	2	6	156855	156860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021810	A	6	6	157790	157795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021810	TAA	2	6	157809	157814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021810	TTAT	2	8	157824	157831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021810	TAA	2	6	157858	157863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021810	TGA	2	6	157866	157871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021810	GA	3	6	157925	157930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021810	TGT	2	6	157961	157966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021810	ATG	2	6	157993	157998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021810	A	6	6	158020	158025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021810	TAATT	2	10	158030	158039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021810	AT	3	6	158099	158104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021810	TTA	2	6	158172	158177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021810	A	6	6	161667	161672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021810	AAC	2	6	162802	162807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021810	ACC	2	6	162895	162900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_021810	A	6	6	162954	162959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021810	A	6	6	162980	162985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021810	A	6	6	163063	163068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021810	ATT	2	6	163138	163143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021810	C	6	6	163158	163163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
527	NC_021810	GGC	2	6	164521	164526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021810	T	6	6	167067	167072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021810	TCA	2	6	167662	167667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021810	GGA	2	6	167671	167676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021810	CAG	2	6	167804	167809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021810	GAC	2	6	168308	168313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021810	GCG	2	6	168352	168357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_021810	CT	3	6	168412	168417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021810	CCG	2	6	168435	168440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_021810	T	6	6	169018	169023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021810	GAGG	2	8	169048	169055	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021810	CCTC	2	8	169060	169067	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
539	NC_021810	GAT	2	6	169100	169105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021810	CAG	2	6	169115	169120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021810	ATG	2	6	169122	169127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021810	TCA	2	6	169135	169140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021810	CCTTT	2	10	169146	169155	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
544	NC_021810	ACA	2	6	169235	169240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021810	T	7	7	170619	170625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021810	TGT	2	6	170635	170640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021810	GT	3	6	170639	170644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021810	A	8	8	170672	170679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021810	CGT	2	6	170710	170715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021810	T	6	6	170837	170842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021810	A	7	7	171655	171661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021810	ACA	2	6	171677	171682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021810	CT	3	6	172578	172583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_021810	GGC	2	6	172597	172602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021810	CTT	2	6	172647	172652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021810	TCA	2	6	172659	172664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021810	GGC	2	6	172682	172687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021810	A	6	6	172688	172693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021810	T	6	6	172711	172716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021810	GGC	2	6	172720	172725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021810	TAA	2	6	172775	172780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021810	A	6	6	172786	172791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021810	TC	3	6	173591	173596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_021810	TGT	2	6	173662	173667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021810	ATT	2	6	174368	174373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021810	TAA	2	6	174399	174404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021810	GGC	2	6	174436	174441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_021810	GGCA	2	8	174496	174503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
569	NC_021810	GGA	2	6	174509	174514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021810	CAT	2	6	175479	175484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021810	A	6	6	175488	175493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021810	CTAA	2	8	175528	175535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_021810	CGC	2	6	175536	175541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_021810	A	7	7	175559	175565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021810	CAG	2	6	175593	175598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021810	TCG	2	6	176701	176706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021810	A	6	6	176716	176721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021810	GCC	2	6	176727	176732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_021810	ATG	2	6	177964	177969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021810	TCG	2	6	179074	179079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021810	TTAA	2	8	179132	179139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021810	GAA	2	6	179198	179203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021810	TCG	2	6	179298	179303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021810	GCC	2	6	179337	179342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_021810	TAT	2	6	179351	179356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021810	GAC	2	6	179819	179824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021810	GAC	2	6	184524	184529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_021810	CAA	2	6	184561	184566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_021810	CG	3	6	184579	184584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_021810	TGT	2	6	184640	184645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021810	TGCC	2	8	184660	184667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_021810	ATA	2	6	184726	184731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021810	GGC	2	6	185532	185537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021810	ATCA	2	8	185564	185571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_021810	AAC	2	6	185607	185612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021810	CTT	2	6	186545	186550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021810	A	7	7	186560	186566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021810	CGT	2	6	186575	186580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021810	