MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 12852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021810	CGG	3	9	2264786	2264794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021810	CTT	2	6	2264807	2264812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_021810	TA	3	6	2264814	2264819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_021810	GTT	2	6	2264873	2264878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021810	ATT	2	6	2264923	2264928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021810	TGTTT	2	10	2264972	2264981	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021810	T	7	7	2264979	2264985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_021810	TTA	2	6	2265038	2265043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021810	AAT	2	6	2265085	2265090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021810	CGC	2	6	2265109	2265114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_021810	CTT	2	6	2265121	2265126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_021810	GAG	2	6	2265187	2265192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021810	TC	3	6	2268154	2268159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_021810	ATT	2	6	2268214	2268219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021810	CGA	2	6	2268894	2268899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_021810	GGT	2	6	2270084	2270089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_021810	TAC	2	6	2270102	2270107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_021810	CGG	2	6	2270109	2270114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_021810	A	6	6	2270137	2270142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021810	A	6	6	2270150	2270155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021810	CGG	2	6	2270161	2270166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_021810	CTG	2	6	2270235	2270240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_021810	TCG	2	6	2270251	2270256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_021810	GCC	2	6	2270354	2270359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_021810	CAG	2	6	2270364	2270369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_021810	TAA	2	6	2270373	2270378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_021810	AAG	2	6	2270383	2270388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021810	GC	3	6	2272760	2272765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_021810	GAT	2	6	2273093	2273098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021810	CTCG	2	8	2273288	2273295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_021810	TTG	2	6	2273320	2273325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021810	TA	3	6	2275500	2275505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021810	ATG	2	6	2275526	2275531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021810	ACC	2	6	2275577	2275582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_021810	GCTAA	2	10	2275599	2275608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6036	NC_021810	AT	3	6	2276906	2276911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_021810	ATT	2	6	2276969	2276974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_021810	T	6	6	2276976	2276981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_021810	TAT	2	6	2276989	2276994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021810	GCG	2	6	2277027	2277032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_021810	ATT	2	6	2277042	2277047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_021810	TTC	2	6	2277057	2277062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_021810	TTC	2	6	2277103	2277108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_021810	TAA	2	6	2277133	2277138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_021810	ACA	2	6	2277423	2277428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_021810	GTT	2	6	2277431	2277436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_021810	TCT	2	6	2277482	2277487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_021810	TAA	2	6	2277526	2277531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021810	TTC	2	6	2277552	2277557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_021810	TCAA	2	8	2277613	2277620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_021810	GTAA	2	8	2277641	2277648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021810	GGT	2	6	2277663	2277668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021810	TA	3	6	2277693	2277698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021810	TCC	2	6	2278130	2278135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_021810	TG	3	6	2280130	2280135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021810	TGA	2	6	2280195	2280200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_021810	ATT	3	9	2280790	2280798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_021810	GAT	2	6	2280823	2280828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021810	ACAAT	2	10	2281758	2281767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6060	NC_021810	CTG	2	6	2281808	2281813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_021810	ACG	2	6	2281878	2281883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_021810	TAA	2	6	2281887	2281892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021810	TTAAT	2	10	2282624	2282633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021810	CGG	2	6	2282954	2282959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_021810	A	6	6	2283993	2283998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021810	GAG	2	6	2284000	2284005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_021810	ACC	2	6	2286115	2286120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_021810	CG	3	6	2286143	2286148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_021810	ATT	2	6	2286237	2286242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021810	TG	3	6	2286265	2286270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_021810	A	7	7	2290640	2290646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_021810	TAAC	2	8	2290816	2290823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_021810	T	6	6	2292993	2292998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021810	TTC	2	6	2293178	2293183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_021810	A	6	6	2293222	2293227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_021810	CGC	2	6	2293228	2293233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_021810	TCC	2	6	2293241	2293246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_021810	ACA	2	6	2293272	2293277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_021810	T	6	6	2294668	2294673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021810	TCC	2	6	2296131	2296136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_021810	TCC	2	6	2296144	2296149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_021810	TAA	2	6	2296152	2296157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021810	GAT	2	6	2296165	2296170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021810	GGT	2	6	2298053	2298058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_021810	A	6	6	2298077	2298082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_021810	AACGC	2	10	2298753	2298762	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6087	NC_021810	AGGG	2	8	2298772	2298779	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_021810	CAAT	2	8	2298807	2298814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_021810	ATCG	2	8	2298831	2298838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_021810	ATG	2	6	2298856	2298861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_021810	CGG	2	6	2298896	2298901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_021810	ACGC	2	8	2298907	2298914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_021810	GGT	2	6	2300741	2300746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_021810	TTA	2	6	2300797	2300802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021810	TAA	2	6	2301998	2302003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_021810	T	8	8	2305251	2305258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021810	CTC	2	6	2305315	2305320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_021810	AG	3	6	2305731	2305736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_021810	TCA	2	6	2306480	