MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Serratia liquefaciens ATCC 27592 plasmid

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021742	CAC	2	6	63	68	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021742	GTAC	2	8	88	95	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021742	GTCA	2	8	171	178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021742	GGA	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021742	C	6	6	204	209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_021742	CTC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021742	TCGC	2	8	360	367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021742	TTA	2	6	511	516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021742	TGC	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021742	GA	3	6	656	661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021742	GCA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021742	TGG	2	6	820	825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021742	CCT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021742	AGGC	2	8	863	870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021742	ACC	2	6	955	960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021742	ACC	2	6	990	995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021742	TCA	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021742	TG	3	6	1050	1055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021742	AGG	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021742	CTAC	2	8	1185	1192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021742	GT	3	6	1228	1233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021742	ACG	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021742	GT	3	6	1397	1402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021742	ATG	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021742	TCC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021742	CCA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021742	CAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021742	GAC	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021742	GCA	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021742	TTC	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021742	GCC	2	6	1893	1898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021742	TCC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021742	C	6	6	1957	1962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_021742	TGCG	2	8	2045	2052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021742	GCT	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021742	CTT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021742	CAATG	2	10	2147	2156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021742	AC	3	6	2165	2170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021742	TCC	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021742	CTT	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021742	CA	3	6	2218	2223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021742	CTG	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021742	TCG	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021742	CTA	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021742	AGT	2	6	2471	2476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021742	CCG	2	6	2520	2525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021742	AG	3	6	2536	2541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021742	GCC	2	6	2585	2590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021742	TCA	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021742	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021742	T	7	7	2745	2751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021742	CA	3	6	2789	2794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021742	GCC	2	6	2830	2835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021742	T	6	6	2905	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021742	GTT	2	6	2938	2943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021742	TGC	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021742	TGT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021742	CGA	2	6	3143	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021742	AG	3	6	3205	3210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021742	AG	3	6	3227	3232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021742	TGC	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021742	GCG	2	6	4904	4909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021742	C	6	6	6935	6940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_021742	GT	3	6	7256	7261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021742	T	7	7	7338	7344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021742	C	6	6	7348	7353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_021742	CT	3	6	8027	8032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021742	GTT	2	6	10641	10646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021742	TAA	2	6	10696	10701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021742	TTAC	2	8	10719	10726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021742	T	8	8	11251	11258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021742	CCT	2	6	11265	11270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021742	TCA	2	6	11313	11318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021742	CAGG	2	8	11407	11414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021742	CAT	2	6	11451	11456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021742	CTCC	2	8	11459	11466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_021742	CCCAA	2	10	11488	11497	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021742	GCCG	2	8	17057	17064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021742	GCCG	2	8	17076	17083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021742	CG	3	6	17145	17150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021742	CCTT	2	8	17158	17165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021742	TCA	2	6	17180	17185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021742	CGG	2	6	17245	17250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021742	AAT	2	6	17251	17256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021742	GTGAT	4	20	17749	17768	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021742	T	7	7	17811	17817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021742	CTGC	2	8	17819	17826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021742	GCAG	2	8	17846	17853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021742	C	7	7	17875	17881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_021742	TAAT	2	8	17909	17916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021742	T	7	7	17952	17958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021742	CGC	2	6	18009	18014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021742	CAG	2	6	18044	18049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021742	ATT	2	6	21101	21106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021742	TAG	2	6	21120	21125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021742	A	9	9	21152	21160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021742	GGA	2	6	21169	21174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021742	AAC	2	6	25515	25520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021742	GTCC	2	8	29631	29638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021742	TGC	2	6	29752	29757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021742	AT	3	6	29771	29776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021742	GTC	2	6	29780	29785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021742	AGAA	2	8	29789	29796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021742	GTTA	2	8	29893	29900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021742	AAGA	2	8	30345	30352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021742	AGGA	2	8	