MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021554	TGAAC	2	10	7003	7012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021554	CTATA	2	10	9756	9765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021554	TCGAT	2	10	23836	23845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021554	TTTCA	2	10	34299	34308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021554	TAAAA	2	10	35752	35761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021554	AGATA	2	10	35910	35919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021554	TTTTC	2	10	38073	38082	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021554	TTGTC	2	10	38109	38118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021554	TAAAA	2	10	38317	38326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021554	AAGTA	2	10	39744	39753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021554	ATGAG	2	10	42553	42562	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021554	TTTAA	2	10	48639	48648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021554	AAAAT	2	10	48731	48740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021554	GAATT	2	10	49934	49943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021554	ATATA	2	10	53486	53495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021554	ATAAA	2	10	62330	62339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021554	CTAGT	2	10	69075	69084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021554	TAATA	2	10	71870	71879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021554	TATAA	2	10	71999	72008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021554	ATTTT	2	10	76043	76052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021554	GTGAG	2	10	80409	80418	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021554	TCAAT	2	10	83351	83360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021554	AAATA	2	10	88113	88122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021554	ACTAA	2	10	92300	92309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021554	AATAA	2	10	92486	92495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021554	ACAGA	2	10	97457	97466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021554	ATAAA	2	10	107837	107846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021554	AATAA	2	10	112770	112779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021554	ATTCA	2	10	113202	113211	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021554	AAAAT	2	10	113938	113947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021554	CTAAT	2	10	114051	114060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021554	CAATT	2	10	115158	115167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021554	ATATA	2	10	119410	119419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021554	GATTG	2	10	124726	124735	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021554	GTAAT	2	10	131556	131565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021554	TAAAA	2	10	135889	135898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021554	TTTTG	2	10	137301	137310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021554	ATTTT	2	10	154767	154776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021554	ATTTT	2	10	188941	188950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021554	AAAGC	2	10	198215	198224	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021554	CGTTT	2	10	199434	199443	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021554	TATCA	2	10	206213	206222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021554	ATCAT	2	10	214346	214355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021554	AAGAT	2	10	219591	219600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021554	ATATA	2	10	226786	226795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021554	CAACT	2	10	226998	227007	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021554	GCTTT	2	10	231510	231519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021554	TGAAG	2	10	231713	231722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021554	AAAAT	2	10	231784	231793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021554	TGATT	2	10	231857	231866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021554	TAACA	2	10	236016	236025	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021554	TTTTC	2	10	237884	237893	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021554	ATGTG	2	10	244316	244325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021554	GCCAT	2	10	255196	255205	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021554	AATAT	2	10	255411	255420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021554	TATTT	2	10	261400	261409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021554	AACAT	2	10	269458	269467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021554	GATAA	2	10	273395	273404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021554	CGCTT	2	10	274831	274840	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021554	ATAAC	2	10	278043	278052	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021554	TGAAT	2	10	278154	278163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021554	ATATT	2	10	280501	280510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021554	TTAAA	2	10	285073	285082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021554	AAAGT	2	10	285684	285693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021554	TAAAA	2	10	287397	287406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021554	AAATT	2	10	288714	288723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021554	TAAAA	2	10	302862	302871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021554	ATAAA	2	10	310771	310780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021554	TCATA	2	10	319207	319216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021554	ATTTA	2	10	334071	334080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021554	GATTT	2	10	349289	349298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021554	GTACA	2	10	362224	362233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021554	TAAAT	2	10	368982	368991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021554	ATTTT	2	10	374539	374548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021554	ATAGA	2	10	380619	380628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021554	TGACA	2	10	380817	380826	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021554	TAATA	2	10	384994	385003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021554	GATAA	2	10	391822	391831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021554	TGATT	2	10	403569	403578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021554	TCTAT	2	10	425552	425561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021554	ATCAT	2	10	425901	425910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021554	AGAAT	2	10	428899	428908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021554	TAAGG	2	10	428963	428972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021554	GAAAT	2	10	430257	430266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021554	ATGGT	2	10	430445	430454	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021554	TAAAT	2	10	436704	436713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021554	ACAGT	2	10	439274	439283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021554	AAATT	2	10	452450	452459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021554	CAATT	2	10	453292	453301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021554	CATAA	2	10	456254	456263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021554	AATCT	2	10	457633	457642	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021554	GAAGT	2	10	462038	462047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021554	TTTAT	2	10	467215	467224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021554	GGATT	2	10	473894	473903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021554	TAAAG	2	10	478200	478209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021554	CTCAC	2	10	480107	480116	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_021554	CAAAG	2	10	480132	480141	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021554	CTTAA	2	10	497821	497830	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021554	AAAAC	2	10	499745	499754	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021554	TGTGG	2	10	515664	515673	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021554	