2306485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_021810	AT	3	6	2306515	2306520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_021810	TAT	2	6	2306581	2306586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_021810	GCT	2	6	2306956	2306961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_021810	ATT	2	6	2307034	2307039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021810	T	6	6	2307069	2307074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_021810	T	7	7	2307154	2307160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021810	CAA	2	6	2307373	2307378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_021810	GGC	2	6	2307380	2307385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_021810	CGC	3	9	2307515	2307523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_021810	GCA	2	6	2307527	2307532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_021810	GAC	2	6	2307554	2307559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_021810	T	6	6	2307568	2307573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021810	TAT	2	6	2308527	2308532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_021810	TATC	2	8	2308570	2308577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_021810	CAA	2	6	2308687	2308692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021810	CG	3	6	2308697	2308702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_021810	TGT	2	6	2309374	2309379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021810	ATC	2	6	2309413	2309418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_021810	AGC	2	6	2311010	2311015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_021810	ATT	2	6	2311022	2311027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021810	C	6	6	2311041	2311046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6121	NC_021810	AG	3	6	2311070	2311075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_021810	T	6	6	2311550	2311555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_021810	CGAT	2	8	2312014	2312021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_021810	CCG	2	6	2312024	2312029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_021810	CTTTT	2	10	2312038	2312047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6126	NC_021810	T	7	7	2312044	2312050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_021810	CTG	2	6	2312051	2312056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_021810	GGC	2	6	2313556	2313561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_021810	GCGCC	2	10	2313619	2313628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6130	NC_021810	CT	3	6	2317718	2317723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_021810	GCA	2	6	2317730	2317735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_021810	GTGATA	2	12	2317809	2317820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_021810	GCT	2	6	2317854	2317859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_021810	GCC	2	6	2317908	2317913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_021810	GGC	2	6	2319377	2319382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6136	NC_021810	AAAT	2	8	2323290	2323297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_021810	GGA	2	6	2323309	2323314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_021810	TGC	2	6	2323315	2323320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_021810	ACGAT	2	10	2323342	2323351	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6140	NC_021810	TGCC	2	8	2324133	2324140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6141	NC_021810	T	6	6	2324164	2324169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_021810	CGC	2	6	2326251	2326256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6143	NC_021810	TCC	2	6	2327741	2327746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6144	NC_021810	TCA	2	6	2327789	2327794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6145	NC_021810	TAT	2	6	2327825	2327830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_021810	GCAAC	2	10	2327831	2327840	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6147	NC_021810	GAA	2	6	2327854	2327859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_021810	GTT	2	6	2328355	2328360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6149	NC_021810	CGC	2	6	2328377	2328382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6150	NC_021810	GCA	2	6	2328394	2328399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6152	NC_021810	A	6	6	2329867	2329872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_021810	TCAT	2	8	2329928	2329935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6154	NC_021810	GCT	2	6	2330075	2330080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6156	NC_021810	TTTGC	2	10	2330103	2330112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6158	NC_021810	GC	3	6	2330220	2330225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6159	NC_021810	TCA	2	6	2330247	2330252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6161	NC_021810	TAT	2	6	2330266	2330271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6162	NC_021810	TGA	2	6	2333326	2333331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6164	NC_021810	CCG	2	6	2333346	2333351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6165	NC_021810	CGG	2	6	2333361	2333366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6170	NC_021810	AAATTT	2	12	2338467	2338478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6173	NC_021810	T	6	6	2338566	2338571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6174	NC_021810	TTA	2	6	2338611	2338616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6192	NC_021810	GC	3	6	2343931	2343936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6193	NC_021810	ACTT	2	8	2343946	2343953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6202	NC_021810	TG	3	6	2345471	2345476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6203	NC_021810	GGT	2	6	2345511	2345516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6230	NC_021810	AGA	2	6	2360506	2360511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_021810	GCG	2	6	2360520	2360525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6232	NC_021810	CA	3	6	2360905	2360910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6233	NC_021810	GCGCT	2	10	2362235	2362244	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6241	NC_021810	GGAA	2	8	2364510	2364517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_021810	CCCA	2	8	2364565	2364572	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6243	NC_021810	CTG	2	6	2364599	2364604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6245	NC_021810	TGTTA	2	10	2366356	2366365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_021810	AGGG	2	8	2366827	2366834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_021810	T	6	6	2366842	2366847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_021810	GTA	2	6	2367351	2367356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_021810	A	6	6	2367387	2367392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_021810	CG	3	6	2367988	2367993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6251	NC_021810	TGG	2	6	2368001	2368006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_021810	AAT	2	6	2368026	2368031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_021810	TGCTAT	2	12	2368055	2368066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6254	NC_021810	TTA	2	6	2368103	2368108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_021810	GAG	2	6	2368117	2368122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_021810	TAA	2	6	2368403	2368408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_021810	AACT	2	8	2368841	2368848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6258	NC_021810	A	6	6	2368897	2368902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_021810	TCG	2	6	2368982	2368987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6260	NC_021810	TTGT	2	8	2369013	2369020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_021810	T	6	6	2369039	2369044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_021810	TTAA	2	8	2369110	2369117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6264	NC_021810	A	6	6	2369196	2369201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6388	NC_021810	CCGT	2	8	2443827	2443834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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