CGA	2	6	186587	186592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021810	ATT	2	6	186642	186647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021810	A	7	7	186684	186690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021810	TA	3	6	186691	186696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021810	ATT	2	6	187665	187670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021810	ATTC	2	8	187822	187829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_021810	CTTT	2	8	187881	187888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_021810	AAT	2	6	188397	188402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021810	TGTTT	2	10	191949	191958	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021810	CTAA	2	8	192037	192044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_021810	ATTT	2	8	192064	192071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021810	ACC	2	6	192163	192168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_021810	AAT	2	6	192261	192266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021810	CAAAC	2	10	192281	192290	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
613	NC_021810	TAT	2	6	192326	192331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021810	ATC	2	6	192372	192377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021810	GCT	2	6	192384	192389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021810	GCC	2	6	192407	192412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_021810	A	6	6	192455	192460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021810	ATA	2	6	192544	192549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021810	ACG	2	6	192570	192575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021810	CGG	2	6	192620	192625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021810	AGGG	2	8	192628	192635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021810	GAT	2	6	192650	192655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021810	GGC	2	6	192852	192857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021810	CGA	2	6	192866	192871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021810	GCTC	2	8	192890	192897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_021810	CGAT	2	8	192968	192975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_021810	CT	3	6	193091	193096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_021810	GGC	2	6	193111	193116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021810	AG	3	6	193999	194004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021810	TTTC	2	8	194011	194018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_021810	CA	3	6	194042	194047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_021810	CCA	2	6	194056	194061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_021810	ATT	2	6	194868	194873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021810	AAT	2	6	194958	194963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021810	GC	3	6	197298	197303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_021810	CAG	2	6	197325	197330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021810	GCC	2	6	197366	197371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_021810	GAA	2	6	197430	197435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021810	CGT	2	6	197438	197443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021810	ATCC	2	8	197631	197638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_021810	TCT	2	6	197694	197699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_021810	CTAA	2	8	197729	197736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
643	NC_021810	TCAG	2	8	198938	198945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
644	NC_021810	CTG	2	6	198979	198984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_021810	TTCAGT	2	12	199109	199120	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
648	NC_021810	CAT	2	6	199121	199126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_021810	ATT	2	6	199253	199258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_021810	TAT	2	6	199264	199269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_021810	AAT	2	6	199284	199289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_021810	TAG	2	6	199302	199307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_021810	CAG	2	6	205163	205168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_021810	TCC	2	6	205988	205993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
663	NC_021810	C	8	8	205992	205999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
664	NC_021810	CGC	2	6	206002	206007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
665	NC_021810	GCC	2	6	210396	210401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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671	NC_021810	AG	3	6	212693	212698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
672	NC_021810	T	6	6	212701	212706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_021810	A	6	6	212730	212735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_021810	CTG	2	6	214613	214618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_021810	ATG	2	6	247935	247940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_021810	AAT	2	6	248296	248301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_021810	GTC	2	6	251394	251399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_021810	TGA	2	6	251418	251423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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914	NC_021810	T	6	6	308012	308017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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918	NC_021810	TAA	2	6	308184	308189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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926	NC_021810	GC	3	6	309880	309885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
927	NC_021810	ATA	2	6	309887	309892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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930	NC_021810	TCA	2	6	312835	312840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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932	NC_021810	GAT	2	6	314316	314321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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938	NC_021810	ATT	2	6	317335	317340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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942	NC_021810	CCG	2	6	318520	318525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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947	NC_021810	CGT	2	6	318618	318623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_021810	AGC	3	9	319822	319830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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955	NC_021810	GGC	2	6	320259	320264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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960	NC_021810	CGC	3	9	324128	324136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
961	NC_021810	GGC	2	6	324139	324144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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968	NC_021810	CAA	2	6	325944	325949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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981	NC_021810	ATG	2	6	328520	328525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
982	NC_021810	CTAC	2	8	328599	328606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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