CAACT	2	10	516204	516213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_021554	GGTAA	2	10	516676	516685	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021554	TCGTG	2	10	517495	517504	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021554	GATTG	2	10	519934	519943	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021554	CAAGA	2	10	521757	521766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021554	CAAGA	2	10	522315	522324	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021554	GATTT	2	10	525147	525156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021554	CAAAG	2	10	534113	534122	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021554	TTGAT	2	10	537274	537283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021554	ATGAA	2	10	537345	537354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021554	AGACA	2	10	551234	551243	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021554	AAGTA	2	10	553670	553679	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021554	TTAAA	2	10	555794	555803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021554	GATAA	2	10	555833	555842	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021554	GGTAA	2	10	561362	561371	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021554	TCGTG	2	10	562181	562190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021554	GATTG	2	10	564620	564629	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021554	CAAGA	2	10	566424	566433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021554	ATATA	2	10	571257	571266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021554	AAAAT	2	10	576031	576040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021554	TTTAT	2	10	576140	576149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021554	TTATG	2	10	579146	579155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021554	ATTTA	2	10	579291	579300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021554	ACAAT	2	10	581096	581105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021554	TGAAT	2	10	585564	585573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021554	GTATA	2	10	585621	585630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021554	TATAA	2	10	589338	589347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021554	GAAGC	2	10	611021	611030	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021554	ATTAA	2	10	611970	611979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021554	TAAAA	2	10	615722	615731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021554	AATTT	2	10	618701	618710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021554	ATAAA	2	10	627237	627246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021554	TATAA	2	10	634956	634965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021554	TTATA	2	10	641613	641622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021554	ATGAT	2	10	651057	651066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021554	TAATT	2	10	654544	654553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021554	ATTAT	2	10	660329	660338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021554	AAATT	2	10	666565	666574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021554	TAAAA	2	10	674007	674016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021554	ATTAA	2	10	676195	676204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021554	TTATT	2	10	676244	676253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021554	CAATA	2	10	676310	676319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021554	TTAAT	2	10	678936	678945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021554	ATAAA	2	10	687912	687921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021554	TTTTA	2	10	690178	690187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021554	AAAGG	2	10	690499	690508	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021554	ATATA	2	10	693802	693811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021554	AAACT	2	10	697326	697335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_021554	TTCAC	2	10	702541	702550	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_021554	TTTGT	2	10	706449	706458	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021554	AATGA	2	10	706522	706531	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021554	GGTTG	2	10	713526	713535	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021554	AGTAG	2	10	723243	723252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021554	AAGTT	2	10	723582	723591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021554	AATTG	2	10	723614	723623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021554	AAACT	2	10	725489	725498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_021554	ATTTA	2	10	725879	725888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021554	AATTT	2	10	730735	730744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021554	ATCAT	2	10	737510	737519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_021554	AATTT	2	10	742395	742404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021554	ATTTA	2	10	753378	753387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_021554	GAAAA	2	10	754064	754073	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021554	ATTTT	2	10	765870	765879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021554	TAAGT	2	10	768891	768900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021554	TGGGG	2	10	787547	787556	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021554	TGGGG	2	10	787605	787614	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021554	TGGGG	2	10	787662	787671	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021554	TAATA	2	10	788222	788231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021554	TTCGT	2	10	797075	797084	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_021554	CTTTA	2	10	801271	801280	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_021554	TTTTA	2	10	805015	805024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021554	AGTTA	2	10	805041	805050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_021554	TAAAA	2	10	806549	806558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021554	ATGAT	2	10	810554	810563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021554	GTTAA	2	10	816522	816531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021554	TATAA	2	10	816583	816592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021554	TTTTA	2	10	819382	819391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021554	TTGAA	2	10	819606	819615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_021554	TGATA	2	10	828466	828475	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021554	TTAAA	2	10	833328	833337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_021554	GTATT	2	10	837308	837317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_021554	TATTG	2	10	1012295	1012304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_021554	AAATA	2	10	1058785	1058794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_021554	ATATT	2	10	1135076	1135085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021554	AAAAT	2	10	1135093	1135102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021554	CTAAT	2	10	1135112	1135121	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_021554	GTGTA	2	10	1140471	1140480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021554	TATAT	2	10	1148016	1148025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021554	TAAAA	2	10	1148394	1148403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_021554	AAATG	2	10	1165496	1165505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021554	TAATG	2	10	1169511	1169520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021554	TTTAA	2	10	1169572	1169581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021554	TATAA	2	10	1173702	1173711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_021554	AACAT	2	10	2237157	2237166	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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497	NC_021554	TACTA	2	10	2239311	2239320	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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499	NC_021554	AACAT	2	10	2241329	2241338	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
500	NC_021554	TTATA	2	10	2248924	2248933	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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