31012	31019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021742	CTCAA	2	10	32381	32390	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021742	GCT	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021742	AACC	2	8	33416	33423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021742	CAAAC	2	10	33470	33479	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_021742	GCA	2	6	33497	33502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021742	TGA	2	6	33586	33591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021742	ATG	2	6	33630	33635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021742	GGT	2	6	34887	34892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021742	CAC	2	6	34895	34900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021742	TTG	2	6	34918	34923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021742	CAGAA	2	10	34928	34937	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021742	ATA	2	6	34956	34961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021742	GTG	2	6	34966	34971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021742	CAT	2	6	35076	35081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021742	GAG	2	6	35167	35172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021742	GTT	2	6	35207	35212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021742	CCTTCT	2	12	35255	35266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021742	TGG	3	9	35322	35330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021742	CCA	2	6	35402	35407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021742	ACT	2	6	35415	35420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021742	GAC	2	6	35536	35541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021742	CAA	2	6	35547	35552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021742	A	7	7	35551	35557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021742	TCA	2	6	35639	35644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021742	CAT	2	6	35653	35658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021742	CTTT	2	8	35696	35703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021742	A	6	6	35769	35774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021742	ATT	2	6	35809	35814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021742	CGC	2	6	35827	35832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021742	CAC	2	6	35842	35847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021742	ATT	2	6	35860	35865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021742	AGG	2	6	35892	35897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021742	GC	3	6	36512	36517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021742	GCC	2	6	36542	36547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021742	A	6	6	36565	36570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021742	TAT	2	6	36613	36618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021742	TTA	2	6	37657	37662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021742	ATA	2	6	37663	37668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021742	ATC	2	6	39767	39772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021742	TA	3	6	39813	39818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021742	AATT	2	8	39819	39826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021742	TAA	2	6	39860	39865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021742	TTG	2	6	39891	39896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021742	CCAAT	2	10	39906	39915	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_021742	T	6	6	39951	39956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021742	TTTC	2	8	40057	40064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021742	ACC	2	6	40208	40213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_021742	GCC	2	6	40222	40227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_021742	TC	3	6	40307	40312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_021742	AC	3	6	40388	40393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_021742	GTCTTA	2	12	40407	40418	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_021742	GTG	2	6	40554	40559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021742	ACG	2	6	40641	40646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021742	TGA	2	6	40721	40726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021742	CCG	2	6	40749	40754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_021742	ACC	2	6	40836	40841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_021742	AGCT	2	8	40894	40901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_021742	CTC	2	6	40955	40960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_021742	GAG	2	6	40974	40979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021742	CCA	2	6	40999	41004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_021742	GGT	2	6	41059	41064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021742	CAT	2	6	41254	41259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021742	GCC	2	6	41329	41334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_021742	TTA	2	6	41455	41460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021742	CAGC	2	8	41469	41476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_021742	TC	3	6	41585	41590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_021742	ACC	2	6	41615	41620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_021742	ACT	2	6	41689	41694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_021742	TCA	2	6	41714	41719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_021742	CTAGC	2	10	41797	41806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_021742	C	6	6	41816	41821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
178	NC_021742	CAA	2	6	42057	42062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_021742	CTTT	2	8	42151	42158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_021742	ATG	2	6	42161	42166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021742	GCT	2	6	42167	42172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_021742	GTT	2	6	42257	42262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021742	ACG	2	6	42272	42277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_021742	GT	3	6	42294	42299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021742	TTC	2	6	42314	42319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_021742	TCGGT	2	10	42503	42512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_021742	CAC	2	6	42689	42694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_021742	GTAC	2	8	42714	42721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_021742	GTCA	2	8	42797	42804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_021742	GGA	2	6	42820	42825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021742	C	6	6	42830	42835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
192	NC_021742	CTC	2	6	42975	42980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_021742	TCGC	2	8	42986	42993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
194	NC_021742	TTA	2	6	43137	43142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021742	TGC	2	6	43282	43287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_021742	GA	3	6	43295	43300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
197	NC_021742	ACTG	2	8	43578	43585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
198	NC_021742	TG	3	6	43672	43677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021742	AGG	2	6	43709	43714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_021742	GT	3	6	43850	43855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
202	NC_021742	ACG	2	6	43951	43956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
203	NC_021742	GT	3	6	44019	44024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
204	NC_021742	ATG	2	6	44044	44049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
205	NC_021742	TCC	2	6	44070	44075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.